Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G123700.2
Synonym Sb08g017610
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R6C4
Pfam -
Panther DB PTHR33115:SF9 PTHR33115
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G18980 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g18729.5 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G142450 - -
2 Sobic.004G199100 - -
3 Sobic.009G206900 - -
4 Sobic.005G166200 MTN26L5 - MtN26 family protein precursor, expressed -
5 Sobic.001G509901 - -
6 Sobic.004G252250 - -
7 Sobic.004G061100 - -
8 Sobic.002G109700 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
9 Sobic.001G137900 cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.003G143600 pectinesterase, putative, expressed -
11 Sobic.001G452800 - -
12 Sobic.006G090450 - -
13 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
14 Sobic.001G175200 expressed protein -
15 Sobic.001G490350 - -
16 Sobic.004G233100 - -
17 Sobic.010G227600 - -
18 Sobic.001G397550 - -
19 Sobic.009G131032 - -
20 Sobic.002G071201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic008G123700--Sobic008G142450 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic008G123700--Sobic004G199100 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic008G123700--Sobic009G206900 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic008G123700--Sobic005G166200 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic008G123700--Sobic001G509901 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic008G123700--Sobic004G252250 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic008G123700--Sobic004G061100 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic008G123700--Sobic002G109700 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic008G123700--Sobic001G137900 Sobic008G142450--Sobic009G206900 Sobic008G142450--Sobic004G252250 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic008G142450--Sobic006G090450 Sobic008G142450--Sobic008G123700 Sobic008G142450--Sobic002G109700 Sobic001G452800 Sobic001G452800 Sobic008G142450--Sobic001G452800 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic008G142450--Sobic002G071201 Sobic008G142450--Sobic004G199100 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic008G142450--Sobic010G227600 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic004G199100--Sobic003G143600 Sobic004G199100--Sobic001G137900 Sobic004G199100--Sobic005G166200 Sobic004G199100--Sobic008G123700 Sobic004G199100--Sobic004G252250 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G199100--Sobic001G397550 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic004G199100--Sobic002G033550 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic004G199100--Sobic003G327950 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G199100--Sobic007G028300 Sobic009G206900--Sobic006G090450 Sobic009G206900--Sobic001G452800 Sobic009G206900--Sobic008G142450 Sobic009G206900--Sobic010G227600 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic009G206900--Sobic010G041301 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic009G206900--Sobic010G230100 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic009G206900--Sobic001G372400 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic009G206900--Sobic004G233100 Sobic003G108050 Sobic003G108050 Sobic009G206900--Sobic003G108050 Sobic005G166200--Sobic001G509901 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic005G166200--Sobic002G025200 Sobic005G166200--Sobic004G199100 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic005G166200--Sobic002G088300 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic005G166200--Sobic009G131032 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic005G166200--Sobic003G340200 Sobic005G166200--Sobic003G143600 Sobic005G166200--Sobic008G123700 Sobic005G166200--Sobic004G061100 Sobic001G509901--Sobic005G166200 Sobic001G509901--Sobic004G061100 Sobic001G509901--Sobic004G233100 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic001G509901--Sobic006G224600 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic001G509901--Sobic009G248200 Sobic001G509901--Sobic003G340200 Sobic001G509901--Sobic002G025200 Sobic001G509901--Sobic009G206900 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic001G509901--Sobic001G175200 Sobic004G252250--Sobic008G142450 Sobic004G252250--Sobic004G199100 Sobic004G252250--Sobic008G123700 Sobic004G252250--Sobic005G166200 Sobic004G252250--Sobic002G109700 Sobic004G252250--Sobic001G137900 Sobic001G490350 Sobic001G490350 Sobic004G252250--Sobic001G490350 Sobic004G252250--Sobic001G452800 Sobic004G252250--Sobic006G090450 Sobic004G061100--Sobic001G175200 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic004G061100--Sobic004G079400 Sobic004G061100--Sobic001G509901 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic004G233100 Sobic004G061100--Sobic006G224600 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic004G061100--Sobic006G038050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic003G340200 Sobic002G109700--Sobic008G142450 Sobic001G324300 Sobic001G324300 Sobic002G109700--Sobic001G324300 Sobic002G109700--Sobic009G206900 Sobic002G109700--Sobic008G123700 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G109700--Sobic003G031300 Sobic002G109700--Sobic001G137900 Sobic002G109700--Sobic004G079400 Sobic009G056950 Sobic009G056950 Sobic002G109700--Sobic009G056950 Sobic002G109700--Sobic004G252250 Sobic001G137900--Sobic002G033550 Sobic001G137900--Sobic004G199100 Sobic001G137900--Sobic008G123700 Sobic001G137900--Sobic002G109700 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic001G137900--Sobic004G291300 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic001G137900--Sobic002G121201 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic001G137900--Sobic002G199300 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic001G137900--Sobic009G106601 Sobic001G137900--Sobic003G143600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.