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Transcriptome id Sobic.K004201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VQV4
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G133750 - -
2 Sobic.005G198150 - -
3 Sobic.003G198850 - -
4 Sobic.003G388201 - -
5 Sobic.006G241500 - -
6 Sobic.002G117800 - -
7 Sobic.002G314100 dimethyladenosine transferase, putative, expressed K14191: 18S rRNA (adenine1779-N6/adenine1780-N6)-dimethyltransferase
8 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
9 Sobic.006G038050 - -
10 Sobic.003G340200 - -
11 Sobic.003G024450 - -
12 Sobic.004G193100 potassium channel AKT1, putative, expressed -
13 Sobic.001G491500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.004G061100 - -
15 Sobic.006G115532 - -
16 Sobic.004G143550 - -
17 Sobic.010G023132 - -
18 Sobic.001G175200 expressed protein -
19 Sobic.004G023800 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G115950 - -


Gene co-expression network
sample SobicK004201 SobicK004201 Sobic008G133750 Sobic008G133750 SobicK004201--Sobic008G133750 Sobic005G198150 Sobic005G198150 SobicK004201--Sobic005G198150 Sobic003G198850 Sobic003G198850 SobicK004201--Sobic003G198850 Sobic003G388201 Sobic003G388201 SobicK004201--Sobic003G388201 Sobic006G241500 Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic006G241500 Sobic002G117800 Sobic002G117800 SobicK004201--Sobic002G117800 Sobic002G314100 Sobic002G314100 SobicK004201--Sobic002G314100 Sobic002G367000 Sobic002G367000 SobicK004201--Sobic002G367000 Sobic006G038050 Sobic006G038050 SobicK004201--Sobic006G038050 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic008G133750--Sobic009G190100 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic008G133750--Sobic001G461101 Sobic008G133750--SobicK004201 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic008G133750--Sobic008G157400 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic008G133750--Sobic004G092950 Sobic008G133750--Sobic002G117800 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic008G133750--Sobic005G080075 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic008G133750--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic008G133750--Sobic010G064050 Sobic005G198150--SobicK004201 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic005G198150--Sobic010G228800 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic005G198150--Sobic006G224600 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic005G198150--Sobic008G187450 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic005G198150--Sobic004G061100 Sobic005G198150--Sobic002G117800 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic005G198150--Sobic001G509901 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic006G038050 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic003G198850--Sobic003G383000 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic003G198850--Sobic001G404950 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G198850--Sobic008G053800 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic003G198850--Sobic004G115950 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G198850--Sobic001G072100 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic003G198850--Sobic003G288700 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic003G198850--Sobic004G023800 Sobic003G198850--SobicK004201 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic003G198850--Sobic002G149500 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic003G388201--Sobic004G143550 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic003G388201--Sobic003G024450 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic003G388201--Sobic010G149000 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic003G388201--Sobic008G060800 Sobic003G388201--Sobic004G023800 Sobic003G388201--SobicK004201 Sobic003G388201--Sobic006G038050 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G388201--Sobic001G202800 Sobic003G388201--Sobic002G117800 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic006G241500--Sobic006G059150 Sobic006G241500--SobicK004201 Sobic006G241500--Sobic010G228800 Sobic006G241500--Sobic003G388201 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic006G241500--Sobic010G226100 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic006G241500--Sobic007G190600 Sobic006G241500--Sobic003G198850 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic006G241500--Sobic003G257650 Sobic006G241500--Sobic002G367000 Sobic002G117800--Sobic001G202800 Sobic002G117800--Sobic004G092950 Sobic002G290900 Sobic002G290900 Sobic002G117800--Sobic002G290900 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic002G117800--Sobic010G023132 Sobic002G117800--Sobic003G024450 Sobic002G117800--Sobic009G011050 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic002G117800--Sobic004G039000 Sobic002G117800--Sobic008G060800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic002G117800--Sobic001G208133 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic002G314100--Sobic004G193100 Sobic002G314100--Sobic003G388201 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic002G314100--Sobic006G192150 Sobic002G314100--SobicK004201 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic002G314100--Sobic002G419550 Sobic002G314100--Sobic001G202800 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic002G314100--Sobic010G276850 Sobic010G091250 Sobic010G091250 Sobic002G314100--Sobic010G091250 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic002G314100--Sobic002G025200 Sobic002G367000--Sobic003G257650 Sobic002G367000--Sobic006G038050 Sobic002G367000--Sobic003G198850 Sobic002G367000--Sobic007G190600 Sobic002G367000--Sobic003G383000 Sobic002G367000--Sobic002G149500 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic002G367000--Sobic001G175200 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic002G367000--Sobic002G246100 Sobic002G367000--SobicK004201 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic006G038050--Sobic003G383000
Octagon: transcription factors


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