Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G255800.1
Synonym Sb02g029100
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X4N3
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33170 PTHR33170:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G180600 pre-rRNA-processing protein TSR2, putative, expressed K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
2 Sobic.008G188950 - -
3 Sobic.007G057201 - -
4 Sobic.003G048300 - -
5 Sobic.001G486800 AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G049701 - -
7 Sobic.003G224800 DNA methyltransferase protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G145500 - -
9 Sobic.001G024100 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
10 Sobic.002G217800 OsFBLD9 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G136400 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
12 Sobic.003G065700 expressed protein -
13 Sobic.004G014900 csAtPR5, putative, expressed -
14 Sobic.002G295300 expressed protein -
15 Sobic.004G355900 oligopeptide transporter, putative, expressed -
16 Sobic.004G048900 myosin heavy chain, putative, expressed -
17 Sobic.003G254200 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
18 Sobic.005G077600 OsFBO22 - F-box and other domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G127900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase


Gene co-expression network
sample Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic002G255800--Sobic008G180600 Sobic008G188950 Sobic008G188950 Sobic002G255800--Sobic008G188950 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic002G255800--Sobic007G057201 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic002G255800--Sobic003G048300 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic002G255800--Sobic001G486800 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic002G255800--Sobic009G049701 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic002G255800--Sobic003G224800 Sobic008G145500 Sobic008G145500 Sobic002G255800--Sobic008G145500 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic002G255800--Sobic001G024100 Sobic008G180600--Sobic002G255800 Sobic008G180600--Sobic007G057201 Sobic008G180600--Sobic009G049701 Sobic008G180600--Sobic008G188950 Sobic008G180600--Sobic003G048300 Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic008G180600--Sobic004G355900 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic008G180600--Sobic004G136400 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic008G180600--Sobic003G065700 Sobic008G180600--Sobic008G145500 Sobic008G188950--Sobic002G255800 Sobic008G188950--Sobic007G057201 Sobic008G188950--Sobic003G048300 Sobic008G188950--Sobic008G180600 Sobic008G188950--Sobic003G224800 Sobic008G188950--Sobic009G049701 Sobic008G188950--Sobic003G065700 Sobic008G188950--Sobic008G145500 Sobic008G188950--Sobic001G024100 Sobic007G057201--Sobic009G049701 Sobic007G057201--Sobic008G145500 Sobic007G057201--Sobic008G180600 Sobic007G057201--Sobic002G255800 Sobic007G057201--Sobic008G188950 Sobic007G057201--Sobic004G136400 Sobic007G057201--Sobic001G024100 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G057201--Sobic003G317000 Sobic007G102900 Sobic007G102900 Sobic007G057201--Sobic007G102900 Sobic003G048300--Sobic002G255800 Sobic003G048300--Sobic008G188950 Sobic003G048300--Sobic008G180600 Sobic003G048300--Sobic001G486800 Sobic003G048300--Sobic003G224800 Sobic003G048300--Sobic007G057201 Sobic003G048300--Sobic003G065700 Sobic003G048300--Sobic009G049701 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic003G048300--Sobic007G009900 Sobic001G486800--Sobic002G255800 Sobic001G486800--Sobic003G048300 Sobic001G486800--Sobic007G009900 Sobic001G486800--Sobic008G188950 Sobic001G486800--Sobic008G180600 Sobic001G486800--Sobic007G057201 Sobic001G486800--Sobic003G224800 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic001G486800--Sobic010G103400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic001G486800--Sobic003G370800 Sobic009G049701--Sobic007G057201 Sobic009G049701--Sobic003G065700 Sobic009G049701--Sobic008G145500 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic009G049701--Sobic005G078000 Sobic009G049701--Sobic004G136400 Sobic009G049701--Sobic008G180600 Sobic009G049701--Sobic001G024100 Sobic009G049701--Sobic003G317000 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic009G049701--Sobic005G077600 Sobic003G224800--Sobic008G188950 Sobic003G224800--Sobic002G255800 Sobic002G217800 Sobic002G217800 Sobic003G224800--Sobic002G217800 Sobic003G224800--Sobic008G180600 Sobic003G224800--Sobic007G057201 Sobic003G224800--Sobic003G048300 Sobic003G224800--Sobic001G024100 Sobic003G224800--Sobic004G136400 Sobic003G224800--Sobic003G065700 Sobic008G145500--Sobic007G102900 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic008G145500--Sobic001G386900 Sobic008G145500--Sobic003G317000 Sobic002G295300 Sobic002G295300 Sobic008G145500--Sobic002G295300 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic008G145500--Sobic009G062600 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic008G145500--Sobic003G305500 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic008G145500--Sobic001G435300 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic008G145500--Sobic003G208900 Sobic001G002400 Sobic001G002400 Sobic008G145500--Sobic001G002400 Sobic001G024100--Sobic002G295300 Sobic001G024100--Sobic008G145500 Sobic001G024100--Sobic001G386900 Sobic001G024100--Sobic001G435300 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic001G024100--Sobic002G070100 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic001G024100--Sobic005G058600 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic001G024100--Sobic002G402900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic001G024100--Sobic008G169101 Sobic001G024100--Sobic007G102900
Octagon: transcription factors


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