Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G120400.2
Synonym ULP1B
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YP40
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g17290.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G298250 - -
2 Sobic.001G179500 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G413550 - -
4 Sobic.001G027900 ATCHX, putative, expressed -
5 Sobic.002G292000 - -
6 Sobic.003G047400 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.006G227050 - -
8 Sobic.001G159500 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G204750 - -
10 Sobic.001G060800 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
11 Sobic.003G232500 - -
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13 Sobic.002G057200 targeting protein for Xklp2, putative, expressed -
14 Sobic.003G384750 - -
15 Sobic.005G156450 - -
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17 Sobic.003G118600 OsFBX276 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G526050 - -
19 Sobic.008G122400 expressed protein -
20 Sobic.007G160050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G120400 Sobic004G120400 Sobic004G298250 Sobic004G298250 Sobic004G120400--Sobic004G298250 Sobic001G179500 Sobic001G179500 Sobic004G120400--Sobic001G179500 Sobic003G413550 Sobic003G413550 Sobic004G120400--Sobic003G413550 Sobic001G027900 Sobic001G027900 Sobic004G120400--Sobic001G027900 Sobic002G292000 Sobic002G292000 Sobic004G120400--Sobic002G292000 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic004G120400--Sobic003G047400 Sobic006G227050 Sobic006G227050 Sobic004G120400--Sobic006G227050 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic004G120400--Sobic001G159500 Sobic003G204750 Sobic003G204750 Sobic004G120400--Sobic003G204750 Sobic004G298250--Sobic004G120400 Sobic004G298250--Sobic002G292000 Sobic004G298250--Sobic001G027900 Sobic004G298250--Sobic003G204750 Sobic001G343700 Sobic001G343700 Sobic004G298250--Sobic001G343700 Sobic001G060800 Sobic001G060800 Sobic004G298250--Sobic001G060800 Sobic001G526050 Sobic001G526050 Sobic004G298250--Sobic001G526050 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic004G298250--Sobic003G081200 Sobic004G298250--Sobic003G047400 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic001G179500--Sobic001G129150 Sobic005G049900 Sobic005G049900 Sobic001G179500--Sobic005G049900 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic001G179500--Sobic005G161400 Sobic006G042900 Sobic006G042900 Sobic001G179500--Sobic006G042900 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic001G179500--Sobic002G298201 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic001G179500--Sobic005G147900 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G179500--Sobic009G125100 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic001G179500--Sobic002G027901 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic001G179500--Sobic006G232700 Sobic003G413550--Sobic006G227050 Sobic007G028766 Sobic007G028766 Sobic003G413550--Sobic007G028766 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic003G413550--Sobic002G109900 Sobic003G413550--Sobic001G060800 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic003G413550--Sobic010G157600 Sobic003G413550--Sobic004G120400 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic003G413550--Sobic009G258000 Sobic002G359500 Sobic002G359500 Sobic003G413550--Sobic002G359500 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic003G413550--Sobic010G093200 Sobic001G027900--Sobic003G204750 Sobic001G027900--Sobic002G292000 Sobic001G027900--Sobic004G298250 Sobic003G069300 Sobic003G069300 Sobic001G027900--Sobic003G069300 Sobic004G129201 Sobic004G129201 Sobic001G027900--Sobic004G129201 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic001G027900--Sobic004G230000 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic002G292000--Sobic009G147450 Sobic002G292000--Sobic003G081200 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic002G292000--Sobic005G065050 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic002G292000--Sobic004G024350 Sobic002G292000--Sobic001G343700 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic002G292000--Sobic001G505066 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic002G292000--Sobic001G423666 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic002G292000--Sobic010G018200 Sobic002G292000--Sobic004G230000 Sobic001G332933 Sobic001G332933 Sobic003G047400--Sobic001G332933 Sobic003G047400--Sobic001G159500 Sobic004G312000 Sobic004G312000 Sobic003G047400--Sobic004G312000 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic003G047400--Sobic001G444200 Sobic003G047400--Sobic004G298250 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic003G047400--Sobic003G384750 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic003G047400--Sobic004G145550 Sobic003G047400--Sobic004G120400 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic003G047400--Sobic007G107800 Sobic006G227050--Sobic003G413550 Sobic006G227050--Sobic010G157600 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic006G227050--Sobic004G216650 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic006G227050--Sobic006G171801 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic006G227050--Sobic002G136500 Sobic006G227050--Sobic007G028766 Sobic006G227050--Sobic002G109900 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic006G227050--Sobic001G315300 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic006G227050--Sobic002G286500 Sobic001G159500--Sobic003G384750 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic001G159500--Sobic007G160050 Sobic001G159500--Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic001G444200 Sobic001G159500--Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic004G145550 Sobic003G232500 Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic003G232500 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic001G159500--Sobic008G057200 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic001G159500--Sobic009G174800 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic003G204750--Sobic009G087480 Sobic003G204750--Sobic001G027900 Sobic003G204750--Sobic002G292000 Sobic005G156450 Sobic005G156450 Sobic003G204750--Sobic005G156450 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic003G204750--Sobic008G029000 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic003G204750--Sobic004G351000 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic003G204750--Sobic005G199151 Sobic002G276500 Sobic002G276500 Sobic003G204750--Sobic002G276500 Sobic003G204750--Sobic001G332933
Octagon: transcription factors


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