Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G159500.2,Sobic.001G159500.1
Synonym TSO1, ATTSO1, Sb01g013900
Functional annotation tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QJ77 , C5WRA4
Pfam PF03638
Panther DB PTHR12446 PTHR12446:SF32
NCBI CDD KOG1171; Metallothionein-like protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G22780 : Tesmin/TSO1-like CXC domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g41230.2,LOC_Os03g43730.1 : tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007330
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G384750 - -
2 Sobic.007G160050 - -
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20 Sobic.004G312000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic001G159500--Sobic003G384750 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic001G159500--Sobic007G160050 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic003G047400 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic001G159500--Sobic001G444200 Sobic003G413550 Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic003G413550 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic001G159500--Sobic004G145550 Sobic003G232500 Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic003G232500 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic001G159500--Sobic008G057200 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic001G159500--Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic007G160050--Sobic003G384750 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic007G160050--Sobic001G324000 Sobic007G160050--Sobic009G174800 Sobic007G160050--Sobic001G159500 Sobic007G160050--Sobic001G444200 Sobic003G215400 Sobic003G215400 Sobic007G160050--Sobic003G215400 Sobic007G160050--Sobic008G057200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic007G160050--Sobic008G014400 Sobic007G160050--Sobic002G408400 Sobic001G332933 Sobic001G332933 Sobic003G047400--Sobic001G332933 Sobic003G047400--Sobic001G159500 Sobic004G312000 Sobic004G312000 Sobic003G047400--Sobic004G312000 Sobic003G047400--Sobic001G444200 Sobic004G298250 Sobic004G298250 Sobic003G047400--Sobic004G298250 Sobic003G047400--Sobic003G384750 Sobic003G047400--Sobic004G145550 Sobic004G120400 Sobic004G120400 Sobic003G047400--Sobic004G120400 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic003G047400--Sobic007G107800 Sobic001G444200--Sobic007G160050 Sobic001G444200--Sobic003G384750 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic001G444200--Sobic004G208800 Sobic001G444200--Sobic001G159500 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic001G444200--Sobic001G201933 Sobic001G444200--Sobic003G047400 Sobic001G444200--Sobic004G145550 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic001G444200--Sobic001G395600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G444200--Sobic003G139600 Sobic006G227050 Sobic006G227050 Sobic003G413550--Sobic006G227050 Sobic007G028766 Sobic007G028766 Sobic003G413550--Sobic007G028766 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic003G413550--Sobic002G109900 Sobic001G060800 Sobic001G060800 Sobic003G413550--Sobic001G060800 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic003G413550--Sobic010G157600 Sobic003G413550--Sobic004G120400 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic003G413550--Sobic009G258000 Sobic002G359500 Sobic002G359500 Sobic003G413550--Sobic002G359500 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic003G413550--Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic001G179500 Sobic001G179500 Sobic003G232500--Sobic001G179500 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic003G232500--Sobic004G200100 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic003G232500--Sobic003G394000 Sobic003G232500--Sobic003G384750 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic003G232500--Sobic004G234000 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic003G232500--Sobic009G170900 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic003G232500--Sobic007G136000 Sobic003G232500--Sobic008G057200 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic003G232500--Sobic002G027901 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic008G057200--Sobic010G103400 Sobic008G057200--Sobic002G408400 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic008G057200--Sobic008G104900 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic008G057200--Sobic007G009900 Sobic008G057200--Sobic003G384750 Sobic008G057200--Sobic003G370800 Sobic008G057200--Sobic003G394000 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic008G057200--Sobic009G212900 Sobic008G057200--Sobic001G123400 Sobic009G174800--Sobic003G384750 Sobic009G174800--Sobic007G160050 Sobic009G174800--Sobic004G145550 Sobic008G012200 Sobic008G012200 Sobic009G174800--Sobic008G012200 Sobic003G290200 Sobic003G290200 Sobic009G174800--Sobic003G290200 Sobic009G174800--Sobic006G244200 Sobic004G308600 Sobic004G308600 Sobic009G174800--Sobic004G308600 Sobic001G510500 Sobic001G510500 Sobic009G174800--Sobic001G510500 Sobic009G174800--Sobic002G408400
Octagon: transcription factors


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