Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G355900.1
Synonym ATOPT1, OPT1, Sb04g038240
Functional annotation oligopeptide transporter, putative, expressed
UniProt C5XWQ2
Pfam PF03169
Panther DB PTHR22601 PTHR22601:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26590 : oligopeptide transporter 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g23130.3 : oligopeptide transporter, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004972 , Zm00025a050234 , Zm00025a032712
Brachypodium KQJ98781 , PNT68339 , KQK13178 , PNT74131 , KQK13179 , PNT74132 , KQJ96062
Barley HORVU5Hr1G024150.3 , HORVU5Hr1G024150.2 , HORVU5Hr1G024150.1 , HORVU5Hr1G024150.5 , HORVU5Hr1G024150.4
Wheat TraesCS5B02G097700 , TraesCS5D02G104100 , TraesCS5A02G091900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G355900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic004G355900--Sobic004G136400 Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic004G355900--Sobic008G180600 Sobic004G014900 Sobic004G014900 Sobic004G355900--Sobic004G014900 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic004G355900--Sobic007G057201 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic004G355900--Sobic009G049701 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic004G355900--Sobic002G255800 Sobic004G255100 Sobic004G255100 Sobic004G355900--Sobic004G255100 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic004G355900--Sobic003G254200 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic004G355900--Sobic005G077600 Sobic004G136400--Sobic004G355900 Sobic004G136400--Sobic004G014900 Sobic004G136400--Sobic003G254200 Sobic004G136400--Sobic004G255100 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic004G136400--Sobic008G052800 Sobic001G003400 Sobic001G003400 Sobic004G136400--Sobic001G003400 Sobic004G136400--Sobic007G057201 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic004G136400--Sobic010G187800 Sobic004G123100 Sobic004G123100 Sobic004G136400--Sobic004G123100 Sobic008G180600--Sobic002G255800 Sobic008G180600--Sobic007G057201 Sobic008G180600--Sobic009G049701 Sobic008G188950 Sobic008G188950 Sobic008G180600--Sobic008G188950 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic008G180600--Sobic003G048300 Sobic008G180600--Sobic004G355900 Sobic008G180600--Sobic004G136400 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic008G180600--Sobic003G065700 Sobic008G145500 Sobic008G145500 Sobic008G180600--Sobic008G145500 Sobic004G014900--Sobic001G003400 Sobic004G014900--Sobic003G254200 Sobic004G014900--Sobic004G136400 Sobic004G048900 Sobic004G048900 Sobic004G014900--Sobic004G048900 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic004G014900--Sobic010G074000 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic004G014900--Sobic004G288000 Sobic004G014900--Sobic004G255100 Sobic004G014900--Sobic010G187800 Sobic001G103500 Sobic001G103500 Sobic004G014900--Sobic001G103500 Sobic007G057201--Sobic009G049701 Sobic007G057201--Sobic008G145500 Sobic007G057201--Sobic008G180600 Sobic007G057201--Sobic002G255800 Sobic007G057201--Sobic008G188950 Sobic007G057201--Sobic004G136400 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic007G057201--Sobic001G024100 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G057201--Sobic003G317000 Sobic007G102900 Sobic007G102900 Sobic007G057201--Sobic007G102900 Sobic009G049701--Sobic007G057201 Sobic009G049701--Sobic003G065700 Sobic009G049701--Sobic008G145500 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic009G049701--Sobic005G078000 Sobic009G049701--Sobic004G136400 Sobic009G049701--Sobic008G180600 Sobic009G049701--Sobic001G024100 Sobic009G049701--Sobic003G317000 Sobic009G049701--Sobic005G077600 Sobic002G255800--Sobic008G180600 Sobic002G255800--Sobic008G188950 Sobic002G255800--Sobic007G057201 Sobic002G255800--Sobic003G048300 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic002G255800--Sobic001G486800 Sobic002G255800--Sobic009G049701 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic002G255800--Sobic003G224800 Sobic002G255800--Sobic008G145500 Sobic002G255800--Sobic001G024100 Sobic004G255100--Sobic003G254200 Sobic004G255100--Sobic001G003400 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic004G255100--Sobic009G249400 Sobic004G255100--Sobic010G074000 Sobic004G255100--Sobic004G048900 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic004G255100--Sobic010G261900 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic004G255100--Sobic004G031900 Sobic004G255100--Sobic010G187800 Sobic004G255100--Sobic004G136400 Sobic003G254200--Sobic010G074000 Sobic003G254200--Sobic009G249400 Sobic003G254200--Sobic004G048900 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic003G254200--Sobic007G185801 Sobic003G254200--Sobic008G052800 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic003G254200--Sobic003G208900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic003G254200--Sobic006G232700 Sobic003G254200--Sobic010G187800 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic003G254200--Sobic010G030500 Sobic005G077600--Sobic009G049701 Sobic005G077600--Sobic007G057201 Sobic003G127900 Sobic003G127900 Sobic005G077600--Sobic003G127900 Sobic005G077600--Sobic003G065700 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic005G077600--Sobic001G129150 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic005G077600--Sobic001G386900 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic005G077600--Sobic002G298201 Sobic005G077600--Sobic006G232700 Sobic005G077600--Sobic003G317000
Octagon: transcription factors


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