Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G123400.1
Synonym Sb01g010850
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S5F2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g49590.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017048
Brachypodium KQK13552
Barley HORVU4Hr1G006490.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G093200 expressed protein -
2 Sobic.007G009900 - -
3 Sobic.004G327900 expressed protein -
4 Sobic.001G520600 DNA topoisomerase 2, putative, expressed -
5 Sobic.009G212900 myosin head family protein, expressed K10357: myosin V
6 Sobic.005G106700 roothairless 1, putative, expressed -
7 Sobic.004G234000 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G145550 - -
9 Sobic.004G200100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G244200 OsFBDUF42 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G106800 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
12 Sobic.010G103400 MBTB10 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
13 Sobic.009G143600 clathrin assembly protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G057200 amino acid transporter, putative, expressed -
15 Sobic.002G408400 beta-amylase, putative, expressed -
16 Sobic.003G384750 - -
17 Sobic.003G370800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K15849: PAT, bifunctional aspartate aminotransferase and glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase
18 Sobic.003G394000 - -
19 Sobic.003G074300 expressed protein -
20 Sobic.001G303300 exostosin family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic001G123400--Sobic010G093200 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic001G123400--Sobic007G009900 Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic001G123400--Sobic004G327900 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic001G123400--Sobic001G520600 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic001G123400--Sobic009G212900 Sobic005G106700 Sobic005G106700 Sobic001G123400--Sobic005G106700 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic001G123400--Sobic004G234000 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic001G123400--Sobic004G145550 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic001G123400--Sobic004G200100 Sobic010G093200--Sobic001G123400 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic010G093200--Sobic001G303300 Sobic010G093200--Sobic005G106700 Sobic010G093200--Sobic004G145550 Sobic010G093200--Sobic001G520600 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic010G093200--Sobic006G244200 Sobic010G093200--Sobic004G327900 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic010G093200--Sobic003G106800 Sobic008G072400 Sobic008G072400 Sobic010G093200--Sobic008G072400 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic007G009900--Sobic010G103400 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic007G009900--Sobic008G104900 Sobic007G009900--Sobic001G123400 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic007G009900--Sobic002G408400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic007G009900--Sobic003G370800 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic009G212900 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic004G200100 Sobic004G327900--Sobic005G106700 Sobic004G327900--Sobic004G234000 Sobic004G327900--Sobic001G123400 Sobic004G327900--Sobic004G200100 Sobic004G327900--Sobic009G212900 Sobic004G327900--Sobic003G106800 Sobic004G327900--Sobic010G093200 Sobic005G014500 Sobic005G014500 Sobic004G327900--Sobic005G014500 Sobic004G327900--Sobic007G009900 Sobic001G520600--Sobic004G145550 Sobic001G520600--Sobic010G093200 Sobic001G520600--Sobic001G123400 Sobic001G520600--Sobic006G244200 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic007G009900 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic001G520600--Sobic003G384750 Sobic001G520600--Sobic008G057200 Sobic001G520600--Sobic010G103400 Sobic009G212900--Sobic003G370800 Sobic009G212900--Sobic007G009900 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic009G212900--Sobic009G143600 Sobic009G212900--Sobic001G123400 Sobic009G212900--Sobic004G200100 Sobic009G212900--Sobic003G106800 Sobic009G212900--Sobic004G327900 Sobic009G212900--Sobic002G408400 Sobic009G212900--Sobic005G106700 Sobic005G106700--Sobic004G327900 Sobic005G106700--Sobic010G093200 Sobic005G106700--Sobic001G123400 Sobic005G106700--Sobic005G014500 Sobic005G106700--Sobic003G106800 Sobic005G106700--Sobic009G212900 Sobic005G106700--Sobic004G234000 Sobic005G106700--Sobic001G303300 Sobic005G106700--Sobic008G072400 Sobic004G234000--Sobic004G200100 Sobic003G074300 Sobic003G074300 Sobic004G234000--Sobic003G074300 Sobic004G234000--Sobic004G327900 Sobic001G156200 Sobic001G156200 Sobic004G234000--Sobic001G156200 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic004G234000--Sobic002G381800 Sobic004G234000--Sobic001G123400 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic004G234000--Sobic004G288000 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic004G234000--Sobic003G394000 Sobic004G234000--Sobic007G009900 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic004G200100--Sobic003G394000 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic004G200100--Sobic009G170900 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic004G200100--Sobic007G136000 Sobic004G200100--Sobic004G234000 Sobic004G200100--Sobic002G381800 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic004G200100--Sobic005G160801 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic004G200100--Sobic010G082300 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G200100--Sobic004G060400 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic004G200100--Sobic004G348000
Octagon: transcription factors


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