Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G093200.1
Synonym Sb10g008180
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z7D5
Pfam PF05078
Panther DB PTHR31621 PTHR31621:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09157 : Protein of unknown function (DUF679)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g48840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049462
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.003G123950 - -
15 Sobic.006G252800 - -
16 Sobic.003G386350 - -
17 Sobic.009G143600 clathrin assembly protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G227050 - -
19 Sobic.003G396050 - -
20 Sobic.004G143550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic010G093200--Sobic001G123400 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic010G093200--Sobic001G303300 Sobic005G106700 Sobic005G106700 Sobic010G093200--Sobic005G106700 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic010G093200--Sobic004G145550 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic010G093200--Sobic001G520600 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic010G093200--Sobic006G244200 Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic010G093200--Sobic004G327900 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic010G093200--Sobic003G106800 Sobic008G072400 Sobic008G072400 Sobic010G093200--Sobic008G072400 Sobic001G123400--Sobic010G093200 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic001G123400--Sobic007G009900 Sobic001G123400--Sobic004G327900 Sobic001G123400--Sobic001G520600 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic001G123400--Sobic009G212900 Sobic001G123400--Sobic005G106700 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic001G123400--Sobic004G234000 Sobic001G123400--Sobic004G145550 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic001G123400--Sobic004G200100 Sobic001G303300--Sobic010G093200 Sobic001G303300--Sobic005G106700 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic001G303300--Sobic006G128233 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G303300--Sobic004G023800 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic001G303300--Sobic004G143550 Sobic001G137050 Sobic001G137050 Sobic001G303300--Sobic001G137050 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G303300--Sobic003G024450 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic001G303300--Sobic001G504300 Sobic010G244800 Sobic010G244800 Sobic001G303300--Sobic010G244800 Sobic005G106700--Sobic004G327900 Sobic005G106700--Sobic010G093200 Sobic005G106700--Sobic001G123400 Sobic005G014500 Sobic005G014500 Sobic005G106700--Sobic005G014500 Sobic005G106700--Sobic003G106800 Sobic005G106700--Sobic009G212900 Sobic005G106700--Sobic004G234000 Sobic005G106700--Sobic001G303300 Sobic005G106700--Sobic008G072400 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic001G520600--Sobic004G145550 Sobic001G520600--Sobic010G093200 Sobic001G520600--Sobic001G123400 Sobic001G520600--Sobic006G244200 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic007G009900 Sobic001G520600--Sobic003G384750 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic001G520600--Sobic008G057200 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic001G520600--Sobic010G103400 Sobic006G244200--Sobic004G145550 Sobic006G244200--Sobic009G143600 Sobic006G244200--Sobic003G384750 Sobic006G244200--Sobic001G520600 Sobic006G244200--Sobic010G093200 Sobic006G244200--Sobic002G375200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G244200--Sobic007G113101 Sobic006G252800 Sobic006G252800 Sobic006G244200--Sobic006G252800 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic006G244200--Sobic002G408400 Sobic004G327900--Sobic005G106700 Sobic004G327900--Sobic004G234000 Sobic004G327900--Sobic001G123400 Sobic004G327900--Sobic004G200100 Sobic004G327900--Sobic009G212900 Sobic004G327900--Sobic003G106800 Sobic004G327900--Sobic010G093200 Sobic004G327900--Sobic005G014500 Sobic004G327900--Sobic007G009900 Sobic003G106800--Sobic005G106700 Sobic003G106800--Sobic009G212900 Sobic003G106800--Sobic004G327900 Sobic003G106800--Sobic001G123400 Sobic003G106800--Sobic010G093200 Sobic003G106800--Sobic004G200100 Sobic003G106800--Sobic009G143600 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic003G106800--Sobic007G136000 Sobic001G124900 Sobic001G124900 Sobic003G106800--Sobic001G124900 Sobic008G072400--Sobic005G106700 Sobic008G072400--Sobic010G093200 Sobic008G072400--Sobic003G106800 Sobic008G072400--Sobic004G327900 Sobic004G166600 Sobic004G166600 Sobic008G072400--Sobic004G166600 Sobic008G072400--Sobic009G212900 Sobic008G072400--Sobic006G244200 Sobic008G072400--Sobic004G145550 Sobic008G072400--Sobic001G123400
Octagon: transcription factors


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