Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G122400.2,Sobic.008G122400.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R672 , A0A1Z5R690
Pfam -
Panther DB PTHR33913 PTHR33913:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05950 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g33940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047651
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G129150 - -
2 Sobic.001G179500 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G431800 nonsense-mediated mRNA decay protein 3, putative, expressed K07562: nonsense-mediated mRNA decay protein 3
4 Sobic.010G232300 ubiquitin family protein, expressed -
5 Sobic.005G077600 OsFBO22 - F-box and other domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G161400 - -
7 Sobic.005G049900 - -
8 Sobic.001G370200 - -
9 Sobic.003G218000 ENT domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G316100 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
11 Sobic.006G016800 OsSigP3 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed -
12 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
13 Sobic.005G147900 - -
14 Sobic.008G095633 - -
15 Sobic.002G001200 - -
16 Sobic.004G168900 elongation factor Tu family protein, putative, expressed K14536: ribosome assembly protein 1
17 Sobic.002G298201 - K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
18 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
19 Sobic.009G048700 expressed protein -
20 Sobic.006G042900 FAR1 family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G122400 Sobic008G122400 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic008G122400--Sobic001G129150 Sobic001G179500 Sobic001G179500 Sobic008G122400--Sobic001G179500 Sobic003G431800 Sobic003G431800 Sobic008G122400--Sobic003G431800 Sobic010G232300 Sobic010G232300 Sobic008G122400--Sobic010G232300 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic008G122400--Sobic005G077600 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic008G122400--Sobic005G161400 Sobic005G049900 Sobic005G049900 Sobic008G122400--Sobic005G049900 Sobic001G370200 Sobic001G370200 Sobic008G122400--Sobic001G370200 Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic008G122400--Sobic003G218000 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic001G129150--Sobic005G147900 Sobic001G129150--Sobic005G161400 Sobic002G261400 Sobic002G261400 Sobic001G129150--Sobic002G261400 Sobic006G016800 Sobic006G016800 Sobic001G129150--Sobic006G016800 Sobic001G129150--Sobic005G049900 Sobic001G129150--Sobic001G370200 Sobic001G136150 Sobic001G136150 Sobic001G129150--Sobic001G136150 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic001G129150--Sobic010G074000 Sobic006G042900 Sobic006G042900 Sobic001G129150--Sobic006G042900 Sobic001G179500--Sobic001G129150 Sobic001G179500--Sobic005G049900 Sobic001G179500--Sobic005G161400 Sobic001G179500--Sobic006G042900 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic001G179500--Sobic002G298201 Sobic001G179500--Sobic005G147900 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G179500--Sobic009G125100 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic001G179500--Sobic002G027901 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic001G179500--Sobic006G232700 Sobic003G431800--Sobic001G129150 Sobic003G431800--Sobic005G049900 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic003G431800--Sobic002G192800 Sobic003G431800--Sobic002G261400 Sobic003G431800--Sobic005G147900 Sobic003G431800--Sobic006G016800 Sobic003G431800--Sobic001G136150 Sobic002G034200 Sobic002G034200 Sobic003G431800--Sobic002G034200 Sobic003G431800--Sobic005G161400 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic010G232300--Sobic001G034200 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic010G232300--Sobic002G080450 Sobic003G127900 Sobic003G127900 Sobic010G232300--Sobic003G127900 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic010G232300--Sobic003G065700 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic010G232300--Sobic007G112832 Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic010G232300--Sobic008G056800 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic010G232300--Sobic010G129450 Sobic010G232300--Sobic003G218000 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic010G232300--Sobic005G052400 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic005G077600--Sobic009G049701 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic005G077600--Sobic007G057201 Sobic005G077600--Sobic003G127900 Sobic005G077600--Sobic003G065700 Sobic005G077600--Sobic001G129150 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic005G077600--Sobic001G386900 Sobic005G077600--Sobic002G298201 Sobic005G077600--Sobic006G232700 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic005G077600--Sobic003G317000 Sobic005G161400--Sobic002G261400 Sobic005G161400--Sobic005G147900 Sobic005G161400--Sobic001G129150 Sobic005G161400--Sobic006G232700 Sobic005G161400--Sobic006G016800 Sobic005G161400--Sobic001G136150 Sobic005G161400--Sobic002G034200 Sobic005G161400--Sobic010G074000 Sobic005G161400--Sobic002G298201 Sobic005G049900--Sobic002G298201 Sobic005G049900--Sobic005G147900 Sobic005G049900--Sobic002G034200 Sobic005G049900--Sobic003G317000 Sobic005G049900--Sobic001G136150 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic005G049900--Sobic001G196400 Sobic006G238500 Sobic006G238500 Sobic005G049900--Sobic006G238500 Sobic005G049900--Sobic002G261400 Sobic005G049900--Sobic006G016800 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic001G370200--Sobic010G030500 Sobic001G370200--Sobic005G147900 Sobic001G370200--Sobic001G129150 Sobic001G370200--Sobic006G016800 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic001G370200--Sobic008G052800 Sobic001G370200--Sobic005G049900 Sobic001G370200--Sobic006G232700 Sobic001G370200--Sobic002G261400 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic001G370200--Sobic007G185801 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic003G218000--Sobic001G136000 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic003G218000--Sobic007G128000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic003G218000--Sobic001G417700 Sobic003G218000--Sobic002G080450 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic003G218000--Sobic002G099700 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic003G218000--Sobic009G048700 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic003G218000--Sobic008G056600 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic003G218000--Sobic004G020200 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic003G218000--Sobic007G094700
Octagon: transcription factors


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