Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G104900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCT4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G408400 beta-amylase, putative, expressed -
2 Sobic.010G103400 MBTB10 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
3 Sobic.003G370800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K15849: PAT, bifunctional aspartate aminotransferase and glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase
4 Sobic.007G009900 - -
5 Sobic.008G057200 amino acid transporter, putative, expressed -
6 Sobic.005G077600 OsFBO22 - F-box and other domain containing protein, expressed -
7 Sobic.007G019700 ATCHX, putative, expressed -
8 Sobic.003G394000 - -
9 Sobic.001G336450 - -
10 Sobic.001G486800 AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G027901 - K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.003G254200 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
13 Sobic.004G355900 oligopeptide transporter, putative, expressed -
14 Sobic.003G384750 - -
15 Sobic.005G161400 - -
16 Sobic.010G074000 expressed protein -
17 Sobic.002G255800 expressed protein -
18 Sobic.004G255100 nitrate-induced NOI protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G057201 - -
20 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic008G104900--Sobic002G408400 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic008G104900--Sobic010G103400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic008G104900--Sobic003G370800 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic008G104900--Sobic007G009900 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic008G104900--Sobic008G057200 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic008G104900--Sobic005G077600 Sobic007G019700 Sobic007G019700 Sobic008G104900--Sobic007G019700 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic008G104900--Sobic003G394000 Sobic001G336450 Sobic001G336450 Sobic008G104900--Sobic001G336450 Sobic002G408400--Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic003G370800 Sobic002G408400--Sobic008G057200 Sobic002G408400--Sobic007G009900 Sobic002G408400--Sobic010G103400 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic002G408400--Sobic003G384750 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic002G408400--Sobic009G143600 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic002G408400--Sobic009G212900 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic002G408400--Sobic006G244200 Sobic010G103400--Sobic007G009900 Sobic010G103400--Sobic008G104900 Sobic010G103400--Sobic008G057200 Sobic010G103400--Sobic005G077600 Sobic010G103400--Sobic002G408400 Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic010G103400--Sobic004G355900 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic010G103400--Sobic002G255800 Sobic010G103400--Sobic007G019700 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic010G103400--Sobic007G057201 Sobic003G370800--Sobic002G408400 Sobic003G370800--Sobic008G104900 Sobic003G370800--Sobic009G212900 Sobic003G370800--Sobic009G143600 Sobic003G370800--Sobic007G009900 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic003G370800--Sobic004G200100 Sobic003G370800--Sobic003G394000 Sobic003G370800--Sobic003G384750 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic003G370800--Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic010G103400 Sobic007G009900--Sobic008G104900 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic007G009900--Sobic001G123400 Sobic007G009900--Sobic002G408400 Sobic007G009900--Sobic003G370800 Sobic007G009900--Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic009G212900 Sobic007G009900--Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic004G200100 Sobic008G057200--Sobic010G103400 Sobic008G057200--Sobic002G408400 Sobic008G057200--Sobic008G104900 Sobic008G057200--Sobic007G009900 Sobic008G057200--Sobic003G384750 Sobic008G057200--Sobic003G370800 Sobic008G057200--Sobic003G394000 Sobic008G057200--Sobic009G212900 Sobic008G057200--Sobic001G123400 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic005G077600--Sobic009G049701 Sobic005G077600--Sobic007G057201 Sobic003G127900 Sobic003G127900 Sobic005G077600--Sobic003G127900 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic005G077600--Sobic003G065700 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic005G077600--Sobic001G129150 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic005G077600--Sobic001G386900 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic005G077600--Sobic002G298201 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic005G077600--Sobic006G232700 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic005G077600--Sobic003G317000 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic007G019700--Sobic004G060400 Sobic007G019700--Sobic006G232700 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic007G019700--Sobic010G074000 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic007G019700--Sobic003G254200 Sobic007G019700--Sobic002G298201 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G019700--Sobic001G196400 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic007G019700--Sobic005G161400 Sobic007G019700--Sobic003G317000 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic007G019700--Sobic005G147900 Sobic003G394000--Sobic004G200100 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic003G394000--Sobic003G406060 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic003G394000--Sobic005G200100 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic003G394000--Sobic001G251000 Sobic003G394000--Sobic010G074000 Sobic003G394000--Sobic004G060400 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic003G394000--Sobic002G027901 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic003G394000--Sobic004G348000 Sobic003G394000--Sobic003G254200 Sobic001G336450--Sobic008G104900 Sobic001G336450--Sobic002G027901 Sobic001G336450--Sobic002G408400 Sobic001G336450--Sobic003G370800 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic001G336450--Sobic008G164000 Sobic001G336450--Sobic005G161400 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic001G336450--Sobic006G230000 Sobic001G336450--Sobic003G384750 Sobic001G179500 Sobic001G179500 Sobic001G336450--Sobic001G179500
Octagon: transcription factors


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