Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G141200.3,Sobic.001G141200.1,Sobic.001G141200.2
Synonym ARL2, Sb01g012290, ATARLC1, TTN5, HAL
Functional annotation ADP-ribosylation factor, putative, expressed
UniProt C5WQ95 , A0A1B6QIW8 , A0A1B6QIZ0
Pfam PF08477
Panther DB PTHR11711
NCBI CDD KOG0073; GTP-binding ADP-ribosylation factor-like protein ARL2
KEGG Orthology K07943; ADP-ribosylation factor-like protein 2
Gene Ontology GO:0007264; small GTPase mediated signal transduction GO:0005525GTP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G18390 : ADP-ribosylation factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g22140.1 : ADP-ribosylation factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007508
Brachypodium KQJ85670
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G141200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G141200 Sobic001G141200 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic001G141200--Sobic001G397550 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic001G141200--Sobic002G121201 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic001G141200--Sobic008G123700 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic001G141200--Sobic004G199100 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic001G141200--Sobic004G061100 Sobic002G198900 Sobic002G198900 Sobic001G141200--Sobic002G198900 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic001G141200--Sobic003G143600 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic001G141200--Sobic003G327950 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic001G141200--Sobic004G079400 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic001G397550--Sobic004G224733 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic001G397550--Sobic007G028300 Sobic001G397550--Sobic003G327950 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic001G397550--Sobic004G078200 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G397550--Sobic004G332200 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic001G397550--Sobic004G303900 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic001G397550--Sobic006G100150 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G397550--Sobic003G163000 Sobic001G397550--Sobic004G199100 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic002G121201--Sobic001G137900 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic002G121201--Sobic002G109700 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic002G121201--Sobic002G199300 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic002G121201--Sobic008G142450 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic002G121201--Sobic004G252250 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G121201--Sobic010G266400 Sobic002G121201--Sobic004G199100 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic002G121201--Sobic002G033550 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G121201--Sobic002G334700 Sobic008G123700--Sobic008G142450 Sobic008G123700--Sobic004G199100 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic008G123700--Sobic009G206900 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic008G123700--Sobic005G166200 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic008G123700--Sobic001G509901 Sobic008G123700--Sobic004G252250 Sobic008G123700--Sobic004G061100 Sobic008G123700--Sobic002G109700 Sobic008G123700--Sobic001G137900 Sobic004G199100--Sobic003G143600 Sobic004G199100--Sobic001G137900 Sobic004G199100--Sobic005G166200 Sobic004G199100--Sobic008G123700 Sobic004G199100--Sobic004G252250 Sobic004G199100--Sobic001G397550 Sobic004G199100--Sobic002G033550 Sobic004G199100--Sobic003G327950 Sobic004G199100--Sobic007G028300 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic004G061100--Sobic001G175200 Sobic004G061100--Sobic004G079400 Sobic004G061100--Sobic001G509901 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic003G311300 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic004G061100--Sobic004G233100 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G224600 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic004G061100--Sobic006G038050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic006G239200 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic004G061100--Sobic003G340200 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic002G198900--Sobic009G218700 Sobic002G198900--Sobic003G143600 Sobic002G412300 Sobic002G412300 Sobic002G198900--Sobic002G412300 Sobic002G198900--Sobic004G199100 Sobic002G198900--Sobic007G028300 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic002G198900--Sobic006G206600 Sobic002G198900--Sobic005G166200 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic002G198900--Sobic002G088300 Sobic002G198900--Sobic001G397550 Sobic003G143600--Sobic004G199100 Sobic003G143600--Sobic005G166200 Sobic003G143600--Sobic008G123700 Sobic003G143600--Sobic004G061100 Sobic003G143600--Sobic002G198900 Sobic001G094100 Sobic001G094100 Sobic003G143600--Sobic001G094100 Sobic003G143600--Sobic001G509901 Sobic003G143600--Sobic001G137900 Sobic003G143600--Sobic002G033550 Sobic003G327950--Sobic001G397550 Sobic003G327950--Sobic004G224733 Sobic003G327950--Sobic007G028300 Sobic003G327950--Sobic003G163000 Sobic003G327950--Sobic004G332200 Sobic003G327950--Sobic004G199100 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic003G327950--Sobic010G203400 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic003G327950--Sobic005G045250 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic003G327950--Sobic006G219400 Sobic004G079400--Sobic003G311300 Sobic004G079400--Sobic004G061100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic004G079400--Sobic003G031300 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G079400--Sobic003G030100 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic006G239200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic004G079400--Sobic010G227600 Sobic004G079400--Sobic001G175200 Sobic004G079400--Sobic004G233100
Octagon: transcription factors


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