Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G046601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRG8
Pfam PF06697
Panther DB PTHR33512 PTHR33512:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G01140 : Protein of unknown function (DUF1191)
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06430.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049965 , Zm00025a041585
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G024910.1 , HORVU7Hr1G024910.2
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G202360 - -
2 Sobic.001G505066 - -
3 Sobic.005G065050 - -
4 Sobic.010G120900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G190600 - -
6 Sobic.001G488800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
7 Sobic.003G118600 OsFBX276 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G192500 - -
9 Sobic.008G122250 - -
10 Sobic.003G123900 expressed protein -
11 Sobic.009G147450 - -
12 Sobic.005G119250 - -
13 Sobic.004G301250 - -
14 Sobic.010G018200 expressed protein -
15 Sobic.002G292000 - -
16 Sobic.001G423666 - -
17 Sobic.002G310400 chalcone synthase, putative, expressed -
18 Sobic.006G202900 expressed protein -
19 Sobic.001G035700 - -
20 Sobic.010G124400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G046601 Sobic010G046601 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic010G046601--Sobic007G202360 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic010G046601--Sobic001G505066 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic010G046601--Sobic005G065050 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic010G046601--Sobic010G120900 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic010G046601--Sobic002G190600 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic010G046601--Sobic001G488800 Sobic003G118600 Sobic003G118600 Sobic010G046601--Sobic003G118600 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic010G046601--Sobic003G192500 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic010G046601--Sobic008G122250 Sobic007G202360--Sobic001G505066 Sobic007G202360--Sobic002G190600 Sobic007G202360--Sobic005G065050 Sobic007G202360--Sobic003G192500 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic007G202360--Sobic009G147450 Sobic007G202360--Sobic010G120900 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic007G202360--Sobic001G423666 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic007G202360--Sobic004G301250 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic007G202360--Sobic006G202900 Sobic001G505066--Sobic005G065050 Sobic001G505066--Sobic007G202360 Sobic001G505066--Sobic002G190600 Sobic001G505066--Sobic010G120900 Sobic001G505066--Sobic009G147450 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic001G505066--Sobic010G172633 Sobic001G505066--Sobic003G192500 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic001G505066--Sobic001G035700 Sobic001G505066--Sobic001G488800 Sobic005G065050--Sobic009G147450 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic005G065050--Sobic010G018200 Sobic005G065050--Sobic002G190600 Sobic005G065050--Sobic001G505066 Sobic005G065050--Sobic001G423666 Sobic005G065050--Sobic007G202360 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic005G065050--Sobic004G024350 Sobic005G065050--Sobic006G202900 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic005G065050--Sobic008G029000 Sobic010G120900--Sobic001G505066 Sobic010G120900--Sobic003G192500 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic010G120900--Sobic003G116200 Sobic010G120900--Sobic002G190600 Sobic010G120900--Sobic007G202360 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic010G120900--Sobic001G314350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic010G120900--Sobic005G122000 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic010G120900--Sobic010G246800 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic010G120900--Sobic003G123900 Sobic002G190600--Sobic003G192500 Sobic002G190600--Sobic005G065050 Sobic002G190600--Sobic001G505066 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic002G190600--Sobic005G119250 Sobic002G190600--Sobic007G202360 Sobic002G190600--Sobic006G202900 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic002G190600--Sobic008G007500 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic002G190600--Sobic010G193100 Sobic002G190600--Sobic001G423666 Sobic001G488800--Sobic001G505066 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic001G488800--Sobic009G124100 Sobic001G488800--Sobic001G035700 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic001G488800--Sobic002G310400 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic001G488800--Sobic004G104250 Sobic001G488800--Sobic005G065050 Sobic001G488800--Sobic010G018200 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic001G488800--Sobic010G081950 Sobic001G488800--Sobic009G147450 Sobic003G118600--Sobic010G120900 Sobic003G118600--Sobic001G505066 Sobic003G118600--Sobic010G046601 Sobic002G292000 Sobic002G292000 Sobic003G118600--Sobic002G292000 Sobic003G118600--Sobic007G202360 Sobic003G118600--Sobic003G192500 Sobic003G118600--Sobic002G190600 Sobic003G118600--Sobic010G172633 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic003G118600--Sobic001G143850 Sobic003G192500--Sobic002G190600 Sobic003G192500--Sobic007G202360 Sobic003G192500--Sobic004G301250 Sobic003G192500--Sobic010G120900 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic003G192500--Sobic002G087700 Sobic003G192500--Sobic001G505066 Sobic003G192500--Sobic003G123900 Sobic003G192500--Sobic006G202900 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic003G192500--Sobic004G073232 Sobic010G124400 Sobic010G124400 Sobic008G122250--Sobic010G124400 Sobic008G122250--Sobic005G119250 Sobic001G020350 Sobic001G020350 Sobic008G122250--Sobic001G020350 Sobic008G122250--Sobic002G190600 Sobic008G122250--Sobic005G065050 Sobic008G122250--Sobic001G505066 Sobic008G122250--Sobic009G147450 Sobic008G122250--Sobic007G202360 Sobic008G122250--Sobic010G018200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.