Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G000200.1
Synonym ATCNGC18, CNGC18
Functional annotation cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed
UniProt A0A1B6QGK6
Pfam PF00520
Panther DB PTHR10217 PTHR10217:SF479
NCBI CDD -
KEGG Orthology K05391; cyclic nucleotide gated channel, plant
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006811ion transport GO:0005216ion channel activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G14870 : cyclic nucleotide-gated channel 18
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06570.1 : cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016274
Brachypodium PNT73377
Barley HORVU4Hr1G018960.3 , HORVU4Hr1G018960.8 , HORVU4Hr1G018960.9 , HORVU4Hr1G018960.2 , HORVU4Hr1G018960.4 , HORVU4Hr1G018960.5 , HORVU4Hr1G018960.6 , HORVU4Hr1G018960.7
Wheat TraesCS4D02G091700 , TraesCS4A02G216700 , TraesCS4B02G094900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G142400 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic003G164400 Sobic003G164400 Sobic002G000200--Sobic003G164400 Sobic005G026700 Sobic005G026700 Sobic002G000200--Sobic005G026700 Sobic008G053750 Sobic008G053750 Sobic002G000200--Sobic008G053750 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic002G000200--Sobic005G204500 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic002G000200--Sobic005G006300 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic002G000200--Sobic006G195000 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic002G000200--Sobic004G217200 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic002G000200--Sobic006G142200 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic002G000200--Sobic003G394801 Sobic003G164400--Sobic005G026700 Sobic003G164400--Sobic006G142200 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic003G164400--Sobic002G414150 Sobic003G164400--Sobic004G217200 Sobic003G164400--Sobic005G006300 Sobic005G009500 Sobic005G009500 Sobic003G164400--Sobic005G009500 Sobic001G269400 Sobic001G269400 Sobic003G164400--Sobic001G269400 Sobic003G164400--Sobic005G204500 Sobic009G097000 Sobic009G097000 Sobic003G164400--Sobic009G097000 Sobic005G026700--Sobic003G164400 Sobic005G002100 Sobic005G002100 Sobic005G026700--Sobic005G002100 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic005G026700--Sobic001G094700 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic008G053750--Sobic009G075400 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic008G053750--Sobic008G043300 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic008G053750--Sobic004G293300 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic008G053750--Sobic006G159000 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic008G053750--Sobic001G306400 Sobic001G288400 Sobic001G288400 Sobic008G053750--Sobic001G288400 Sobic001G024900 Sobic001G024900 Sobic008G053750--Sobic001G024900 Sobic002G066300 Sobic002G066300 Sobic008G053750--Sobic002G066300 Sobic001G269800 Sobic001G269800 Sobic008G053750--Sobic001G269800 Sobic005G204500--Sobic006G142200 Sobic005G204500--Sobic005G006300 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic005G204500--Sobic009G169500 Sobic005G204500--Sobic006G195000 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic005G204500--Sobic001G306200 Sobic005G204500--Sobic003G394801 Sobic005G204500--Sobic005G009500 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic005G204500--Sobic005G110120 Sobic010G162700 Sobic010G162700 Sobic005G204500--Sobic010G162700 Sobic005G006300--Sobic006G142200 Sobic005G006300--Sobic002G414150 Sobic005G006300--Sobic005G009500 Sobic005G006300--Sobic005G204500 Sobic005G006300--Sobic003G394801 Sobic005G006300--Sobic009G169500 Sobic005G006300--Sobic001G306200 Sobic005G006300--Sobic001G269400 Sobic005G006300--Sobic005G110120 Sobic006G195000--Sobic010G162700 Sobic006G236300 Sobic006G236300 Sobic006G195000--Sobic006G236300 Sobic007G112400 Sobic007G112400 Sobic006G195000--Sobic007G112400 Sobic006G195000--Sobic005G204500 Sobic006G195000--Sobic009G169500 Sobic006G195000--Sobic001G306200 Sobic006G195000--Sobic005G110120 Sobic006G195000--Sobic006G142200 Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic006G195000--Sobic005G142400 Sobic004G217200--Sobic005G006300 Sobic004G217200--Sobic002G414150 Sobic004G217200--Sobic006G142200 Sobic004G217200--Sobic003G394801 Sobic004G217200--Sobic001G269400 Sobic004G217200--Sobic005G009500 Sobic004G217200--Sobic005G204500 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic004G217200--Sobic001G269600 Sobic001G269700 Sobic001G269700 Sobic004G217200--Sobic001G269700 Sobic006G142200--Sobic005G006300 Sobic006G142200--Sobic005G009500 Sobic006G142200--Sobic005G204500 Sobic006G142200--Sobic002G414150 Sobic006G142200--Sobic009G169500 Sobic006G142200--Sobic003G394801 Sobic006G142200--Sobic001G306200 Sobic006G142200--Sobic006G195000 Sobic006G142200--Sobic001G269400 Sobic003G394801--Sobic001G306200 Sobic003G394801--Sobic009G169500 Sobic003G394801--Sobic005G006300 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic005G204500 Sobic003G394801--Sobic005G142400 Sobic003G394801--Sobic002G414150 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic006G142200
Octagon: transcription factors


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