Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G137900.1
Synonym CYP89A6, Sb01g012045
Functional annotation cytochrome P450, putative, expressed
UniProt C5WPN2
Pfam PF00067
Panther DB PTHR24298 PTHR24298:SF138
NCBI CDD KOG0156; Cytochrome P450 CYP2 subfamily
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016705; oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen GO:0005506iron ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G64940 : cytochrome P450, family 87, subfamily A, polypeptide 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g03890.1 : cytochrome P450, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT72334
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G033550 - -
2 Sobic.004G199100 - -
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4 Sobic.002G109700 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
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16 Sobic.006G053550 - -
17 Sobic.005G045250 - -
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19 Sobic.006G174050 - K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4
20 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16


Gene co-expression network
sample Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic001G137900--Sobic002G033550 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic001G137900--Sobic004G199100 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic001G137900--Sobic008G123700 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic001G137900--Sobic002G109700 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic001G137900--Sobic004G291300 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic001G137900--Sobic002G121201 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic001G137900--Sobic002G199300 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic001G137900--Sobic009G106601 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic001G137900--Sobic003G143600 Sobic002G033550--Sobic001G137900 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic004G199100 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic003G143600 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic002G033550--Sobic003G169700 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic009G106601 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic002G033550--Sobic005G019250 Sobic004G199100--Sobic003G143600 Sobic004G199100--Sobic001G137900 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic004G199100--Sobic005G166200 Sobic004G199100--Sobic008G123700 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic004G199100--Sobic004G252250 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G199100--Sobic001G397550 Sobic004G199100--Sobic002G033550 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic004G199100--Sobic003G327950 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G199100--Sobic007G028300 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic008G123700--Sobic008G142450 Sobic008G123700--Sobic004G199100 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic008G123700--Sobic009G206900 Sobic008G123700--Sobic005G166200 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic008G123700--Sobic001G509901 Sobic008G123700--Sobic004G252250 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic008G123700--Sobic004G061100 Sobic008G123700--Sobic002G109700 Sobic008G123700--Sobic001G137900 Sobic002G109700--Sobic008G142450 Sobic001G324300 Sobic001G324300 Sobic002G109700--Sobic001G324300 Sobic002G109700--Sobic009G206900 Sobic002G109700--Sobic008G123700 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G109700--Sobic003G031300 Sobic002G109700--Sobic001G137900 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic002G109700--Sobic004G079400 Sobic009G056950 Sobic009G056950 Sobic002G109700--Sobic009G056950 Sobic002G109700--Sobic004G252250 Sobic004G291300--Sobic001G137900 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G291300--Sobic003G163000 Sobic004G291300--Sobic002G033550 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic004G291300--Sobic005G045250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G291300--Sobic002G214000 Sobic004G291300--Sobic005G019250 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic004G291300--Sobic005G152866 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic004G291300--Sobic001G422432 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G291300--Sobic001G202450 Sobic002G121201--Sobic001G137900 Sobic002G121201--Sobic002G109700 Sobic002G121201--Sobic002G199300 Sobic002G121201--Sobic008G142450 Sobic002G121201--Sobic004G252250 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G121201--Sobic010G266400 Sobic002G121201--Sobic004G199100 Sobic002G121201--Sobic002G033550 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G121201--Sobic002G334700 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic002G199300--Sobic003G205000 Sobic002G199300--Sobic002G334700 Sobic002G199300--Sobic010G266400 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic002G199300--Sobic009G215100 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic002G199300--Sobic006G053550 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic002G199300--Sobic001G443400 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic002G199300--Sobic006G174050 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic002G199300--Sobic005G192350 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G199300--Sobic010G166201 Sobic009G106601--Sobic001G137900 Sobic009G106601--Sobic002G033550 Sobic009G106601--Sobic004G199100 Sobic009G106601--Sobic004G252250 Sobic009G106601--Sobic002G109700 Sobic002G000900 Sobic002G000900 Sobic009G106601--Sobic002G000900 Sobic009G106601--Sobic008G142450 Sobic009G106601--Sobic002G121201 Sobic009G106601--Sobic003G143600 Sobic003G143600--Sobic004G199100 Sobic003G143600--Sobic005G166200 Sobic003G143600--Sobic008G123700 Sobic003G143600--Sobic004G061100 Sobic002G198900 Sobic002G198900 Sobic003G143600--Sobic002G198900 Sobic001G094100 Sobic001G094100 Sobic003G143600--Sobic001G094100 Sobic003G143600--Sobic001G509901 Sobic003G143600--Sobic001G137900 Sobic003G143600--Sobic002G033550
Octagon: transcription factors


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