Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G370200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QN55
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G030500 - -
2 Sobic.005G147900 - -
3 Sobic.001G129150 - -
4 Sobic.006G016800 OsSigP3 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed -
5 Sobic.008G052800 - -
6 Sobic.005G049900 - -
7 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
8 Sobic.002G261400 Os9bglu31 - beta-glucosidase, dhurrinase, similar to G. max hydroxyisourate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
9 Sobic.007G185801 - -
10 Sobic.005G039000 bifunctional monodehydroascorbate reductase and carbonic anhydrasenectarin-3 precursor, putative, expressed K01674: carbonic anhydrase
11 Sobic.002G034200 - -
12 Sobic.010G074000 expressed protein -
13 Sobic.001G155100 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
14 Sobic.010G166600 amino acid transporter, putative, expressed -
15 Sobic.001G045400 polygalacturonase, putative, expressed -
16 Sobic.003G317000 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
17 Sobic.003G208900 Sad1 / UNC-like C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G220150 - -
19 Sobic.001G136150 - K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
20 Sobic.001G037066 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G370200 Sobic001G370200 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic001G370200--Sobic010G030500 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic001G370200--Sobic005G147900 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic001G370200--Sobic001G129150 Sobic006G016800 Sobic006G016800 Sobic001G370200--Sobic006G016800 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic001G370200--Sobic008G052800 Sobic005G049900 Sobic005G049900 Sobic001G370200--Sobic005G049900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic001G370200--Sobic006G232700 Sobic002G261400 Sobic002G261400 Sobic001G370200--Sobic002G261400 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic001G370200--Sobic007G185801 Sobic010G030500--Sobic006G232700 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic010G030500--Sobic003G208900 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic010G030500--Sobic005G039000 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic010G030500--Sobic001G196400 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic010G030500--Sobic003G305500 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic010G030500--Sobic003G317000 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic010G030500--Sobic001G155100 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic010G030500--Sobic004G168150 Sobic010G030500--Sobic007G185801 Sobic005G147900--Sobic002G261400 Sobic005G147900--Sobic006G016800 Sobic005G147900--Sobic007G185801 Sobic002G034200 Sobic002G034200 Sobic005G147900--Sobic002G034200 Sobic005G147900--Sobic005G049900 Sobic001G136150 Sobic001G136150 Sobic005G147900--Sobic001G136150 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic005G147900--Sobic003G343000 Sobic005G147900--Sobic010G030500 Sobic005G147900--Sobic003G317000 Sobic001G129150--Sobic005G147900 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic001G129150--Sobic005G161400 Sobic001G129150--Sobic002G261400 Sobic001G129150--Sobic006G016800 Sobic001G129150--Sobic005G049900 Sobic001G129150--Sobic001G370200 Sobic001G129150--Sobic001G136150 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic001G129150--Sobic010G074000 Sobic006G042900 Sobic006G042900 Sobic001G129150--Sobic006G042900 Sobic006G016800--Sobic005G147900 Sobic006G016800--Sobic001G136150 Sobic006G016800--Sobic002G261400 Sobic006G016800--Sobic002G034200 Sobic006G016800--Sobic007G185801 Sobic006G238500 Sobic006G238500 Sobic006G016800--Sobic006G238500 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic006G016800--Sobic003G313200 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic006G016800--Sobic001G366700 Sobic006G016800--Sobic003G343000 Sobic001G500900 Sobic001G500900 Sobic008G052800--Sobic001G500900 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic008G052800--Sobic010G166600 Sobic002G304300 Sobic002G304300 Sobic008G052800--Sobic002G304300 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic008G052800--Sobic005G065300 Sobic009G089200 Sobic009G089200 Sobic008G052800--Sobic009G089200 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic008G052800--Sobic009G227500 Sobic001G045400 Sobic001G045400 Sobic008G052800--Sobic001G045400 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic008G052800--Sobic002G405300 Sobic003G405800 Sobic003G405800 Sobic008G052800--Sobic003G405800 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic005G049900--Sobic002G298201 Sobic005G049900--Sobic005G147900 Sobic005G049900--Sobic002G034200 Sobic005G049900--Sobic003G317000 Sobic005G049900--Sobic001G136150 Sobic005G049900--Sobic001G196400 Sobic005G049900--Sobic006G238500 Sobic005G049900--Sobic002G261400 Sobic005G049900--Sobic006G016800 Sobic006G232700--Sobic001G196400 Sobic006G232700--Sobic003G317000 Sobic006G232700--Sobic010G030500 Sobic006G232700--Sobic003G208900 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic006G232700--Sobic004G042800 Sobic006G232700--Sobic003G305500 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic006G232700--Sobic001G435300 Sobic006G232700--Sobic010G074000 Sobic006G232700--Sobic002G298201 Sobic002G261400--Sobic005G147900 Sobic002G261400--Sobic002G034200 Sobic002G261400--Sobic006G016800 Sobic002G261400--Sobic001G136150 Sobic002G261400--Sobic007G185801 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic002G261400--Sobic002G223650 Sobic002G261400--Sobic003G343000 Sobic002G261400--Sobic003G317000 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic002G261400--Sobic006G276801 Sobic007G185801--Sobic003G343000 Sobic007G185801--Sobic003G208900 Sobic007G185801--Sobic003G305500 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic007G185801--Sobic007G139300 Sobic007G185801--Sobic005G039000 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic007G185801--Sobic006G176200 Sobic006G059100 Sobic006G059100 Sobic007G185801--Sobic006G059100 Sobic009G259600 Sobic009G259600 Sobic007G185801--Sobic009G259600 Sobic001G473700 Sobic001G473700 Sobic007G185801--Sobic001G473700
Octagon: transcription factors


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