Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G102200.2
Synonym
Functional annotation GPI transamidase component family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RDA3
Pfam PF04114
Panther DB PTHR13304 PTHR13304:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19130 : GPI transamidase component family protein / Gaa1-like family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g48980.1 : GPI transamidase component family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028017
Brachypodium KQK14425 , KQK09209
Barley HORVU3Hr1G063250.1 , HORVU3Hr1G063250.3 , HORVU3Hr1G063250.2
Wheat TraesCS3B02G299400 , TraesCS3B02G299400 , TraesCS3A02G266100 , TraesCS3A02G266100 , TraesCS3D02G266200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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9 Sobic.003G159101 - -
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20 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -


Gene co-expression network
sample Sobic006G102200 Sobic006G102200 Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic006G102200--Sobic005G118900 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic006G102200--Sobic005G104900 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic006G102200--Sobic003G053100 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic006G102200--Sobic005G139900 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic006G102200--Sobic003G172600 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic006G102200--Sobic003G173116 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic006G102200--Sobic003G169200 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic006G102200--Sobic001G230050 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic006G102200--Sobic003G159101 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic005G118900--Sobic001G487900 Sobic005G118900--Sobic003G172600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic005G118900--Sobic001G530201 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic005G118900--Sobic006G183100 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G102200 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic005G118900--Sobic009G143750 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic005G118900--Sobic002G083332 Sobic005G118900--Sobic005G104900 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G104900--Sobic004G077700 Sobic003G053100--Sobic005G139900 Sobic003G053100--Sobic003G173116 Sobic003G053100--Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic003G172600 Sobic003G053100--Sobic003G159101 Sobic003G053100--Sobic003G169200 Sobic003G053100--Sobic001G535850 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G053100--Sobic004G303433 Sobic003G053100--Sobic001G230050 Sobic005G139900--Sobic003G169200 Sobic005G139900--Sobic003G173116 Sobic005G139900--Sobic004G303433 Sobic005G139900--Sobic001G535850 Sobic005G139900--Sobic003G053100 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic003G172600 Sobic005G139900--Sobic001G530201 Sobic005G139900--Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic003G169200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic001G530201 Sobic003G173116--Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic001G230050 Sobic003G173116--Sobic005G139900 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic003G169200 Sobic003G173116--Sobic003G172600 Sobic003G173116--Sobic001G535850 Sobic003G173116--Sobic003G053100 Sobic003G173116--Sobic010G206600 Sobic003G169200--Sobic001G230050 Sobic003G169200--Sobic010G206600 Sobic003G169200--Sobic003G172600 Sobic003G169200--Sobic005G139900 Sobic003G169200--SobicK032300 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic003G169200--Sobic001G394532 Sobic003G169200--Sobic003G173116 Sobic003G169200--Sobic001G530201 Sobic003G169200--Sobic003G159101 Sobic001G230050--SobicK032300 Sobic001G230050--Sobic003G169200 Sobic001G230050--Sobic010G206600 Sobic001G230050--Sobic003G172600 Sobic001G230050--Sobic003G173116 Sobic001G230050--Sobic001G394532 Sobic001G230050--Sobic006G183100 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic001G230050--Sobic003G172500 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic001G230050--Sobic006G124700 Sobic003G159101--Sobic003G173116 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic003G159101--Sobic005G036450 Sobic003G159101--Sobic003G169200 Sobic003G159101--Sobic005G139900 Sobic003G159101--Sobic004G303433 Sobic003G159101--Sobic001G230050 Sobic003G159101--Sobic009G174150 Sobic003G159101--Sobic001G535850 Sobic003G159101--Sobic003G053100
Octagon: transcription factors


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