Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G486800.1
Synonym
Functional annotation AP2 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QQ74
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31241 PTHR31241:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57600 : Integrase-type DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g07830.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053203 , Zm00025a053313 , Zm00025a000875 , Zm00025a043959 , Zm00025a030489 , Zm00025a005513
Brachypodium KQK23365 , PNT78049
Barley HORVU4Hr1G075810.1 , HORVU4Hr1G075810.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic001G486800--Sobic002G255800 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic001G486800--Sobic003G048300 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic001G486800--Sobic007G009900 Sobic008G188950 Sobic008G188950 Sobic001G486800--Sobic008G188950 Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic001G486800--Sobic008G180600 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic001G486800--Sobic007G057201 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic001G486800--Sobic003G224800 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic001G486800--Sobic010G103400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic001G486800--Sobic003G370800 Sobic002G255800--Sobic008G180600 Sobic002G255800--Sobic008G188950 Sobic002G255800--Sobic007G057201 Sobic002G255800--Sobic003G048300 Sobic002G255800--Sobic001G486800 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic002G255800--Sobic009G049701 Sobic002G255800--Sobic003G224800 Sobic008G145500 Sobic008G145500 Sobic002G255800--Sobic008G145500 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic002G255800--Sobic001G024100 Sobic003G048300--Sobic002G255800 Sobic003G048300--Sobic008G188950 Sobic003G048300--Sobic008G180600 Sobic003G048300--Sobic001G486800 Sobic003G048300--Sobic003G224800 Sobic003G048300--Sobic007G057201 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic003G048300--Sobic003G065700 Sobic003G048300--Sobic009G049701 Sobic003G048300--Sobic007G009900 Sobic007G009900--Sobic010G103400 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic007G009900--Sobic008G104900 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic007G009900--Sobic001G123400 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic007G009900--Sobic002G408400 Sobic007G009900--Sobic003G370800 Sobic007G009900--Sobic001G486800 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic007G009900--Sobic009G212900 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic008G057200 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic007G009900--Sobic004G200100 Sobic008G188950--Sobic002G255800 Sobic008G188950--Sobic007G057201 Sobic008G188950--Sobic003G048300 Sobic008G188950--Sobic008G180600 Sobic008G188950--Sobic003G224800 Sobic008G188950--Sobic009G049701 Sobic008G188950--Sobic003G065700 Sobic008G188950--Sobic008G145500 Sobic008G188950--Sobic001G024100 Sobic008G180600--Sobic002G255800 Sobic008G180600--Sobic007G057201 Sobic008G180600--Sobic009G049701 Sobic008G180600--Sobic008G188950 Sobic008G180600--Sobic003G048300 Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic008G180600--Sobic004G355900 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic008G180600--Sobic004G136400 Sobic008G180600--Sobic003G065700 Sobic008G180600--Sobic008G145500 Sobic007G057201--Sobic009G049701 Sobic007G057201--Sobic008G145500 Sobic007G057201--Sobic008G180600 Sobic007G057201--Sobic002G255800 Sobic007G057201--Sobic008G188950 Sobic007G057201--Sobic004G136400 Sobic007G057201--Sobic001G024100 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G057201--Sobic003G317000 Sobic007G102900 Sobic007G102900 Sobic007G057201--Sobic007G102900 Sobic003G224800--Sobic008G188950 Sobic003G224800--Sobic002G255800 Sobic002G217800 Sobic002G217800 Sobic003G224800--Sobic002G217800 Sobic003G224800--Sobic008G180600 Sobic003G224800--Sobic007G057201 Sobic003G224800--Sobic003G048300 Sobic003G224800--Sobic001G024100 Sobic003G224800--Sobic004G136400 Sobic003G224800--Sobic003G065700 Sobic010G103400--Sobic007G009900 Sobic010G103400--Sobic008G104900 Sobic010G103400--Sobic008G057200 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic010G103400--Sobic005G077600 Sobic010G103400--Sobic002G408400 Sobic010G103400--Sobic004G355900 Sobic010G103400--Sobic002G255800 Sobic007G019700 Sobic007G019700 Sobic010G103400--Sobic007G019700 Sobic010G103400--Sobic007G057201 Sobic003G370800--Sobic002G408400 Sobic003G370800--Sobic008G104900 Sobic003G370800--Sobic009G212900 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic003G370800--Sobic009G143600 Sobic003G370800--Sobic007G009900 Sobic003G370800--Sobic004G200100 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic003G370800--Sobic003G394000 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic003G370800--Sobic003G384750 Sobic003G370800--Sobic001G486800
Octagon: transcription factors


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