Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G295300.1
Synonym Sb02g032660
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QE28
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g38650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014555
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
2 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
3 Sobic.002G070100 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G031200 - -
6 Sobic.003G191200 expressed protein -
7 Sobic.002G402900 expressed protein -
8 Sobic.008G169101 - -
9 Sobic.004G100300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G133201 - -
11 Sobic.001G538425 - -
12 Sobic.007G204200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
13 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G082100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.003G070400 expressed protein -
17 Sobic.002G204500 Phospholipase D alpha 2 PLD Alpha 2 (At)(PubMedID : 27208977)@phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
18 Sobic.001G024100 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
19 Sobic.007G081100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.009G182100 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G295300 Sobic002G295300 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic002G295300--Sobic001G386900 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic002G295300--Sobic005G058600 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic002G295300--Sobic002G070100 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic002G295300--Sobic001G435300 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic002G295300--Sobic007G031200 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G295300--Sobic003G191200 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic002G295300--Sobic002G402900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic002G295300--Sobic008G169101 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic002G295300--Sobic004G100300 Sobic001G386900--Sobic002G070100 Sobic001G386900--Sobic001G435300 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic001G386900--Sobic004G050900 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic001G386900--Sobic009G182100 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic001G386900--Sobic005G000900 Sobic001G386900--Sobic007G031200 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic001G386900--Sobic002G156400 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic001G386900--Sobic002G384900 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic001G386900--Sobic006G017700 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic002G070100--Sobic006G017700 Sobic002G070100--Sobic002G384900 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic002G070100--Sobic002G182701 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic002G070100--Sobic006G017900 Sobic002G070100--Sobic005G000900 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic002G070100--Sobic001G211700 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic002G070100--Sobic005G140900 Sobic002G070100--Sobic002G156400 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic002G070100--Sobic008G138400 Sobic001G435300--Sobic008G169101 Sobic001G435300--Sobic002G402900 Sobic001G435300--Sobic005G058600 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic001G435300--Sobic004G042800 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic001G435300--Sobic001G392650 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic001G435300--Sobic009G110700 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic001G435300--Sobic002G049700 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic001G435300--Sobic001G366700 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic001G435300--Sobic005G191300 Sobic007G031200--Sobic003G191200 Sobic007G031200--Sobic004G100300 Sobic007G031200--Sobic002G182701 Sobic007G031200--Sobic005G000900 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic007G031200--Sobic007G082100 Sobic007G031200--Sobic009G182100 Sobic007G031200--Sobic006G017900 Sobic007G031200--Sobic001G211700 Sobic007G031200--Sobic006G017700 Sobic003G191200--Sobic007G082100 Sobic003G191200--Sobic007G031200 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic003G191200--Sobic004G046700 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic003G191200--Sobic010G123800 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic003G191200--Sobic007G081800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic003G191200--Sobic005G058300 Sobic003G191200--Sobic006G017900 Sobic003G191200--Sobic004G100300 Sobic003G191200--Sobic001G211700 Sobic002G402900--Sobic008G169101 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G435300 Sobic002G402900--Sobic005G191300 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G402900--Sobic007G042800 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic002G402900--Sobic001G525600 Sobic002G402900--Sobic005G058600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic002G223650 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic002G402900--Sobic007G197000 Sobic008G169101--Sobic005G191300 Sobic008G169101--Sobic002G402900 Sobic008G169101--Sobic007G042800 Sobic008G169101--Sobic001G525600 Sobic008G169101--Sobic007G197000 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic009G110700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic008G169101--Sobic003G420500 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic008G169101--Sobic005G037700 Sobic004G100300--Sobic002G384900 Sobic004G100300--Sobic002G182701 Sobic004G100300--Sobic006G017900 Sobic004G100300--Sobic005G000900 Sobic004G100300--Sobic006G017700 Sobic004G100300--Sobic007G031200 Sobic004G100300--Sobic001G211700 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic004G100300--Sobic005G221675 Sobic004G100300--Sobic002G156400
Octagon: transcription factors


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