Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G103400.1
Synonym BPM2, ATBPM2
Functional annotation MBTB10 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt A0A194YJD0
Pfam PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF178
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06190 : BTB-POZ and MATH domain 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g14060.1 : MBTB10 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G009900 - -
2 Sobic.008G104900 - -
3 Sobic.008G057200 amino acid transporter, putative, expressed -
4 Sobic.005G077600 OsFBO22 - F-box and other domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G408400 beta-amylase, putative, expressed -
6 Sobic.004G355900 oligopeptide transporter, putative, expressed -
7 Sobic.002G255800 expressed protein -
8 Sobic.007G019700 ATCHX, putative, expressed -
9 Sobic.007G057201 - -
10 Sobic.001G486800 AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G180600 pre-rRNA-processing protein TSR2, putative, expressed K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
12 Sobic.003G048300 - -
13 Sobic.003G394000 - -
14 Sobic.002G298900 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
15 Sobic.004G014900 csAtPR5, putative, expressed -
16 Sobic.008G188950 - -
17 Sobic.001G123400 expressed protein -
18 Sobic.003G370800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K15849: PAT, bifunctional aspartate aminotransferase and glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase
19 Sobic.009G049701 - -
20 Sobic.001G179500 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic010G103400--Sobic007G009900 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic010G103400--Sobic008G104900 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic010G103400--Sobic008G057200 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic010G103400--Sobic005G077600 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic010G103400--Sobic002G408400 Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic010G103400--Sobic004G355900 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic010G103400--Sobic002G255800 Sobic007G019700 Sobic007G019700 Sobic010G103400--Sobic007G019700 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic010G103400--Sobic007G057201 Sobic007G009900--Sobic010G103400 Sobic007G009900--Sobic008G104900 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic007G009900--Sobic001G123400 Sobic007G009900--Sobic002G408400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic007G009900--Sobic003G370800 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic001G486800 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic007G009900--Sobic009G212900 Sobic007G009900--Sobic008G057200 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic007G009900--Sobic004G200100 Sobic008G104900--Sobic002G408400 Sobic008G104900--Sobic010G103400 Sobic008G104900--Sobic003G370800 Sobic008G104900--Sobic007G009900 Sobic008G104900--Sobic008G057200 Sobic008G104900--Sobic005G077600 Sobic008G104900--Sobic007G019700 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic008G104900--Sobic003G394000 Sobic001G336450 Sobic001G336450 Sobic008G104900--Sobic001G336450 Sobic008G057200--Sobic010G103400 Sobic008G057200--Sobic002G408400 Sobic008G057200--Sobic008G104900 Sobic008G057200--Sobic007G009900 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic008G057200--Sobic003G384750 Sobic008G057200--Sobic003G370800 Sobic008G057200--Sobic003G394000 Sobic008G057200--Sobic009G212900 Sobic008G057200--Sobic001G123400 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic005G077600--Sobic009G049701 Sobic005G077600--Sobic007G057201 Sobic003G127900 Sobic003G127900 Sobic005G077600--Sobic003G127900 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic005G077600--Sobic003G065700 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic005G077600--Sobic001G129150 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic005G077600--Sobic001G386900 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic005G077600--Sobic002G298201 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic005G077600--Sobic006G232700 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic005G077600--Sobic003G317000 Sobic002G408400--Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic003G370800 Sobic002G408400--Sobic008G057200 Sobic002G408400--Sobic007G009900 Sobic002G408400--Sobic010G103400 Sobic002G408400--Sobic003G384750 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic002G408400--Sobic009G143600 Sobic002G408400--Sobic009G212900 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic002G408400--Sobic006G244200 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic004G355900--Sobic004G136400 Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic004G355900--Sobic008G180600 Sobic004G014900 Sobic004G014900 Sobic004G355900--Sobic004G014900 Sobic004G355900--Sobic007G057201 Sobic004G355900--Sobic009G049701 Sobic004G355900--Sobic002G255800 Sobic004G255100 Sobic004G255100 Sobic004G355900--Sobic004G255100 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic004G355900--Sobic003G254200 Sobic004G355900--Sobic005G077600 Sobic002G255800--Sobic008G180600 Sobic008G188950 Sobic008G188950 Sobic002G255800--Sobic008G188950 Sobic002G255800--Sobic007G057201 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic002G255800--Sobic003G048300 Sobic002G255800--Sobic001G486800 Sobic002G255800--Sobic009G049701 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic002G255800--Sobic003G224800 Sobic008G145500 Sobic008G145500 Sobic002G255800--Sobic008G145500 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic002G255800--Sobic001G024100 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic007G019700--Sobic004G060400 Sobic007G019700--Sobic006G232700 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic007G019700--Sobic010G074000 Sobic007G019700--Sobic003G254200 Sobic007G019700--Sobic002G298201 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G019700--Sobic001G196400 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic007G019700--Sobic005G161400 Sobic007G019700--Sobic003G317000 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic007G019700--Sobic005G147900 Sobic007G057201--Sobic009G049701 Sobic007G057201--Sobic008G145500 Sobic007G057201--Sobic008G180600 Sobic007G057201--Sobic002G255800 Sobic007G057201--Sobic008G188950 Sobic007G057201--Sobic004G136400 Sobic007G057201--Sobic001G024100 Sobic007G057201--Sobic003G317000 Sobic007G102900 Sobic007G102900 Sobic007G057201--Sobic007G102900
Octagon: transcription factors


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