Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G244200.1
Synonym Sb06g031000
Functional annotation OsFBDUF42 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
UniProt C5Y9F4
Pfam PF03478
Panther DB PTHR11102 PTHR11102:SF71
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G05970 : F-box family protein with a domain of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g38070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G145550 - -
2 Sobic.009G143600 clathrin assembly protein, putative, expressed -
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17 Sobic.003G351501 - -
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19 Sobic.007G107800 expressed protein -
20 Sobic.006G275900 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic006G244200--Sobic004G145550 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic006G244200--Sobic009G143600 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic006G244200--Sobic003G384750 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic006G244200--Sobic001G520600 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic006G244200--Sobic010G093200 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic006G244200--Sobic002G375200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G244200--Sobic007G113101 Sobic006G252800 Sobic006G252800 Sobic006G244200--Sobic006G252800 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic006G244200--Sobic002G408400 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic009G143600--Sobic006G244200 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic009G143600--Sobic003G370800 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic009G143600--Sobic009G212900 Sobic009G143600--Sobic002G408400 Sobic009G143600--Sobic004G145550 Sobic009G143600--Sobic003G384750 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic009G143600--Sobic007G009900 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic009G143600--Sobic003G106800 Sobic009G143600--Sobic001G123400 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic001G520600--Sobic004G145550 Sobic001G520600--Sobic010G093200 Sobic001G520600--Sobic001G123400 Sobic001G520600--Sobic006G244200 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic007G009900 Sobic001G520600--Sobic003G384750 Sobic001G520600--Sobic008G057200 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic001G520600--Sobic010G103400 Sobic010G093200--Sobic001G123400 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic010G093200--Sobic001G303300 Sobic005G106700 Sobic005G106700 Sobic010G093200--Sobic005G106700 Sobic010G093200--Sobic004G145550 Sobic010G093200--Sobic001G520600 Sobic010G093200--Sobic006G244200 Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic010G093200--Sobic004G327900 Sobic010G093200--Sobic003G106800 Sobic008G072400 Sobic008G072400 Sobic010G093200--Sobic008G072400 Sobic002G375200--Sobic008G014400 Sobic002G375200--Sobic006G244200 Sobic002G375200--Sobic004G145550 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic002G375200--Sobic003G142800 Sobic002G375200--Sobic007G113101 Sobic005G070901 Sobic005G070901 Sobic002G375200--Sobic005G070901 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic002G375200--Sobic003G416200 Sobic002G375200--Sobic003G384750 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic002G375200--Sobic004G332200 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic007G113101--Sobic007G085400 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic007G113101--Sobic003G169700 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic007G113101--Sobic001G093400 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic007G113101--Sobic001G423200 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic007G113101--Sobic001G420150 Sobic007G113101--Sobic004G332200 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic007G113101--Sobic003G163000 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic007G113101--Sobic002G337400 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic007G113101--Sobic004G276600 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic006G252800--Sobic010G247750 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G252800--Sobic007G127200 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic006G252800--Sobic003G260500 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic006G252800--Sobic006G035350 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic006G252800--Sobic009G079600 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic006G252800--Sobic004G134400 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic006G252800--Sobic007G103200 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic006G252800--Sobic007G132650 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic006G252800--Sobic004G274300 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic003G370800 Sobic002G408400--Sobic008G057200 Sobic002G408400--Sobic007G009900 Sobic002G408400--Sobic010G103400 Sobic002G408400--Sobic003G384750 Sobic002G408400--Sobic009G143600 Sobic002G408400--Sobic009G212900 Sobic002G408400--Sobic006G244200
Octagon: transcription factors


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