Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G143600.1
Synonym Sb03g012410
Functional annotation pectinesterase, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q371
Pfam PF01095
Panther DB PTHR31321 PTHR31321:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005618; cell wall


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G24130 : Pectin lyase-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g19440.1 : pectinesterase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK04069
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G199100 - -
2 Sobic.005G166200 MTN26L5 - MtN26 family protein precursor, expressed -
3 Sobic.008G123700 expressed protein -
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10 Sobic.001G397550 - -
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12 Sobic.002G025200 - -
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14 Sobic.007G028300 - -
15 Sobic.008G142450 - -
16 Sobic.004G252250 - -
17 Sobic.001G038050 - -
18 Sobic.006G261650 - -
19 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
20 Sobic.010G091250 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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