Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G007133.1,Sobic.004G007133.3,Sobic.004G007133.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A194YM58 , A0A1Z5RKA6
Pfam PF04851 PF00009 PF00271 PF00557 PF14826
Panther DB PTHR13980
NCBI CDD KOG1001; Helicase-like transcription factor HLTF/DNA helicase RAD5, DEAD-box superfamily
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity GO:0005524ATP binding GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10710 : global transcription factor C
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g25550.1 : FACT complex subunit SPT16, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018715
Brachypodium KQK21282 , KQK21283 , KQK21280
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G143750 - -
2 Sobic.005G118900 - -
3 Sobic.001G487900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding protein, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39
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10 Sobic.003G172600 - -
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12 Sobic.003G064901 - -
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14 Sobic.006G016950 - -
15 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
16 Sobic.001G075500 - -
17 Sobic.007G207100 chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed K02982: RP-S3, small subunit ribosomal protein S3
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19 Sobic.009G102250 - -
20 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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