Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G127900.1
Synonym ENODL5, Sb03g010830, AtENODL5
Functional annotation plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XH61
Pfam PF02298
Panther DB PTHR33021 PTHR33021:SF66
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009055; electron transfer activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18590 : early nodulin-like protein 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g16610.1 : plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024075 , Zm00025a031995 , Zm00025a024191
Brachypodium KQK03857
Barley HORVU3Hr1G038480.1
Wheat TraesCS3D02G190700 , TraesCS3A02G186900 , TraesCS3B02G216300
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G295300 expressed protein -
2 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
3 Sobic.007G112832 - -
4 Sobic.001G538425 - -
5 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
6 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
7 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
8 Sobic.003G428500 expressed protein -
9 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -
10 Sobic.005G058200 expressed protein -
11 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -
12 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G058000 expressed protein -
14 Sobic.010G064200 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
15 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
16 Sobic.001G364300 - -
17 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.002G015200 OsFBO11 - F-box and other domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G086900 - -
20 Sobic.008G177001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G127900 Sobic003G127900 Sobic002G295300 Sobic002G295300 Sobic003G127900--Sobic002G295300 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic003G127900--Sobic001G386900 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic003G127900--Sobic007G112832 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic003G127900--Sobic001G538425 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic003G127900--Sobic010G196700 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic003G127900--Sobic004G003300 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic003G127900--Sobic008G168500 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic003G127900--Sobic003G428500 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic003G127900--Sobic008G088500 Sobic002G295300--Sobic001G386900 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic002G295300--Sobic005G058600 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic002G295300--Sobic002G070100 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic002G295300--Sobic001G435300 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic002G295300--Sobic007G031200 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G295300--Sobic003G191200 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic002G295300--Sobic002G402900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic002G295300--Sobic008G169101 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic002G295300--Sobic004G100300 Sobic001G386900--Sobic002G070100 Sobic001G386900--Sobic001G435300 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic001G386900--Sobic004G050900 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic001G386900--Sobic009G182100 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic001G386900--Sobic005G000900 Sobic001G386900--Sobic007G031200 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic001G386900--Sobic002G156400 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic001G386900--Sobic002G384900 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic001G386900--Sobic006G017700 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic007G112832--Sobic007G209900 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G112832--Sobic001G196400 Sobic007G112832--Sobic001G386900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic007G112832--Sobic006G232700 Sobic007G112832--Sobic001G435300 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic007G112832--Sobic005G077001 Sobic007G112832--Sobic005G058600 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G112832--Sobic003G317000 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic007G112832--Sobic003G133201 Sobic001G538425--Sobic007G031200 Sobic001G538425--Sobic003G191200 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic001G538425--Sobic007G198900 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic001G538425--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic001G538425--Sobic007G082100 Sobic001G538425--Sobic005G058600 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic001G538425--Sobic002G204500 Sobic001G538425--Sobic004G100300 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic001G538425--Sobic003G070400 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic010G196700--Sobic005G058200 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic010G196700--Sobic007G082300 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic010G196700--Sobic004G086900 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic010G196700--Sobic001G364300 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic010G196700--Sobic007G110800 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic010G196700--Sobic005G007200 Sobic010G196700--Sobic008G088500 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic010G196700--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic010G196700--Sobic007G167950 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic004G003300--Sobic001G021200 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic004G003300--Sobic004G002700 Sobic004G003300--Sobic003G428500 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic004G003300--Sobic010G202400 Sobic004G003300--Sobic008G088500 Sobic004G003300--Sobic008G168500 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic004G003300--Sobic005G058000 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic004G003300--Sobic002G096600 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic004G003300--Sobic008G095500 Sobic008G168500--Sobic008G088500 Sobic008G168500--Sobic002G096600 Sobic008G168500--Sobic005G058000 Sobic008G168500--Sobic001G364300 Sobic008G168500--Sobic005G058200 Sobic008G168500--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic001G021200 Sobic008G168500--Sobic008G095500 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic008G168500--Sobic008G177001 Sobic003G428500--Sobic001G021200 Sobic003G428500--Sobic008G168500 Sobic003G428500--Sobic008G088500 Sobic003G428500--Sobic002G096600 Sobic003G428500--Sobic005G058000 Sobic003G428500--Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic005G007200 Sobic003G428500--Sobic005G058200 Sobic003G428500--Sobic004G003300 Sobic008G088500--Sobic008G168500 Sobic008G088500--Sobic001G364300 Sobic008G088500--Sobic002G096600 Sobic008G088500--Sobic005G058000 Sobic008G088500--Sobic005G058200 Sobic008G088500--Sobic005G007200 Sobic008G088500--Sobic001G021200 Sobic008G088500--Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G177001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.