Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G208800.2,Sobic.004G208800.1,Sobic.004G208800.3
Synonym Sb04g025440
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RNL0 , A0A1Z5RNI8 , C5XX84
Pfam -
Panther DB PTHR36071:SF1 PTHR36071 PTHR36071 PTHR36071:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G40520 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g01600.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031904
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G444200 pentatricopeptide, putative, expressed -
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20 Sobic.005G100500 RNA polymerase subunit, putative, expressed K03020: RPC19, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2


Gene co-expression network
sample Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic004G208800--Sobic001G444200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G208800--Sobic008G014400 Sobic005G070901 Sobic005G070901 Sobic004G208800--Sobic005G070901 Sobic003G032301 Sobic003G032301 Sobic004G208800--Sobic003G032301 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic004G208800--Sobic001G395600 Sobic001G141200 Sobic001G141200 Sobic004G208800--Sobic001G141200 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic004G208800--Sobic006G206600 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G208800--Sobic002G375200 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic004G208800--Sobic007G107800 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic001G444200--Sobic007G160050 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic001G444200--Sobic003G384750 Sobic001G444200--Sobic004G208800 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic001G444200--Sobic001G159500 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic001G444200--Sobic001G201933 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G444200--Sobic003G047400 Sobic004G145550 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