Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G142800.1
Synonym SRG1, Sb03g012350, ATSRG1
Functional annotation flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q352
Pfam PF03171 PF14226
Panther DB PTHR10209 PTHR10209:SF204
NCBI CDD KOG0143; Iron/ascorbate family oxidoreductases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G17020 : senescence-related gene 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g40880.1 : flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002545 , Zm00025a024266
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
2 Sobic.005G154600 - -
3 Sobic.004G332200 - -
4 Sobic.004G276600 expressed protein -
5 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
6 Sobic.K031900 - -
7 Sobic.001G420150 - -
8 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.004G260250 - -
10 Sobic.004G127733 - -
11 Sobic.004G310350 - -
12 Sobic.001G255866 - -
13 Sobic.008G093300 - -
14 Sobic.008G100201 - -
15 Sobic.007G190600 - -
16 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
17 Sobic.006G261650 - -
18 Sobic.007G090433 - -
19 Sobic.004G130500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.003G268100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic003G142800--Sobic010G132400 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic003G142800--Sobic005G154600 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic003G142800--Sobic004G332200 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic003G142800--Sobic004G276600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic003G142800--Sobic006G035350 SobicK031900 SobicK031900 Sobic003G142800--SobicK031900 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic003G142800--Sobic001G420150 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic003G142800--Sobic001G423200 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic003G142800--Sobic004G260250 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic010G132400--Sobic010G136700 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic010G132400--Sobic008G119600 Sobic010G132400--Sobic006G035350 Sobic010G132400--Sobic005G154600 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic004G276600 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic010G132400--Sobic004G127733 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic002G154450 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic010G132400--Sobic008G115200 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic005G154600--Sobic006G261650 Sobic005G154600--Sobic004G276600 Sobic005G154600--Sobic002G154450 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic005G154600--Sobic010G247750 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic005G154600--Sobic004G310350 Sobic005G154600--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic005G154600--Sobic008G093300 Sobic005G154600--Sobic010G132400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic005G154600--Sobic007G127200 Sobic004G332200--Sobic004G276600 Sobic004G332200--Sobic001G420150 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic004G332200--Sobic004G224733 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G332200--Sobic007G090433 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G332200--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic001G423200 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G332200--Sobic003G163000 Sobic004G332200--Sobic005G154600 Sobic004G276600--Sobic001G420150 Sobic004G276600--Sobic007G090433 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic004G276600--Sobic007G116300 Sobic004G276600--Sobic005G154600 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic004G276600--Sobic001G093400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G276600--Sobic001G255866 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G276600--Sobic004G133201 Sobic004G276600--Sobic001G423200 Sobic004G276600--Sobic006G261650 Sobic006G035350--Sobic008G093300 Sobic006G035350--Sobic010G247750 Sobic006G035350--Sobic004G127733 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic006G035350--Sobic008G100201 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic006G035350--Sobic003G260500 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G035350--Sobic004G115100 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic006G035350--Sobic010G143700 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic006G035350--Sobic007G103200 Sobic006G035350--Sobic007G127200 SobicK031900--Sobic008G100201 SobicK031900--Sobic010G143700 Sobic003G268100 Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic004G115100 Sobic007G200700 Sobic007G200700 SobicK031900--Sobic007G200700 Sobic007G116150 Sobic007G116150 SobicK031900--Sobic007G116150 SobicK031400 SobicK031400 SobicK031900--SobicK031400 SobicK031900--Sobic006G035350 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK031900--Sobic001G383350 Sobic001G420150--Sobic007G116300 Sobic001G420150--Sobic001G093400 Sobic001G420150--Sobic004G276600 Sobic001G420150--Sobic001G423200 Sobic001G420150--Sobic001G255866 Sobic001G420150--Sobic007G090433 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G133201 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G420150--Sobic003G169700 Sobic001G423200--Sobic001G420150 Sobic001G423200--Sobic001G255866 Sobic001G423200--Sobic007G116300 Sobic001G423200--Sobic007G090433 Sobic001G423200--Sobic001G093400 Sobic001G423200--Sobic004G276600 Sobic001G423200--Sobic004G129400 Sobic001G423200--Sobic006G035350 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G423200--Sobic009G257000 Sobic004G260250--Sobic004G127733 Sobic004G260250--Sobic002G154450 Sobic004G260250--Sobic007G103200 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic004G260250--Sobic010G052100 Sobic004G260250--Sobic006G035350 Sobic004G260250--Sobic006G176900 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic004G260250--Sobic005G176300 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic004G260250--Sobic003G244250 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic004G260250--Sobic009G094100
Octagon: transcription factors


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