Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G047400.1
Synonym Sb03g004125, OTP81
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q1D3
Pfam PF14432 PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF373
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29760 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08120.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035735
Brachypodium KQK02972 , KQK02977
Barley HORVU3Hr1G023070.1
Wheat TraesCS3A02G124300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G244200 OsFBDUF42 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G332933 Sobic001G332933 Sobic003G047400--Sobic001G332933 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic003G047400--Sobic001G159500 Sobic004G312000 Sobic004G312000 Sobic003G047400--Sobic004G312000 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic003G047400--Sobic001G444200 Sobic004G298250 Sobic004G298250 Sobic003G047400--Sobic004G298250 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic003G047400--Sobic003G384750 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic003G047400--Sobic004G145550 Sobic004G120400 Sobic004G120400 Sobic003G047400--Sobic004G120400 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic003G047400--Sobic007G107800 Sobic005G156450 Sobic005G156450 Sobic001G332933--Sobic005G156450 Sobic001G332933--Sobic007G107800 Sobic001G332933--Sobic003G047400 Sobic002G276500 Sobic002G276500 Sobic001G332933--Sobic002G276500 Sobic003G204750 Sobic003G204750 Sobic001G332933--Sobic003G204750 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic001G332933--Sobic009G087480 Sobic003G290200 Sobic003G290200 Sobic001G332933--Sobic003G290200 Sobic007G070100 Sobic007G070100 Sobic001G332933--Sobic007G070100 Sobic006G183500 Sobic006G183500 Sobic001G332933--Sobic006G183500 Sobic001G159500--Sobic003G384750 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic001G159500--Sobic007G160050 Sobic001G159500--Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic001G444200 Sobic003G413550 Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic004G145550 Sobic003G232500 Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic003G232500 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic001G159500--Sobic008G057200 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic001G159500--Sobic009G174800 Sobic004G312000--Sobic003G047400 Sobic004G312000--Sobic001G444200 Sobic004G312000--Sobic007G107800 Sobic004G312000--Sobic001G159500 Sobic005G100500 Sobic005G100500 Sobic004G312000--Sobic005G100500 Sobic004G312000--Sobic001G332933 Sobic002G257600 Sobic002G257600 Sobic004G312000--Sobic002G257600 Sobic004G312000--Sobic004G145550 Sobic010G148100 Sobic010G148100 Sobic004G312000--Sobic010G148100 Sobic001G444200--Sobic007G160050 Sobic001G444200--Sobic003G384750 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic001G444200--Sobic004G208800 Sobic001G444200--Sobic001G159500 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic001G444200--Sobic001G201933 Sobic001G444200--Sobic003G047400 Sobic001G444200--Sobic004G145550 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic001G444200--Sobic001G395600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G444200--Sobic003G139600 Sobic004G298250--Sobic004G120400 Sobic002G292000 Sobic002G292000 Sobic004G298250--Sobic002G292000 Sobic001G027900 Sobic001G027900 Sobic004G298250--Sobic001G027900 Sobic004G298250--Sobic003G204750 Sobic001G343700 Sobic001G343700 Sobic004G298250--Sobic001G343700 Sobic001G060800 Sobic001G060800 Sobic004G298250--Sobic001G060800 Sobic001G526050 Sobic001G526050 Sobic004G298250--Sobic001G526050 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic004G298250--Sobic003G081200 Sobic004G298250--Sobic003G047400 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic004G120400--Sobic004G298250 Sobic001G179500 Sobic001G179500 Sobic004G120400--Sobic001G179500 Sobic004G120400--Sobic003G413550 Sobic004G120400--Sobic001G027900 Sobic004G120400--Sobic002G292000 Sobic004G120400--Sobic003G047400 Sobic006G227050 Sobic006G227050 Sobic004G120400--Sobic006G227050 Sobic004G120400--Sobic001G159500 Sobic004G120400--Sobic003G204750 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic007G107800--Sobic004G157050 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic007G107800--Sobic004G207800 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic007G107800--Sobic009G192200 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic007G107800--Sobic007G113566 Sobic007G107800--Sobic003G290200 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic007G107800--Sobic010G002301 Sobic007G107800--Sobic001G332933 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic007G107800--Sobic008G171200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic007G107800--Sobic007G085900
Octagon: transcription factors


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