Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G032301.1,Sobic.003G032301.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVL6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G491500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.002G149500 ELF protein, expressed -
3 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
4 Sobic.003G198850 - -
5 Sobic.K004201 - -
6 Sobic.008G053800 OsWAK24 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
7 Sobic.006G038050 - -
8 Sobic.010G149000 - -
9 Sobic.002G246100 - -
10 Sobic.003G024450 - -
11 Sobic.004G143550 - -
12 Sobic.004G023800 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G079400 EMB2261, putative, expressed -
14 Sobic.003G388201 - -
15 Sobic.008G060800 expressed protein -
16 Sobic.008G133750 - -
17 Sobic.004G270900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G054100 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
19 Sobic.005G198150 - -
20 Sobic.002G147550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G032301 Sobic003G032301 Sobic001G491500 Sobic001G491500 Sobic003G032301--Sobic001G491500 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic003G032301--Sobic002G149500 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G032301--Sobic002G367000 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic003G032301--Sobic003G198850 SobicK004201 SobicK004201 Sobic003G032301--SobicK004201 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G032301--Sobic008G053800 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic003G032301--Sobic006G038050 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic003G032301--Sobic010G149000 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic003G032301--Sobic002G246100 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic001G491500--Sobic004G092950 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic001G491500--Sobic008G157400 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic001G491500--Sobic008G133750 Sobic001G491500--Sobic006G038050 Sobic001G491500--Sobic002G149500 Sobic001G491500--Sobic003G198850 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic001G491500--Sobic009G190100 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic001G491500--Sobic002G117800 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G491500--Sobic003G024450 Sobic002G149500--Sobic006G038050 Sobic002G149500--Sobic010G149000 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic002G149500--Sobic003G383000 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic002G149500--Sobic001G440401 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic002G149500--Sobic002G168750 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic002G149500--Sobic006G037800 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic002G149500--Sobic007G083700 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic002G149500--Sobic003G288700 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic002G149500--Sobic007G134700 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic002G367000--Sobic003G257650 Sobic002G367000--Sobic006G038050 Sobic002G367000--Sobic003G198850 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic002G367000--Sobic007G190600 Sobic002G367000--Sobic003G383000 Sobic002G367000--Sobic002G149500 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic002G367000--Sobic001G175200 Sobic002G367000--Sobic002G246100 Sobic002G367000--SobicK004201 Sobic003G198850--Sobic003G383000 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic003G198850--Sobic001G404950 Sobic003G198850--Sobic008G053800 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic003G198850--Sobic004G115950 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G198850--Sobic001G072100 Sobic003G198850--Sobic003G288700 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic003G198850--Sobic004G023800 Sobic003G198850--SobicK004201 Sobic003G198850--Sobic002G149500 SobicK004201--Sobic008G133750 Sobic005G198150 Sobic005G198150 SobicK004201--Sobic005G198150 SobicK004201--Sobic003G198850 Sobic003G388201 Sobic003G388201 SobicK004201--Sobic003G388201 Sobic006G241500 Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic002G117800 Sobic002G314100 Sobic002G314100 SobicK004201--Sobic002G314100 SobicK004201--Sobic002G367000 SobicK004201--Sobic006G038050 Sobic008G053800--Sobic004G023800 Sobic008G053800--Sobic003G198850 Sobic008G053800--Sobic003G288700 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic008G053800--Sobic008G056000 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G053800--Sobic003G340500 Sobic008G053800--Sobic001G440401 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic008G053800--Sobic006G065000 Sobic008G053800--Sobic002G246100 Sobic008G053800--Sobic003G024450 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic006G038050--Sobic003G383000 Sobic010G149000--Sobic006G037800 Sobic010G149000--Sobic007G134700 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G149000--Sobic002G154450 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic010G149000--Sobic010G052100 Sobic010G149000--Sobic003G024450 Sobic010G149000--Sobic008G056000 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic010G149000--Sobic010G225175 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic010G149000--Sobic001G202800 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic010G149000--Sobic004G143550 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic002G246100--Sobic003G244250 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic002G246100--Sobic002G147550 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic002G246100--Sobic001G436450 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic002G246100--Sobic006G176900 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic002G246100--Sobic009G079400 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic002G246100--Sobic010G011100 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic002G246100--Sobic001G016050 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic002G246100--Sobic004G260250 Sobic002G246100--Sobic007G190600
Octagon: transcription factors


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