Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G014900.1,Sobic.004G014900.2
Synonym Sb04g001440
Functional annotation csAtPR5, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKE5 , C5XSD9
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34602.1,LOC_Os01g66230.2 : csAtPR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G003400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G254200 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
3 Sobic.004G136400 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
4 Sobic.004G048900 myosin heavy chain, putative, expressed -
5 Sobic.010G074000 expressed protein -
6 Sobic.004G288000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G255100 nitrate-induced NOI protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G187800 expressed protein -
9 Sobic.001G103500 gp176, putative, expressed -
10 Sobic.009G249400 protein kinase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G031900 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
12 Sobic.008G052800 - -
13 Sobic.002G295300 expressed protein -
14 Sobic.003G127900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G279600 ZOS2-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
16 Sobic.010G261900 methyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.001G024100 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
18 Sobic.001G513400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
19 Sobic.003G066300 expressed protein -
20 Sobic.008G145500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G014900 Sobic004G014900 Sobic001G003400 Sobic001G003400 Sobic004G014900--Sobic001G003400 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic004G014900--Sobic003G254200 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic004G014900--Sobic004G136400 Sobic004G048900 Sobic004G048900 Sobic004G014900--Sobic004G048900 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic004G014900--Sobic010G074000 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic004G014900--Sobic004G288000 Sobic004G255100 Sobic004G255100 Sobic004G014900--Sobic004G255100 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic004G014900--Sobic010G187800 Sobic001G103500 Sobic001G103500 Sobic004G014900--Sobic001G103500 Sobic001G003400--Sobic004G255100 Sobic001G003400--Sobic004G014900 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic001G003400--Sobic010G261900 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic001G003400--Sobic004G334900 Sobic004G123100 Sobic004G123100 Sobic001G003400--Sobic004G123100 Sobic010G063700 Sobic010G063700 Sobic001G003400--Sobic010G063700 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic001G003400--Sobic001G513400 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic001G003400--Sobic004G031900 Sobic001G003400--Sobic010G187800 Sobic003G254200--Sobic010G074000 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic003G254200--Sobic009G249400 Sobic003G254200--Sobic004G048900 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic003G254200--Sobic007G185801 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic003G254200--Sobic008G052800 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic003G254200--Sobic003G208900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic003G254200--Sobic006G232700 Sobic003G254200--Sobic010G187800 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic003G254200--Sobic010G030500 Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic004G136400--Sobic004G355900 Sobic004G136400--Sobic004G014900 Sobic004G136400--Sobic003G254200 Sobic004G136400--Sobic004G255100 Sobic004G136400--Sobic008G052800 Sobic004G136400--Sobic001G003400 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic004G136400--Sobic007G057201 Sobic004G136400--Sobic010G187800 Sobic004G136400--Sobic004G123100 Sobic004G048900--Sobic009G249400 Sobic004G048900--Sobic003G254200 Sobic004G048900--Sobic010G074000 Sobic004G048900--Sobic004G031900 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic004G048900--Sobic009G176200 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic004G048900--Sobic009G072600 Sobic004G048900--Sobic003G208900 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic004G048900--Sobic010G157900 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic004G048900--Sobic005G192000 Sobic010G074000--Sobic003G254200 Sobic010G074000--Sobic009G249400 Sobic010G074000--Sobic007G185801 Sobic010G074000--Sobic003G208900 Sobic010G074000--Sobic006G232700 Sobic010G074000--Sobic010G187800 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic010G074000--Sobic005G147900 Sobic010G074000--Sobic008G052800 Sobic010G074000--Sobic010G030500 Sobic004G288000--Sobic004G031900 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G288000--Sobic004G060400 Sobic004G288000--Sobic009G249400 Sobic004G288000--Sobic010G187800 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic004G288000--Sobic008G191900 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic004G288000--Sobic002G359100 Sobic004G288000--Sobic009G176200 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic004G288000--Sobic003G066300 Sobic004G288000--Sobic010G074000 Sobic004G255100--Sobic003G254200 Sobic004G255100--Sobic001G003400 Sobic004G255100--Sobic009G249400 Sobic004G255100--Sobic010G074000 Sobic004G255100--Sobic004G048900 Sobic004G255100--Sobic010G261900 Sobic004G255100--Sobic004G031900 Sobic004G255100--Sobic010G187800 Sobic004G255100--Sobic004G136400 Sobic004G185000 Sobic004G185000 Sobic010G187800--Sobic004G185000 Sobic010G187800--Sobic001G513400 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic010G187800--Sobic001G380000 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic010G187800--Sobic002G405300 Sobic010G187800--Sobic009G176200 Sobic010G187800--Sobic004G123100 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic010G187800--Sobic003G233800 Sobic010G187800--Sobic009G249400 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic010G187800--Sobic001G036200 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic001G103500--Sobic008G168932 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic001G103500--Sobic005G185750 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic001G103500--Sobic005G068500 Sobic001G103500--Sobic004G334900 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic001G103500--Sobic004G289900 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic001G103500--Sobic008G181900 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic001G103500--Sobic006G044800 Sobic001G103500--Sobic001G513400 Sobic003G191400 Sobic003G191400 Sobic001G103500--Sobic003G191400
Octagon: transcription factors


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