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Transcriptome id Sobic.005G118900.1
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UniProt A0A1Z5RI60
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.001G487900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding protein, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39
2 Sobic.003G172600 - -
3 Sobic.001G530201 - -
4 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
5 Sobic.006G124800 - -
6 Sobic.006G102200 GPI transamidase component family protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G143750 - -
8 Sobic.002G083332 - -
9 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.002G358450 - -
11 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
12 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
13 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
14 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
15 Sobic.004G007133 - -
16 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
17 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
18 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
19 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
20 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2


Gene co-expression network
sample Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic005G118900--Sobic001G487900 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G118900--Sobic003G172600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic005G118900--Sobic001G530201 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic005G118900--Sobic006G183100 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G124800 Sobic006G102200 Sobic006G102200 Sobic005G118900--Sobic006G102200 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic005G118900--Sobic009G143750 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic005G118900--Sobic002G083332 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic005G118900--Sobic005G104900 Sobic001G487900--Sobic009G143750 Sobic001G075500 Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic006G124800 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic001G487900--Sobic004G210400 Sobic001G487900--Sobic003G172600 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic001G487900--Sobic003G169100 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G487900--SobicK032300 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic001G487900--Sobic007G207100 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic001G487900--Sobic010G139200 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G172600--Sobic003G169200 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic001G530201 Sobic001G530201--Sobic003G169200 Sobic001G530201--Sobic005G139900 Sobic001G530201--Sobic002G083332 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G530201--Sobic001G394532 Sobic001G530201--Sobic010G206600 Sobic001G530201--Sobic003G172600 Sobic001G530201--Sobic001G230050 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic001G530201--Sobic001G182700 Sobic001G530201--SobicK032300 Sobic006G183100--SobicK032300 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic001G230050 Sobic006G183100--Sobic010G206600 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic006G183100--Sobic003G172500 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G183100--Sobic009G123100 Sobic006G183100--Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic006G124800 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic006G183100--Sobic007G145801 Sobic006G124800--Sobic003G172600 Sobic006G124800--SobicK032300 Sobic006G124800--Sobic001G230050 Sobic006G124800--Sobic007G145801 Sobic006G124800--Sobic006G183100 Sobic006G124800--Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic010G206600 Sobic006G124800--Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic003G169200 Sobic006G102200--Sobic005G118900 Sobic006G102200--Sobic005G104900 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic006G102200--Sobic003G053100 Sobic006G102200--Sobic005G139900 Sobic006G102200--Sobic003G172600 Sobic006G102200--Sobic003G173116 Sobic006G102200--Sobic003G169200 Sobic006G102200--Sobic001G230050 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic006G102200--Sobic003G159101 Sobic009G143750--Sobic001G487900 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic009G143750--Sobic001G502801 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic009G143750--Sobic007G183200 Sobic009G143750--Sobic003G172600 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic009G143750--Sobic002G358450 Sobic009G143750--Sobic006G124800 Sobic009G143750--Sobic007G207100 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic009G143750--Sobic006G016950 Sobic007G126150 Sobic007G126150 Sobic009G143750--Sobic007G126150 Sobic002G083332--Sobic001G530201 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic002G083332--Sobic002G380550 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic002G083332--Sobic002G159750 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic001G394532 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic002G083332--Sobic001G358366 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic002G083332--Sobic009G204501 Sobic002G083332--Sobic001G182700 Sobic002G083332--Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G104900--Sobic004G077700
Octagon: transcription factors


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