Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G218000.1
Synonym Sb03g027680
Functional annotation ENT domain containing protein, expressed
UniProt C5XQZ5
Pfam PF05641 PF03735
Panther DB PTHR31917 PTHR31917:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G20030 : Plant Tudor-like RNA-binding protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g11000.1 : agenet domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038486 , Zm00025a038487
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G218000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G136000 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
2 Sobic.007G128000 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
4 Sobic.002G080450 - -
5 Sobic.002G099700 OsFBX195 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G048700 expressed protein -
7 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G020200 expressed protein -
9 Sobic.007G094700 - -
10 Sobic.010G129450 - -
11 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
12 Sobic.002G101600 - -
13 Sobic.002G418300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -
14 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
16 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
17 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
18 Sobic.008G029800 expressed protein -
19 Sobic.003G133600 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
20 Sobic.007G219601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic003G218000--Sobic001G136000 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic003G218000--Sobic007G128000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic003G218000--Sobic001G417700 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic003G218000--Sobic002G080450 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic003G218000--Sobic002G099700 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic003G218000--Sobic009G048700 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic003G218000--Sobic008G056600 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic003G218000--Sobic004G020200 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic003G218000--Sobic007G094700 Sobic001G136000--Sobic007G128000 Sobic001G136000--Sobic001G417700 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic001G136000--Sobic009G060100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic001G136000--Sobic010G129450 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic001G136000--Sobic002G101600 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic001G136000--Sobic006G266400 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic001G136000--Sobic007G082100 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic001G136000--Sobic007G081100 Sobic001G240600 Sobic001G240600 Sobic001G136000--Sobic001G240600 Sobic007G128000--Sobic001G136000 Sobic007G128000--Sobic001G417700 Sobic007G128000--Sobic001G240600 Sobic007G128000--Sobic006G266400 Sobic007G128000--Sobic002G101600 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic007G128000--Sobic003G070400 Sobic009G250300 Sobic009G250300 Sobic007G128000--Sobic009G250300 Sobic007G128000--Sobic007G081100 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic007G128000--Sobic002G189500 Sobic001G417700--Sobic007G128000 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic001G417700--Sobic002G418300 Sobic001G417700--Sobic007G094700 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic001G417700--Sobic009G145000 Sobic001G417700--Sobic002G101600 Sobic001G417700--Sobic006G266400 Sobic001G417700--Sobic001G136000 Sobic001G417700--Sobic002G189500 Sobic001G417700--Sobic001G240600 Sobic002G080450--Sobic001G136000 Sobic002G080450--Sobic009G060100 Sobic002G080450--Sobic007G128000 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic002G080450--Sobic008G029800 Sobic002G080450--Sobic007G082100 Sobic002G080450--Sobic002G099700 Sobic002G123300 Sobic002G123300 Sobic002G080450--Sobic002G123300 Sobic002G080450--Sobic010G129450 Sobic002G080450--Sobic001G417700 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic002G099700--Sobic002G304801 Sobic002G099700--Sobic001G136000 Sobic002G099700--Sobic002G080450 Sobic002G099700--Sobic009G060100 Sobic002G099700--Sobic010G129450 Sobic002G099700--Sobic007G128000 Sobic002G099700--Sobic007G081100 Sobic002G099700--Sobic007G082100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G099700--Sobic004G168200 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic009G048700--Sobic009G008000 Sobic009G048700--Sobic001G417700 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic009G145000 Sobic009G048700--Sobic007G094700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic009G048700--Sobic006G199500 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic002G418300 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic009G048700--Sobic007G219601 Sobic008G056600--Sobic002G418300 Sobic008G056600--Sobic001G417700 Sobic008G056600--Sobic007G094700 Sobic008G056600--Sobic002G101600 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic008G056600--Sobic001G029300 Sobic008G056600--Sobic009G048700 Sobic008G056600--Sobic006G266400 Sobic008G056600--Sobic007G128000 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic008G056600--Sobic003G133600 Sobic004G020200--Sobic001G417700 Sobic004G020200--Sobic009G008000 Sobic004G020200--Sobic007G094700 Sobic004G020200--Sobic009G048700 Sobic004G020200--Sobic007G219601 Sobic004G020200--Sobic001G136000 Sobic004G020200--Sobic008G155700 Sobic004G020200--Sobic002G418300 Sobic004G020200--Sobic009G145000 Sobic007G094700--Sobic004G203150 Sobic007G094700--Sobic007G219601 Sobic007G094700--Sobic003G133600 Sobic007G094700--Sobic002G418300 Sobic007G094700--Sobic001G417700 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic007G094700--Sobic004G328200 Sobic007G094700--Sobic008G155700 Sobic007G094700--Sobic009G008000 Sobic007G094700--Sobic001G029300
Octagon: transcription factors


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