Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G054100.1
Synonym Sb02g004520
Functional annotation Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q9D7
Pfam PF12854 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF744
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G63130 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35436.1 : Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G053800 OsWAK24 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G054100 Sobic002G054100 Sobic003G032301 Sobic003G032301 Sobic002G054100--Sobic003G032301 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic002G054100--Sobic005G198150 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G054100--Sobic008G187450 Sobic001G491500 Sobic001G491500 Sobic002G054100--Sobic001G491500 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic002G054100--Sobic004G007166 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic002G054100--Sobic001G257600 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G054100--Sobic001G210101 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic002G054100--Sobic010G023132 SobicK004201 SobicK004201 Sobic002G054100--SobicK004201 Sobic003G032301--Sobic001G491500 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic003G032301--Sobic002G149500 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G032301--Sobic002G367000 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic003G032301--Sobic003G198850 Sobic003G032301--SobicK004201 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G032301--Sobic008G053800 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic003G032301--Sobic006G038050 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic003G032301--Sobic010G149000 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic003G032301--Sobic002G246100 Sobic005G198150--SobicK004201 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic005G198150--Sobic010G228800 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic005G198150--Sobic006G224600 Sobic005G198150--Sobic008G187450 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic005G198150--Sobic004G061100 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic005G198150--Sobic002G117800 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic005G198150--Sobic001G509901 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic006G038050 Sobic008G187450--Sobic004G007166 Sobic008G187450--Sobic005G198150 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic008G187450--Sobic002G262250 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic008G187450--Sobic007G203600 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic008G187450--Sobic001G387400 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic008G187450--Sobic001G174200 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic008G187450--Sobic009G028650 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G187450--Sobic003G340500 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic008G187450--Sobic008G176266 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic001G491500--Sobic004G092950 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic001G491500--Sobic008G157400 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic001G491500--Sobic008G133750 Sobic001G491500--Sobic006G038050 Sobic001G491500--Sobic002G149500 Sobic001G491500--Sobic003G198850 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic001G491500--Sobic009G190100 Sobic001G491500--Sobic002G117800 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G491500--Sobic003G024450 Sobic004G007166--Sobic008G176266 Sobic004G007166--Sobic001G387400 Sobic004G007166--Sobic008G187450 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic004G007166--Sobic002G070500 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G007166--Sobic004G272000 Sobic004G007166--Sobic007G203600 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic004G007166--Sobic007G043050 Sobic004G007166--Sobic009G028650 Sobic004G007166--Sobic001G174200 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic001G257600--Sobic004G352750 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic001G257600--Sobic010G227600 Sobic001G257600--Sobic007G043050 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic001G257600--Sobic003G030100 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic001G257600--Sobic009G206900 Sobic001G257600--Sobic001G174200 Sobic001G257600--Sobic006G224600 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic001G257600--Sobic004G079400 Sobic004G044250 Sobic004G044250 Sobic001G257600--Sobic004G044250 Sobic001G210101--Sobic002G070500 Sobic004G300200 Sobic004G300200 Sobic001G210101--Sobic004G300200 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G210101--Sobic005G134900 Sobic001G210101--Sobic004G007166 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic001G210101--Sobic002G059700 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic001G210101--Sobic009G248200 Sobic001G210101--Sobic004G044250 Sobic001G210101--Sobic006G224600 Sobic001G210101--Sobic001G257600 Sobic010G023132--Sobic002G117800 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic010G023132--Sobic009G087360 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic010G023132--Sobic004G039000 Sobic010G023132--Sobic008G133750 Sobic010G023132--Sobic004G092950 Sobic010G023132--Sobic009G190100 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic010G023132--Sobic001G202800 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic010G023132--Sobic006G192150 Sobic010G023132--Sobic003G024450 SobicK004201--Sobic008G133750 SobicK004201--Sobic005G198150 SobicK004201--Sobic003G198850 Sobic003G388201 Sobic003G388201 SobicK004201--Sobic003G388201 Sobic006G241500 Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic002G117800 Sobic002G314100 Sobic002G314100 SobicK004201--Sobic002G314100 SobicK004201--Sobic002G367000 SobicK004201--Sobic006G038050
Octagon: transcription factors


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