Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G133400.3,Sobic.005G133400.2
Synonym Sb05g019750
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PS79
Pfam PF13639
Panther DB PTHR22763 PTHR22763:SF63
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38140 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g47270.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G210266 - -
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20 Sobic.004G250000 OsMADS57 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G133400 Sobic005G133400 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic005G133400--Sobic006G210266 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic005G133400--Sobic009G035000 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic005G133400--Sobic005G123300 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic005G133400--Sobic002G312550 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic005G133400--Sobic001G163500 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic005G133400--Sobic006G193801 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic005G133400--Sobic009G158150 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic005G133400--Sobic003G129700 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic005G133400--Sobic007G042700 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic006G210266--Sobic001G314350 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic006G210266--Sobic010G207175 Sobic006G210266--Sobic001G163500 Sobic006G210266--Sobic002G312550 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic006G210266--Sobic006G243300 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic006G210266--Sobic001G152150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G210266--Sobic007G179100 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic006G210266--Sobic010G166850 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic006G210266--Sobic008G040201 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic009G035000--Sobic008G041500 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic009G035000--Sobic002G062400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic009G035000--Sobic007G045750 Sobic009G035000--Sobic003G129700 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic009G035000--Sobic006G009200 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic009G035000--Sobic003G282400 Sobic009G035000--Sobic006G193801 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic009G035000--Sobic010G002600 Sobic009G035000--Sobic001G163500 Sobic005G123300--Sobic002G312550 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic005G123300--Sobic004G252300 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic005G123300--Sobic010G214150 Sobic005G123300--Sobic009G158150 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic005G123300--Sobic003G013300 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G123300--Sobic002G178900 Sobic005G123300--Sobic001G163500 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic005G123300--Sobic004G249950 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G123300--Sobic001G516400 Sobic002G312550--Sobic010G214150 Sobic002G312550--Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic001G163500 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic004G252300 Sobic002G312550--Sobic009G158150 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic003G013300 Sobic002G312550--Sobic001G314350 Sobic001G163500--Sobic003G129700 Sobic001G163500--Sobic009G158150 Sobic001G163500--Sobic002G062400 Sobic001G163500--Sobic003G282400 Sobic001G163500--Sobic007G045750 Sobic001G163500--Sobic007G179100 Sobic001G163500--Sobic008G041500 Sobic001G163500--Sobic002G312550 Sobic001G163500--Sobic006G193801 Sobic002G005900 Sobic002G005900 Sobic006G193801--Sobic002G005900 Sobic006G193801--Sobic009G035000 Sobic006G193801--Sobic001G163500 Sobic006G193801--Sobic003G282400 Sobic006G193801--Sobic010G002600 Sobic006G193801--Sobic008G041500 Sobic006G193801--Sobic003G129700 Sobic006G193801--Sobic008G040201 Sobic006G193801--Sobic002G062400 Sobic009G158150--Sobic003G129700 Sobic009G158150--Sobic007G045750 Sobic009G158150--Sobic001G163500 Sobic009G158150--Sobic002G062400 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G158150--Sobic010G166201 Sobic009G158150--Sobic001G516400 Sobic009G158150--Sobic004G249950 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic009G158150--Sobic005G168900 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic009G158150--Sobic001G050650 Sobic003G129700--Sobic002G062400 Sobic003G129700--Sobic009G158150 Sobic003G129700--Sobic001G163500 Sobic003G129700--Sobic007G045750 Sobic003G129700--Sobic003G282400 Sobic003G129700--Sobic009G035000 Sobic003G129700--Sobic006G009200 Sobic003G129700--Sobic005G168900 Sobic003G129700--Sobic008G041500 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic007G042700--Sobic001G497400 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic007G042700--Sobic002G000350 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic007G042700--Sobic001G278900 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic007G042700--Sobic003G085533 Sobic007G042700--Sobic004G252300 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic007G042700--Sobic004G072300 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic007G042700--Sobic001G471050 Sobic007G042700--Sobic004G249950 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G042700--Sobic006G097600
Octagon: transcription factors


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