Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G102900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PGX7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G250160 - -
2 Sobic.009G177750 - -
3 Sobic.004G049300 transporter family protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G081701 - K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.006G164800 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
6 Sobic.001G197050 - -
7 Sobic.003G305500 expressed protein -
8 Sobic.009G062600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
9 Sobic.002G066600 - -
10 Sobic.001G002400 OsSub55 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
11 Sobic.005G204600 OsMADS68 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -
12 Sobic.004G217200 Lung seven transmembrane receptor domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G164400 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
14 Sobic.004G062300 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G005300 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
16 Sobic.004G255900 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
17 Sobic.008G053750 - -
18 Sobic.002G000200 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
19 Sobic.005G006300 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G320000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G102900 Sobic007G102900 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic007G102900--Sobic003G250160 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic007G102900--Sobic009G177750 Sobic004G049300 Sobic004G049300 Sobic007G102900--Sobic004G049300 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic007G102900--Sobic007G081701 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic007G102900--Sobic006G164800 Sobic001G197050 Sobic001G197050 Sobic007G102900--Sobic001G197050 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic007G102900--Sobic003G305500 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic007G102900--Sobic009G062600 Sobic002G066600 Sobic002G066600 Sobic007G102900--Sobic002G066600 Sobic003G250160--Sobic007G081701 Sobic003G250160--Sobic009G177750 Sobic003G250160--Sobic001G197050 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic003G250160--Sobic006G276801 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic003G250160--Sobic001G467400 Sobic004G255900 Sobic004G255900 Sobic003G250160--Sobic004G255900 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic003G250160--Sobic005G112500 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic003G250160--Sobic002G223650 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G250160--Sobic004G258000 Sobic009G177750--Sobic003G250160 Sobic009G177750--Sobic007G081701 Sobic009G177750--Sobic001G197050 Sobic009G177750--Sobic006G276801 Sobic009G177750--Sobic001G467400 Sobic009G177750--Sobic004G255900 Sobic009G177750--Sobic005G112500 Sobic003G320000 Sobic003G320000 Sobic009G177750--Sobic003G320000 Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic009G177750--Sobic002G000200 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic004G049300--Sobic004G217200 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic004G049300--Sobic005G204500 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic004G049300--Sobic006G195000 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic004G049300--Sobic005G006300 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic004G049300--Sobic006G142200 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic004G049300--Sobic003G394801 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic004G049300--Sobic009G016900 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic004G049300--Sobic005G110120 Sobic002G303500 Sobic002G303500 Sobic004G049300--Sobic002G303500 Sobic007G081701--Sobic003G250160 Sobic007G081701--Sobic009G177750 Sobic007G081701--Sobic006G276801 Sobic007G081701--Sobic001G197050 Sobic007G081701--Sobic005G112500 Sobic007G081701--Sobic001G467400 Sobic007G081701--Sobic004G258000 Sobic007G081701--Sobic004G255900 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic007G081701--Sobic002G011300 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic006G164800--Sobic004G062300 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic006G164800--Sobic007G001800 Sobic006G164800--Sobic004G217200 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic006G164800--Sobic004G293300 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic006G164800--Sobic001G409000 Sobic006G164800--Sobic003G394801 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic006G164800--Sobic007G167000 Sobic003G175600 Sobic003G175600 Sobic006G164800--Sobic003G175600 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic006G164800--Sobic002G053800 Sobic001G197050--Sobic007G081701 Sobic001G197050--Sobic003G250160 Sobic001G197050--Sobic009G177750 Sobic001G197050--Sobic003G320000 Sobic001G197050--Sobic004G255900 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic001G197050--Sobic005G204600 Sobic001G197050--Sobic002G011300 Sobic008G053750 Sobic008G053750 Sobic001G197050--Sobic008G053750 Sobic001G197050--Sobic005G112500 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic003G305500--Sobic003G343000 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic003G305500--Sobic003G208900 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic003G305500--Sobic003G343300 Sobic006G059100 Sobic006G059100 Sobic003G305500--Sobic006G059100 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic003G305500--Sobic008G134600 Sobic003G305500--Sobic009G062600 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G305500--Sobic008G124301 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic003G305500--Sobic003G445600 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic003G305500--Sobic006G062100 Sobic009G062600--Sobic002G066600 Sobic001G002400 Sobic001G002400 Sobic009G062600--Sobic001G002400 Sobic009G062600--Sobic004G049300 Sobic009G062600--Sobic002G303500 Sobic009G062600--Sobic006G164800 Sobic009G062600--Sobic003G305500 Sobic009G062600--Sobic003G445600 Sobic009G062600--Sobic004G062300 Sobic004G134600 Sobic004G134600 Sobic009G062600--Sobic004G134600 Sobic002G066600--Sobic004G049300 Sobic008G028000 Sobic008G028000 Sobic002G066600--Sobic008G028000 Sobic008G027900 Sobic008G027900 Sobic002G066600--Sobic008G027900 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic002G066600--Sobic010G006900 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic002G066600--Sobic005G023700 Sobic006G263500 Sobic006G263500 Sobic002G066600--Sobic006G263500 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic002G066600--Sobic006G159000 Sobic009G091600 Sobic009G091600 Sobic002G066600--Sobic009G091600 Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic002G066600--Sobic005G025600
Octagon: transcription factors


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