Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G129150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S5F8
Pfam PF01583
Panther DB PTHR11055 PTHR11055:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding GO:0004020adenylylsulfate kinase activity GO:0000103sulfate assimilation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03900 : adenosine-5\'-phosphosulfate (APS) kinase 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41650.1 : adenylyl-sulfate kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G147900 - -
2 Sobic.005G161400 - -
3 Sobic.002G261400 Os9bglu31 - beta-glucosidase, dhurrinase, similar to G. max hydroxyisourate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
4 Sobic.006G016800 OsSigP3 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed -
5 Sobic.005G049900 - -
6 Sobic.001G370200 - -
7 Sobic.001G136150 - K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
8 Sobic.010G074000 expressed protein -
9 Sobic.006G042900 FAR1 family protein, expressed -
10 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
11 Sobic.002G298201 - K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
12 Sobic.002G034200 - -
13 Sobic.007G185801 - -
14 Sobic.010G030500 - -
15 Sobic.008G052800 - -
16 Sobic.003G254200 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
17 Sobic.003G317000 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
18 Sobic.001G196400 transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, putative, expressed -
19 Sobic.009G246600 - -
20 Sobic.006G238500 coatomer subunit epsilon, putative, expressed K17268: coatomer subunit epsilon


Gene co-expression network
sample Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic001G129150--Sobic005G147900 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic001G129150--Sobic005G161400 Sobic002G261400 Sobic002G261400 Sobic001G129150--Sobic002G261400 Sobic006G016800 Sobic006G016800 Sobic001G129150--Sobic006G016800 Sobic005G049900 Sobic005G049900 Sobic001G129150--Sobic005G049900 Sobic001G370200 Sobic001G370200 Sobic001G129150--Sobic001G370200 Sobic001G136150 Sobic001G136150 Sobic001G129150--Sobic001G136150 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic001G129150--Sobic010G074000 Sobic006G042900 Sobic006G042900 Sobic001G129150--Sobic006G042900 Sobic005G147900--Sobic002G261400 Sobic005G147900--Sobic006G016800 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic005G147900--Sobic007G185801 Sobic002G034200 Sobic002G034200 Sobic005G147900--Sobic002G034200 Sobic005G147900--Sobic005G049900 Sobic005G147900--Sobic001G136150 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic005G147900--Sobic003G343000 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic005G147900--Sobic010G030500 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic005G147900--Sobic003G317000 Sobic005G161400--Sobic002G261400 Sobic005G161400--Sobic005G147900 Sobic005G161400--Sobic001G129150 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic005G161400--Sobic006G232700 Sobic005G161400--Sobic006G016800 Sobic005G161400--Sobic001G136150 Sobic005G161400--Sobic002G034200 Sobic005G161400--Sobic010G074000 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic005G161400--Sobic002G298201 Sobic002G261400--Sobic005G147900 Sobic002G261400--Sobic002G034200 Sobic002G261400--Sobic006G016800 Sobic002G261400--Sobic001G136150 Sobic002G261400--Sobic007G185801 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic002G261400--Sobic002G223650 Sobic002G261400--Sobic003G343000 Sobic002G261400--Sobic003G317000 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic002G261400--Sobic006G276801 Sobic006G016800--Sobic005G147900 Sobic006G016800--Sobic001G136150 Sobic006G016800--Sobic002G261400 Sobic006G016800--Sobic002G034200 Sobic006G016800--Sobic007G185801 Sobic006G238500 Sobic006G238500 Sobic006G016800--Sobic006G238500 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic006G016800--Sobic003G313200 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic006G016800--Sobic001G366700 Sobic006G016800--Sobic003G343000 Sobic005G049900--Sobic002G298201 Sobic005G049900--Sobic005G147900 Sobic005G049900--Sobic002G034200 Sobic005G049900--Sobic003G317000 Sobic005G049900--Sobic001G136150 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic005G049900--Sobic001G196400 Sobic005G049900--Sobic006G238500 Sobic005G049900--Sobic002G261400 Sobic005G049900--Sobic006G016800 Sobic001G370200--Sobic010G030500 Sobic001G370200--Sobic005G147900 Sobic001G370200--Sobic001G129150 Sobic001G370200--Sobic006G016800 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic001G370200--Sobic008G052800 Sobic001G370200--Sobic005G049900 Sobic001G370200--Sobic006G232700 Sobic001G370200--Sobic002G261400 Sobic001G370200--Sobic007G185801 Sobic001G136150--Sobic002G034200 Sobic001G136150--Sobic006G238500 Sobic001G136150--Sobic006G016800 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic001G136150--Sobic005G204600 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic001G136150--Sobic004G062300 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic001G136150--Sobic006G164800 Sobic001G197050 Sobic001G197050 Sobic001G136150--Sobic001G197050 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic001G136150--Sobic007G081701 Sobic009G086600 Sobic009G086600 Sobic001G136150--Sobic009G086600 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic010G074000--Sobic003G254200 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic010G074000--Sobic009G249400 Sobic010G074000--Sobic007G185801 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic010G074000--Sobic003G208900 Sobic010G074000--Sobic006G232700 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic010G074000--Sobic010G187800 Sobic010G074000--Sobic005G147900 Sobic010G074000--Sobic008G052800 Sobic010G074000--Sobic010G030500 Sobic006G042900--Sobic010G187800 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic006G042900--Sobic001G513400 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic006G042900--Sobic001G380000 Sobic006G042900--Sobic008G052800 Sobic006G042900--Sobic005G147900 Sobic007G096900 Sobic007G096900 Sobic006G042900--Sobic007G096900 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic006G042900--Sobic003G233800 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic006G042900--Sobic004G289900 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic006G042900--Sobic004G334900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.