Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G118600.1
Synonym Sb03g010010
Functional annotation OsFBX276 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0VWX7
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF116
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03100 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g09910.1 : OsFBX276 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023975
Brachypodium KQK03704 , KQK03805
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G120900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G505066 - -
3 Sobic.010G046601 - -
4 Sobic.002G292000 - -
5 Sobic.007G202360 - -
6 Sobic.003G192500 - -
7 Sobic.002G190600 - -
8 Sobic.010G172633 - -
9 Sobic.001G143850 - -
10 Sobic.002G104450 - -
11 Sobic.010G246800 - -
12 Sobic.005G065050 - -
13 Sobic.002G312000 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
14 Sobic.001G314350 - -
15 Sobic.003G116200 expressed protein -
16 Sobic.003G123900 expressed protein -
17 Sobic.001G035700 - -
18 Sobic.009G147450 - -
19 Sobic.002G087700 - -
20 Sobic.005G122000 LGC1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G118600 Sobic003G118600 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic003G118600--Sobic010G120900 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic003G118600--Sobic001G505066 Sobic010G046601 Sobic010G046601 Sobic003G118600--Sobic010G046601 Sobic002G292000 Sobic002G292000 Sobic003G118600--Sobic002G292000 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic003G118600--Sobic007G202360 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic003G118600--Sobic003G192500 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic003G118600--Sobic002G190600 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic003G118600--Sobic010G172633 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic003G118600--Sobic001G143850 Sobic010G120900--Sobic001G505066 Sobic010G120900--Sobic003G192500 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic010G120900--Sobic003G116200 Sobic010G120900--Sobic002G190600 Sobic010G120900--Sobic007G202360 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic010G120900--Sobic001G314350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic010G120900--Sobic005G122000 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic010G120900--Sobic010G246800 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic010G120900--Sobic003G123900 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic001G505066--Sobic005G065050 Sobic001G505066--Sobic007G202360 Sobic001G505066--Sobic002G190600 Sobic001G505066--Sobic010G120900 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic001G505066--Sobic009G147450 Sobic001G505066--Sobic010G172633 Sobic001G505066--Sobic003G192500 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic001G505066--Sobic001G035700 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic001G505066--Sobic001G488800 Sobic010G046601--Sobic007G202360 Sobic010G046601--Sobic001G505066 Sobic010G046601--Sobic005G065050 Sobic010G046601--Sobic010G120900 Sobic010G046601--Sobic002G190600 Sobic010G046601--Sobic001G488800 Sobic010G046601--Sobic003G118600 Sobic010G046601--Sobic003G192500 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic010G046601--Sobic008G122250 Sobic002G292000--Sobic009G147450 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic002G292000--Sobic003G081200 Sobic002G292000--Sobic005G065050 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic002G292000--Sobic004G024350 Sobic001G343700 Sobic001G343700 Sobic002G292000--Sobic001G343700 Sobic002G292000--Sobic001G505066 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic002G292000--Sobic001G423666 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic002G292000--Sobic010G018200 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic002G292000--Sobic004G230000 Sobic007G202360--Sobic001G505066 Sobic007G202360--Sobic002G190600 Sobic007G202360--Sobic005G065050 Sobic007G202360--Sobic003G192500 Sobic007G202360--Sobic009G147450 Sobic007G202360--Sobic010G120900 Sobic007G202360--Sobic001G423666 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic007G202360--Sobic004G301250 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic007G202360--Sobic006G202900 Sobic003G192500--Sobic002G190600 Sobic003G192500--Sobic007G202360 Sobic003G192500--Sobic004G301250 Sobic003G192500--Sobic010G120900 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic003G192500--Sobic002G087700 Sobic003G192500--Sobic001G505066 Sobic003G192500--Sobic003G123900 Sobic003G192500--Sobic006G202900 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic003G192500--Sobic004G073232 Sobic002G190600--Sobic003G192500 Sobic002G190600--Sobic005G065050 Sobic002G190600--Sobic001G505066 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic002G190600--Sobic005G119250 Sobic002G190600--Sobic007G202360 Sobic002G190600--Sobic006G202900 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic002G190600--Sobic008G007500 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic002G190600--Sobic010G193100 Sobic002G190600--Sobic001G423666 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic010G172633--Sobic001G315300 Sobic010G172633--Sobic001G143850 Sobic010G172633--Sobic001G035700 Sobic010G172633--Sobic001G505066 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic010G172633--Sobic001G184950 Sobic010G172633--Sobic009G147450 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic010G172633--Sobic003G147800 Sobic003G132200 Sobic003G132200 Sobic010G172633--Sobic003G132200 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic010G172633--Sobic002G109900 Sobic001G143850--Sobic010G172633 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic001G315300 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic001G143850--Sobic009G053700 Sobic001G143850--Sobic010G246800 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G416200 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic001G143850--Sobic003G394150 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic001G143850--Sobic010G020000 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic001G143850--Sobic002G136500
Octagon: transcription factors


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