Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G336450.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8Z7
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G104900 - -
2 Sobic.002G027901 - K10523: speckle-type POZ protein
3 Sobic.002G408400 beta-amylase, putative, expressed -
4 Sobic.003G370800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K15849: PAT, bifunctional aspartate aminotransferase and glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase
5 Sobic.008G164000 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G161400 - -
7 Sobic.006G230000 - -
8 Sobic.003G384750 - -
9 Sobic.001G179500 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G129150 - -
11 Sobic.003G394000 - -
12 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
13 Sobic.008G057200 amino acid transporter, putative, expressed -
14 Sobic.010G086100 SKIP/SNW domain containing protein, expressed K06063: SNW1, SKIIP, SNW domain-containing protein 1
15 Sobic.001G370200 - -
16 Sobic.008G091785 - -
17 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
18 Sobic.003G078000 - -
19 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
20 Sobic.003G232500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G336450 Sobic001G336450 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic001G336450--Sobic008G104900 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic001G336450--Sobic002G027901 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic001G336450--Sobic002G408400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic001G336450--Sobic003G370800 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic001G336450--Sobic008G164000 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic001G336450--Sobic005G161400 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic001G336450--Sobic006G230000 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic001G336450--Sobic003G384750 Sobic001G179500 Sobic001G179500 Sobic001G336450--Sobic001G179500 Sobic008G104900--Sobic002G408400 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic008G104900--Sobic010G103400 Sobic008G104900--Sobic003G370800 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic008G104900--Sobic007G009900 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic008G104900--Sobic008G057200 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic008G104900--Sobic005G077600 Sobic007G019700 Sobic007G019700 Sobic008G104900--Sobic007G019700 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic008G104900--Sobic003G394000 Sobic008G104900--Sobic001G336450 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic002G027901--Sobic010G074000 Sobic002G027901--Sobic005G161400 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic002G027901--Sobic006G232700 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic002G027901--Sobic003G254200 Sobic009G246600 Sobic009G246600 Sobic002G027901--Sobic009G246600 Sobic003G211000 Sobic003G211000 Sobic002G027901--Sobic003G211000 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic002G027901--Sobic010G030500 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic002G027901--Sobic005G199800 Sobic002G027901--Sobic003G394000 Sobic002G408400--Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic003G370800 Sobic002G408400--Sobic008G057200 Sobic002G408400--Sobic007G009900 Sobic002G408400--Sobic010G103400 Sobic002G408400--Sobic003G384750 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic002G408400--Sobic009G143600 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic002G408400--Sobic009G212900 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic002G408400--Sobic006G244200 Sobic003G370800--Sobic002G408400 Sobic003G370800--Sobic008G104900 Sobic003G370800--Sobic009G212900 Sobic003G370800--Sobic009G143600 Sobic003G370800--Sobic007G009900 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic003G370800--Sobic004G200100 Sobic003G370800--Sobic003G394000 Sobic003G370800--Sobic003G384750 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic003G370800--Sobic001G486800 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic008G164000--Sobic005G191200 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic008G164000--Sobic002G106700 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic008G164000--Sobic003G406060 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic008G164000--Sobic008G091785 Sobic008G164000--Sobic006G230000 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic008G164000--Sobic007G007400 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic008G164000--Sobic001G144150 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic008G164000--Sobic001G135650 SobicK028900 SobicK028900 Sobic008G164000--SobicK028900 Sobic002G261400 Sobic002G261400 Sobic005G161400--Sobic002G261400 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic005G161400--Sobic005G147900 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic005G161400--Sobic001G129150 Sobic005G161400--Sobic006G232700 Sobic006G016800 Sobic006G016800 Sobic005G161400--Sobic006G016800 Sobic001G136150 Sobic001G136150 Sobic005G161400--Sobic001G136150 Sobic002G034200 Sobic002G034200 Sobic005G161400--Sobic002G034200 Sobic005G161400--Sobic010G074000 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic005G161400--Sobic002G298201 Sobic006G230000--Sobic002G106700 Sobic006G230000--Sobic008G091785 Sobic006G230000--Sobic007G007400 Sobic006G230000--Sobic008G164000 Sobic006G230000--Sobic005G191200 Sobic006G230000--Sobic003G406060 Sobic006G230000--Sobic001G135650 Sobic006G230000--SobicK028900 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic006G230000--Sobic003G078000 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic001G179500--Sobic001G129150 Sobic005G049900 Sobic005G049900 Sobic001G179500--Sobic005G049900 Sobic001G179500--Sobic005G161400 Sobic006G042900 Sobic006G042900 Sobic001G179500--Sobic006G042900 Sobic001G179500--Sobic002G298201 Sobic001G179500--Sobic005G147900 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G179500--Sobic009G125100 Sobic001G179500--Sobic002G027901 Sobic001G179500--Sobic006G232700
Octagon: transcription factors


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