Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G180600.2
Synonym Sb08g022300
Functional annotation pre-rRNA-processing protein TSR2, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R7F1
Pfam PF10273
Panther DB PTHR21250 PTHR21250:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14800; pre-rRNA-processing protein TSR2
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G27990 : Pre-rRNA-processing protein TSR2, conserved region
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g39820.1 : pre-rRNA-processing protein TSR2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.007G102900 - -
20 Sobic.003G317000 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic008G180600--Sobic002G255800 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic008G180600--Sobic007G057201 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic008G180600--Sobic009G049701 Sobic008G188950 Sobic008G188950 Sobic008G180600--Sobic008G188950 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic008G180600--Sobic003G048300 Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic008G180600--Sobic004G355900 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic008G180600--Sobic004G136400 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic008G180600--Sobic003G065700 Sobic008G145500 Sobic008G145500 Sobic008G180600--Sobic008G145500 Sobic002G255800--Sobic008G180600 Sobic002G255800--Sobic008G188950 Sobic002G255800--Sobic007G057201 Sobic002G255800--Sobic003G048300 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic002G255800--Sobic001G486800 Sobic002G255800--Sobic009G049701 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic002G255800--Sobic003G224800 Sobic002G255800--Sobic008G145500 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic002G255800--Sobic001G024100 Sobic007G057201--Sobic009G049701 Sobic007G057201--Sobic008G145500 Sobic007G057201--Sobic008G180600 Sobic007G057201--Sobic002G255800 Sobic007G057201--Sobic008G188950 Sobic007G057201--Sobic004G136400 Sobic007G057201--Sobic001G024100 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G057201--Sobic003G317000 Sobic007G102900 Sobic007G102900 Sobic007G057201--Sobic007G102900 Sobic009G049701--Sobic007G057201 Sobic009G049701--Sobic003G065700 Sobic009G049701--Sobic008G145500 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic009G049701--Sobic005G078000 Sobic009G049701--Sobic004G136400 Sobic009G049701--Sobic008G180600 Sobic009G049701--Sobic001G024100 Sobic009G049701--Sobic003G317000 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic009G049701--Sobic005G077600 Sobic008G188950--Sobic002G255800 Sobic008G188950--Sobic007G057201 Sobic008G188950--Sobic003G048300 Sobic008G188950--Sobic008G180600 Sobic008G188950--Sobic003G224800 Sobic008G188950--Sobic009G049701 Sobic008G188950--Sobic003G065700 Sobic008G188950--Sobic008G145500 Sobic008G188950--Sobic001G024100 Sobic003G048300--Sobic002G255800 Sobic003G048300--Sobic008G188950 Sobic003G048300--Sobic008G180600 Sobic003G048300--Sobic001G486800 Sobic003G048300--Sobic003G224800 Sobic003G048300--Sobic007G057201 Sobic003G048300--Sobic003G065700 Sobic003G048300--Sobic009G049701 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic003G048300--Sobic007G009900 Sobic004G355900--Sobic004G136400 Sobic004G355900--Sobic008G180600 Sobic004G014900 Sobic004G014900 Sobic004G355900--Sobic004G014900 Sobic004G355900--Sobic007G057201 Sobic004G355900--Sobic009G049701 Sobic004G355900--Sobic002G255800 Sobic004G255100 Sobic004G255100 Sobic004G355900--Sobic004G255100 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic004G355900--Sobic003G254200 Sobic004G355900--Sobic005G077600 Sobic004G136400--Sobic004G355900 Sobic004G136400--Sobic004G014900 Sobic004G136400--Sobic003G254200 Sobic004G136400--Sobic004G255100 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic004G136400--Sobic008G052800 Sobic001G003400 Sobic001G003400 Sobic004G136400--Sobic001G003400 Sobic004G136400--Sobic007G057201 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic004G136400--Sobic010G187800 Sobic004G123100 Sobic004G123100 Sobic004G136400--Sobic004G123100 Sobic003G065700--Sobic009G049701 Sobic003G065700--Sobic001G024100 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic003G065700--Sobic004G020200 Sobic003G127900 Sobic003G127900 Sobic003G065700--Sobic003G127900 Sobic002G295300 Sobic002G295300 Sobic003G065700--Sobic002G295300 Sobic010G232300 Sobic010G232300 Sobic003G065700--Sobic010G232300 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic003G065700--Sobic001G136000 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic003G065700--Sobic008G029800 Sobic003G065700--Sobic005G077600 Sobic008G145500--Sobic007G102900 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic008G145500--Sobic001G386900 Sobic008G145500--Sobic003G317000 Sobic008G145500--Sobic002G295300 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic008G145500--Sobic009G062600 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic008G145500--Sobic003G305500 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic008G145500--Sobic001G435300 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic008G145500--Sobic003G208900 Sobic001G002400 Sobic001G002400 Sobic008G145500--Sobic001G002400
Octagon: transcription factors


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