Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G193100.1
Synonym KC1, KAT3, Sb04g024100, AtLKT1, ATKC1
Functional annotation potassium channel AKT1, putative, expressed
UniProt C5XVS6
Pfam PF00027 PF11834 PF00520
Panther DB PTHR10217 PTHR10217:SF537
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006811ion transport GO:0005216ion channel activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26650 : K+ transporter 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g52070.1 : potassium channel AKT1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038976
Brachypodium PNT72719
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G314100 dimethyladenosine transferase, putative, expressed K14191: 18S rRNA (adenine1779-N6/adenine1780-N6)-dimethyltransferase
2 Sobic.006G192150 - -
3 Sobic.010G094200 - -
4 Sobic.002G419550 - -
5 Sobic.002G025200 - -
6 Sobic.004G073300 multidrug resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.010G276850 - -
8 Sobic.005G019000 expressed protein -
9 Sobic.K004201 - -
10 Sobic.010G023132 - -
11 Sobic.010G091250 - -
12 Sobic.001G038050 - -
13 Sobic.003G388201 - -
14 Sobic.009G087360 - -
15 Sobic.002G117800 - -
16 Sobic.005G198150 - -
17 Sobic.004G161850 - -
18 Sobic.006G224600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G340200 - -
20 Sobic.001G202800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic004G193100--Sobic002G314100 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic004G193100--Sobic006G192150 Sobic010G094200 Sobic010G094200 Sobic004G193100--Sobic010G094200 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic004G193100--Sobic002G419550 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic004G193100--Sobic002G025200 Sobic004G073300 Sobic004G073300 Sobic004G193100--Sobic004G073300 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic004G193100--Sobic010G276850 Sobic005G019000 Sobic005G019000 Sobic004G193100--Sobic005G019000 SobicK004201 SobicK004201 Sobic004G193100--SobicK004201 Sobic002G314100--Sobic004G193100 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic002G314100--Sobic003G388201 Sobic002G314100--Sobic006G192150 Sobic002G314100--SobicK004201 Sobic002G314100--Sobic002G419550 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic002G314100--Sobic001G202800 Sobic002G314100--Sobic010G276850 Sobic010G091250 Sobic010G091250 Sobic002G314100--Sobic010G091250 Sobic002G314100--Sobic002G025200 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic006G192150--Sobic009G087360 Sobic006G192150--Sobic004G193100 Sobic006G192150--Sobic002G314100 Sobic006G192150--Sobic003G388201 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic006G192150--Sobic010G023132 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic006G192150--Sobic001G499400 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic006G192150--Sobic004G143550 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic006G192150--Sobic003G024450 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic006G192150--Sobic003G396050 Sobic010G094200--Sobic004G193100 Sobic010G094200--Sobic010G276850 Sobic003G388601 Sobic003G388601 Sobic010G094200--Sobic003G388601 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic010G094200--Sobic001G038050 Sobic010G094200--Sobic005G019000 Sobic010G094200--Sobic004G073300 Sobic010G094200--Sobic002G314100 Sobic010G094200--Sobic002G419550 Sobic010G094200--Sobic002G025200 Sobic002G419550--Sobic002G025200 Sobic002G419550--Sobic001G038050 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic002G419550--Sobic002G088300 Sobic002G419550--Sobic002G314100 Sobic002G419550--Sobic004G193100 Sobic002G419550--Sobic004G073300 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic002G419550--Sobic003G340200 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic002G419550--Sobic006G206600 Sobic002G419550--Sobic010G091250 Sobic002G025200--Sobic002G419550 Sobic002G025200--Sobic001G038050 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic002G025200--Sobic005G166200 Sobic002G025200--Sobic002G088300 Sobic002G025200--Sobic003G340200 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic002G025200--Sobic001G509901 Sobic002G025200--Sobic002G314100 Sobic002G025200--Sobic004G193100 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic002G025200--Sobic004G061100 Sobic004G073300--Sobic010G276850 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic004G073300--Sobic007G011100 Sobic004G073300--Sobic010G091250 Sobic004G073300--Sobic002G419550 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic004G073300--Sobic006G263250 Sobic004G073300--Sobic004G193100 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic004G073300--Sobic001G136850 Sobic004G073300--Sobic002G314100 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic004G073300--Sobic009G058900 Sobic010G276850--Sobic010G091250 Sobic010G276850--Sobic010G094200 Sobic010G276850--Sobic001G038050 Sobic010G276850--Sobic004G073300 Sobic003G031001 Sobic003G031001 Sobic010G276850--Sobic003G031001 Sobic010G276850--Sobic002G314100 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic010G276850--Sobic008G068700 Sobic010G276850--Sobic004G193100 Sobic010G276850--Sobic003G388601 Sobic004G161850 Sobic004G161850 Sobic005G019000--Sobic004G161850 Sobic005G019000--Sobic004G193100 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic005G019000--Sobic009G248200 Sobic005G019000--Sobic010G094200 Sobic003G061850 Sobic003G061850 Sobic005G019000--Sobic003G061850 Sobic005G019000--Sobic002G314100 Sobic005G019000--Sobic002G025200 Sobic005G019000--Sobic010G023132 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic005G019000--Sobic006G224600 Sobic008G133750 Sobic008G133750 SobicK004201--Sobic008G133750 Sobic005G198150 Sobic005G198150 SobicK004201--Sobic005G198150 Sobic003G198850 Sobic003G198850 SobicK004201--Sobic003G198850 SobicK004201--Sobic003G388201 Sobic006G241500 Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic006G241500 Sobic002G117800 Sobic002G117800 SobicK004201--Sobic002G117800 SobicK004201--Sobic002G314100 Sobic002G367000 Sobic002G367000 SobicK004201--Sobic002G367000 Sobic006G038050 Sobic006G038050 SobicK004201--Sobic006G038050
Octagon: transcription factors


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