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Transcriptome id Sobic.008G052800.1
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UniProt C5YSN8
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G500900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.010G166600 amino acid transporter, putative, expressed -
3 Sobic.002G304300 integral membrane protein DUF6 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.009G089200 NAD dependent epimerase/dehydratase family domain containing protein, expressed K12450: UDP-glucose 4,6-dehydratase
6 Sobic.009G227500 aspartyl protease family protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G045400 polygalacturonase, putative, expressed -
8 Sobic.002G405300 START domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G405800 CBS domain containing membrane protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G173400 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
11 Sobic.007G185801 - -
12 Sobic.010G271600 exo70 exocyst complex subunit family protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G400400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
14 Sobic.004G187400 SKP1-like protein 1B, putative, expressed K03094: SKP1, S-phase kinase-associated protein 1
15 Sobic.009G253700 phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G270800 EF hand family protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G287200 OsSub26 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
18 Sobic.003G114900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G183400 - -
20 Sobic.009G098400 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor


Gene co-expression network
sample Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic001G500900 Sobic001G500900 Sobic008G052800--Sobic001G500900 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic008G052800--Sobic010G166600 Sobic002G304300 Sobic002G304300 Sobic008G052800--Sobic002G304300 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic008G052800--Sobic005G065300 Sobic009G089200 Sobic009G089200 Sobic008G052800--Sobic009G089200 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic008G052800--Sobic009G227500 Sobic001G045400 Sobic001G045400 Sobic008G052800--Sobic001G045400 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic008G052800--Sobic002G405300 Sobic003G405800 Sobic003G405800 Sobic008G052800--Sobic003G405800 Sobic001G511100 Sobic001G511100 Sobic001G500900--Sobic001G511100 Sobic001G500900--Sobic002G304300 Sobic003G114900 Sobic003G114900 Sobic001G500900--Sobic003G114900 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic001G500900--Sobic006G270800 Sobic003G197500 Sobic003G197500 Sobic001G500900--Sobic003G197500 Sobic002G427500 Sobic002G427500 Sobic001G500900--Sobic002G427500 Sobic008G043400 Sobic008G043400 Sobic001G500900--Sobic008G043400 Sobic003G009600 Sobic003G009600 Sobic001G500900--Sobic003G009600 Sobic006G127800 Sobic006G127800 Sobic001G500900--Sobic006G127800 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic010G166600--Sobic002G157900 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic010G166600--Sobic001G332200 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic010G166600--Sobic006G136700 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic010G166600--Sobic009G090400 Sobic002G417401 Sobic002G417401 Sobic010G166600--Sobic002G417401 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic010G166600--Sobic001G024300 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic010G166600--Sobic007G222200 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic010G166600--Sobic009G116100 Sobic010G166600--Sobic009G089200 Sobic002G304300--Sobic006G270800 Sobic002G304300--Sobic003G009600 Sobic002G304300--Sobic002G427500 Sobic002G304300--Sobic001G511100 Sobic002G304300--Sobic006G127800 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic002G304300--Sobic005G214700 Sobic009G089000 Sobic009G089000 Sobic002G304300--Sobic009G089000 Sobic002G304300--Sobic003G114900 Sobic002G304300--Sobic001G024300 Sobic005G065300--Sobic009G089200 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic005G065300--Sobic007G103000 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G065300--Sobic007G134260 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G065300--Sobic008G102850 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic005G065300--Sobic003G114800 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic005G065300--Sobic004G091000 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic005G065300--Sobic005G122100 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G065300--Sobic003G147700 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic005G065300--Sobic003G232100 Sobic009G089200--Sobic005G065300 Sobic009G089200--Sobic007G134260 Sobic009G089200--Sobic007G103000 Sobic009G089200--Sobic003G114800 Sobic009G089200--Sobic003G232100 Sobic009G089200--Sobic004G091000 Sobic009G089200--Sobic005G122100 Sobic009G089200--Sobic003G147700 Sobic009G089200--Sobic006G270800 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic009G227500--Sobic001G400400 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic009G227500--Sobic010G034200 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic009G227500--Sobic007G061800 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic009G227500--Sobic002G395100 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic009G227500--Sobic008G075800 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic009G227500--Sobic001G222800 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic009G227500--Sobic006G234400 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic009G227500--Sobic010G177600 Sobic006G219700 Sobic006G219700 Sobic009G227500--Sobic006G219700 Sobic003G183400 Sobic003G183400 Sobic001G045400--Sobic003G183400 Sobic001G045400--Sobic003G232100 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic001G045400--Sobic005G031700 Sobic001G045400--Sobic003G405800 Sobic001G479700 Sobic001G479700 Sobic001G045400--Sobic001G479700 Sobic001G045400--Sobic006G270800 Sobic001G045400--Sobic002G427500 Sobic001G045400--Sobic003G114900 Sobic001G045400--Sobic001G511100 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic002G405300--Sobic004G331500 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic002G405300--Sobic004G287200 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic002G405300--Sobic001G036200 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic002G405300--Sobic010G254100 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic002G405300--Sobic004G336401 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic002G405300--Sobic009G166000 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic002G405300--Sobic009G165900 Sobic002G405300--Sobic008G075800 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic002G405300--Sobic010G034300 Sobic010G230200 Sobic010G230200 Sobic003G405800--Sobic010G230200 Sobic003G405800--Sobic001G511100 Sobic003G405800--Sobic005G031700 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic003G405800--Sobic006G022700 Sobic003G027300 Sobic003G027300 Sobic003G405800--Sobic003G027300 Sobic003G405800--Sobic008G043400 Sobic003G405800--Sobic001G479700 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic003G405800--Sobic006G176200 Sobic004G318300 Sobic004G318300 Sobic003G405800--Sobic004G318300
Octagon: transcription factors


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