Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G327900.1,Sobic.004G327900.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RQ21 , A0A194YTT9
Pfam -
Panther DB PTHR33494
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G24100 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08740.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042415 , Zm00025a032952
Brachypodium KQK19230 , KQK19231 , PNT76322
Barley HORVU3Hr1G034290.4 , HORVU3Hr1G034290.3 , HORVU3Hr1G034290.2 , HORVU3Hr1G034290.1 , HORVU7Hr1G031130.1 , HORVU7Hr1G031130.3 , HORVU7Hr1G031130.2 , HORVU7Hr1G031130.4
Wheat TraesCS7D02G153200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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9 Sobic.007G009900 - -
10 Sobic.001G005400 - -
11 Sobic.009G170900 ATCHX15, putative, expressed -
12 Sobic.003G074300 expressed protein -
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14 Sobic.005G160801 - -
15 Sobic.004G093000 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G252850 - -
17 Sobic.003G386350 - -
18 Sobic.009G096566 - -
19 Sobic.004G349500 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G370800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K15849: PAT, bifunctional aspartate aminotransferase and glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase


Gene co-expression network
sample Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic005G106700 Sobic005G106700 Sobic004G327900--Sobic005G106700 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic004G327900--Sobic004G234000 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G327900--Sobic001G123400 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic004G327900--Sobic004G200100 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic004G327900--Sobic009G212900 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic004G327900--Sobic003G106800 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic004G327900--Sobic010G093200 Sobic005G014500 Sobic005G014500 Sobic004G327900--Sobic005G014500 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic004G327900--Sobic007G009900 Sobic005G106700--Sobic004G327900 Sobic005G106700--Sobic010G093200 Sobic005G106700--Sobic001G123400 Sobic005G106700--Sobic005G014500 Sobic005G106700--Sobic003G106800 Sobic005G106700--Sobic009G212900 Sobic005G106700--Sobic004G234000 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic005G106700--Sobic001G303300 Sobic008G072400 Sobic008G072400 Sobic005G106700--Sobic008G072400 Sobic004G234000--Sobic004G200100 Sobic003G074300 Sobic003G074300 Sobic004G234000--Sobic003G074300 Sobic004G234000--Sobic004G327900 Sobic001G156200 Sobic001G156200 Sobic004G234000--Sobic001G156200 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic004G234000--Sobic002G381800 Sobic004G234000--Sobic001G123400 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic004G234000--Sobic004G288000 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic004G234000--Sobic003G394000 Sobic004G234000--Sobic007G009900 Sobic001G123400--Sobic010G093200 Sobic001G123400--Sobic007G009900 Sobic001G123400--Sobic004G327900 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic001G123400--Sobic001G520600 Sobic001G123400--Sobic009G212900 Sobic001G123400--Sobic005G106700 Sobic001G123400--Sobic004G234000 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic001G123400--Sobic004G145550 Sobic001G123400--Sobic004G200100 Sobic004G200100--Sobic003G394000 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic004G200100--Sobic009G170900 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic004G200100--Sobic007G136000 Sobic004G200100--Sobic004G234000 Sobic004G200100--Sobic002G381800 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic004G200100--Sobic005G160801 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic004G200100--Sobic010G082300 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G200100--Sobic004G060400 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic004G200100--Sobic004G348000 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic009G212900--Sobic003G370800 Sobic009G212900--Sobic007G009900 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic009G212900--Sobic009G143600 Sobic009G212900--Sobic001G123400 Sobic009G212900--Sobic004G200100 Sobic009G212900--Sobic003G106800 Sobic009G212900--Sobic004G327900 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic009G212900--Sobic002G408400 Sobic009G212900--Sobic005G106700 Sobic003G106800--Sobic005G106700 Sobic003G106800--Sobic009G212900 Sobic003G106800--Sobic004G327900 Sobic003G106800--Sobic001G123400 Sobic003G106800--Sobic010G093200 Sobic003G106800--Sobic004G200100 Sobic003G106800--Sobic009G143600 Sobic003G106800--Sobic007G136000 Sobic001G124900 Sobic001G124900 Sobic003G106800--Sobic001G124900 Sobic010G093200--Sobic001G123400 Sobic010G093200--Sobic001G303300 Sobic010G093200--Sobic005G106700 Sobic010G093200--Sobic004G145550 Sobic010G093200--Sobic001G520600 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic010G093200--Sobic006G244200 Sobic010G093200--Sobic004G327900 Sobic010G093200--Sobic003G106800 Sobic010G093200--Sobic008G072400 Sobic005G014500--Sobic005G106700 Sobic005G014500--Sobic004G327900 Sobic005G014500--Sobic010G093200 Sobic001G072400 Sobic001G072400 Sobic005G014500--Sobic001G072400 Sobic005G014500--Sobic001G303300 Sobic004G093000 Sobic004G093000 Sobic005G014500--Sobic004G093000 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic005G014500--Sobic009G030501 Sobic005G014500--Sobic001G124900 Sobic005G014500--Sobic004G234000 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic007G009900--Sobic010G103400 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic007G009900--Sobic008G104900 Sobic007G009900--Sobic001G123400 Sobic007G009900--Sobic002G408400 Sobic007G009900--Sobic003G370800 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic009G212900 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic004G200100
Octagon: transcription factors


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