Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G104450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W392
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G314350 - -
2 Sobic.003G116200 expressed protein -
3 Sobic.004G073232 - -
4 Sobic.002G312000 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
5 Sobic.006G210266 - -
6 Sobic.001G152150 - -
7 Sobic.006G243300 expressed protein -
8 Sobic.009G102550 - -
9 Sobic.002G312550 - -
10 Sobic.003G096750 - -
11 Sobic.010G120900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G103450 - -
13 Sobic.001G291701 - -
14 Sobic.001G432400 expressed protein -
15 Sobic.003G123900 expressed protein -
16 Sobic.008G040201 - K13100: pre-mRNA-splicing factor CWC22
17 Sobic.003G192500 - -
18 Sobic.010G246800 - -
19 Sobic.005G133400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G118600 OsFBX276 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G104450 Sobic002G104450 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic002G104450--Sobic001G314350 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic002G104450--Sobic003G116200 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic002G104450--Sobic004G073232 Sobic002G312000 Sobic002G312000 Sobic002G104450--Sobic002G312000 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic002G104450--Sobic006G210266 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic002G104450--Sobic001G152150 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic002G104450--Sobic006G243300 Sobic009G102550 Sobic009G102550 Sobic002G104450--Sobic009G102550 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic002G104450--Sobic002G312550 Sobic001G314350--Sobic003G116200 Sobic001G314350--Sobic004G073232 Sobic001G314350--Sobic006G210266 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic001G314350--Sobic010G246800 Sobic001G314350--Sobic002G312550 Sobic001G314350--Sobic002G104450 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G314350--Sobic010G120900 Sobic001G314350--Sobic006G243300 Sobic001G314350--Sobic001G152150 Sobic003G116200--Sobic001G314350 Sobic003G116200--Sobic010G246800 Sobic003G116200--Sobic010G120900 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic003G116200--Sobic010G214150 Sobic003G116200--Sobic002G312550 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic003G116200--Sobic003G013300 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic003G116200--Sobic001G308350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic006G243300 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic004G073232--Sobic004G103450 Sobic004G073232--Sobic001G314350 Sobic004G073232--Sobic009G102550 Sobic004G073232--Sobic001G152150 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic004G073232--Sobic003G192500 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic004G073232--Sobic001G291701 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic004G073232--Sobic008G040201 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic004G073232--Sobic004G301250 Sobic009G217450 Sobic009G217450 Sobic004G073232--Sobic009G217450 Sobic002G312000--Sobic002G104450 Sobic006G183500 Sobic006G183500 Sobic002G312000--Sobic006G183500 Sobic003G118600 Sobic003G118600 Sobic002G312000--Sobic003G118600 Sobic002G312000--Sobic001G314350 Sobic002G312000--Sobic004G073232 Sobic010G124400 Sobic010G124400 Sobic002G312000--Sobic010G124400 Sobic002G312000--Sobic006G210266 Sobic005G133400 Sobic005G133400 Sobic002G312000--Sobic005G133400 Sobic002G312000--Sobic003G192500 Sobic006G210266--Sobic001G314350 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic006G210266--Sobic010G207175 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic006G210266--Sobic001G163500 Sobic006G210266--Sobic002G312550 Sobic006G210266--Sobic006G243300 Sobic006G210266--Sobic001G152150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G210266--Sobic007G179100 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic006G210266--Sobic010G166850 Sobic006G210266--Sobic008G040201 Sobic001G152150--Sobic009G102550 Sobic001G152150--Sobic008G040201 Sobic001G152150--Sobic004G073232 Sobic001G152150--Sobic001G291701 Sobic001G152150--Sobic004G103450 Sobic001G152150--Sobic009G217450 Sobic001G152150--Sobic006G210266 Sobic001G152150--Sobic001G314350 Sobic001G152150--Sobic002G104450 Sobic006G243300--Sobic010G207175 Sobic006G243300--Sobic006G210266 Sobic006G243300--Sobic001G163500 Sobic006G243300--Sobic001G314350 Sobic006G243300--Sobic003G116200 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic006G243300--Sobic009G258800 Sobic006G243300--Sobic002G312550 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic006G243300--Sobic005G192350 Sobic006G243300--Sobic003G013300 Sobic009G102550--Sobic001G152150 Sobic009G102550--Sobic004G073232 Sobic009G102550--Sobic004G301250 Sobic009G102550--Sobic008G040201 Sobic009G102550--Sobic009G217450 Sobic009G102550--Sobic004G103450 Sobic009G102550--Sobic001G314350 Sobic009G102550--Sobic001G291701 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic009G102550--Sobic003G123900 Sobic002G312550--Sobic010G214150 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic001G163500 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic003G096750 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic002G312550--Sobic004G252300 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic002G312550--Sobic009G158150 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic003G013300 Sobic002G312550--Sobic001G314350
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.