Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G019000.1
Synonym Sb05g001620
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RGX4
Pfam PF13968 PF04578
Panther DB PTHR31325:SF2 PTHR31325
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45540 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g12110.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT67056
Barley HORVU2Hr1G003150.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G161850 - -
2 Sobic.004G193100 potassium channel AKT1, putative, expressed -
3 Sobic.009G248200 - -
4 Sobic.010G094200 - -
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6 Sobic.002G314100 dimethyladenosine transferase, putative, expressed K14191: 18S rRNA (adenine1779-N6/adenine1780-N6)-dimethyltransferase
7 Sobic.002G025200 - -
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10 Sobic.001G509901 - -
11 Sobic.010G276850 - -
12 Sobic.003G353900 - -
13 Sobic.002G419550 - -
14 Sobic.005G198150 - -
15 Sobic.002G142400 - -
16 Sobic.001G038050 - -
17 Sobic.003G388601 - -
18 Sobic.K004201 - -
19 Sobic.002G117800 - -
20 Sobic.001G115200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G019000 Sobic005G019000 Sobic004G161850 Sobic004G161850 Sobic005G019000--Sobic004G161850 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic005G019000--Sobic004G193100 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic005G019000--Sobic009G248200 Sobic010G094200 Sobic010G094200 Sobic005G019000--Sobic010G094200 Sobic003G061850 Sobic003G061850 Sobic005G019000--Sobic003G061850 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic005G019000--Sobic002G314100 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic005G019000--Sobic002G025200 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic005G019000--Sobic010G023132 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic005G019000--Sobic006G224600 Sobic004G161850--Sobic005G019000 Sobic004G161850--Sobic009G248200 Sobic004G161850--Sobic003G061850 Sobic004G161850--Sobic010G094200 Sobic004G161850--Sobic002G025200 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic004G161850--Sobic001G509901 Sobic004G161850--Sobic006G224600 Sobic004G161850--Sobic004G193100 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic004G161850--Sobic001G115200 Sobic004G193100--Sobic002G314100 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic004G193100--Sobic006G192150 Sobic004G193100--Sobic010G094200 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic004G193100--Sobic002G419550 Sobic004G193100--Sobic002G025200 Sobic004G073300 Sobic004G073300 Sobic004G193100--Sobic004G073300 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic004G193100--Sobic010G276850 Sobic004G193100--Sobic005G019000 SobicK004201 SobicK004201 Sobic004G193100--SobicK004201 Sobic009G248200--Sobic001G115200 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic009G248200--Sobic004G233100 Sobic009G248200--Sobic001G509901 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic009G248200--Sobic010G041301 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic009G248200--Sobic001G369701 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic009G248200--Sobic005G107250 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic009G248200--Sobic007G043050 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic009G248200--Sobic010G180300 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic009G248200--Sobic009G206900 Sobic010G094200--Sobic004G193100 Sobic010G094200--Sobic010G276850 Sobic003G388601 Sobic003G388601 Sobic010G094200--Sobic003G388601 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic010G094200--Sobic001G038050 Sobic010G094200--Sobic005G019000 Sobic010G094200--Sobic004G073300 Sobic010G094200--Sobic002G314100 Sobic010G094200--Sobic002G419550 Sobic010G094200--Sobic002G025200 Sobic003G061850--Sobic004G161850 Sobic003G061850--Sobic009G248200 Sobic001G293633 Sobic001G293633 Sobic003G061850--Sobic001G293633 Sobic003G061850--Sobic005G019000 Sobic001G002650 Sobic001G002650 Sobic003G061850--Sobic001G002650 Sobic003G061850--Sobic002G025200 Sobic003G242400 Sobic003G242400 Sobic003G061850--Sobic003G242400 Sobic001G529100 Sobic001G529100 Sobic003G061850--Sobic001G529100 Sobic003G061850--Sobic001G509901 Sobic002G314100--Sobic004G193100 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic002G314100--Sobic003G388201 Sobic002G314100--Sobic006G192150 Sobic002G314100--SobicK004201 Sobic002G314100--Sobic002G419550 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic002G314100--Sobic001G202800 Sobic002G314100--Sobic010G276850 Sobic010G091250 Sobic010G091250 Sobic002G314100--Sobic010G091250 Sobic002G314100--Sobic002G025200 Sobic002G025200--Sobic002G419550 Sobic002G025200--Sobic001G038050 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic002G025200--Sobic005G166200 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic002G025200--Sobic002G088300 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic002G025200--Sobic003G340200 Sobic002G025200--Sobic001G509901 Sobic002G025200--Sobic002G314100 Sobic002G025200--Sobic004G193100 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic002G025200--Sobic004G061100 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic010G023132--Sobic002G117800 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic010G023132--Sobic009G087360 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic010G023132--Sobic004G039000 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic010G023132--Sobic008G133750 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic010G023132--Sobic004G092950 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic010G023132--Sobic009G190100 Sobic010G023132--Sobic001G202800 Sobic010G023132--Sobic006G192150 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic010G023132--Sobic003G024450 Sobic006G224600--Sobic001G509901 Sobic006G224600--Sobic004G061100 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic006G224600--Sobic005G198150 Sobic006G224600--Sobic009G248200 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic006G224600--Sobic001G175200 Sobic001G037700 Sobic001G037700 Sobic006G224600--Sobic001G037700 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic006G224600--Sobic010G228800 Sobic006G224600--Sobic004G233100 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic006G224600--Sobic004G079400
Octagon: transcription factors


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