Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G316100.2
Synonym Sb02g034520
Functional annotation zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W6H0
Pfam PF01529
Panther DB PTHR22883 PTHR22883:SF57
NCBI CDD KOG1311; DHHC-type Zn-finger proteins
KEGG Orthology K16675; palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G26935 : DHHC-type zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g42620.1 : zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
2 Sobic.003G211233 - -
3 Sobic.008G008000 expressed protein -
4 Sobic.003G079532 - -
5 Sobic.005G198800 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G189500 expressed protein -
7 Sobic.007G220150 - -
8 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
9 Sobic.005G037600 - -
10 Sobic.006G266400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G019200 - -
12 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
13 Sobic.009G244100 - -
14 Sobic.002G060101 - -
15 Sobic.007G074300 MATE efflux family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G054900 expressed protein -
17 Sobic.001G029300 anthranilate synthase component I-1, chloroplast precursor, putative, expressed K01657: anthranilate synthase component I
18 Sobic.004G190400 expressed protein -
19 Sobic.006G238500 coatomer subunit epsilon, putative, expressed K17268: coatomer subunit epsilon
20 Sobic.006G016800 OsSigP3 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G316100 Sobic002G316100 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic002G316100--Sobic002G243400 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic002G316100--Sobic003G211233 Sobic008G008000 Sobic008G008000 Sobic002G316100--Sobic008G008000 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic002G316100--Sobic003G079532 Sobic005G198800 Sobic005G198800 Sobic002G316100--Sobic005G198800 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic002G316100--Sobic002G189500 Sobic007G220150 Sobic007G220150 Sobic002G316100--Sobic007G220150 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic002G316100--Sobic009G145000 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic002G316100--Sobic005G037600 Sobic002G243400--Sobic009G145000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic002G243400--Sobic001G417700 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic002G243400--Sobic009G048700 Sobic002G243400--Sobic002G189500 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic002G243400--Sobic010G061600 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic002G243400--Sobic009G008000 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic002G243400--Sobic009G002100 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic002G243400--Sobic002G418300 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic002G243400--Sobic004G190400 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic003G211233--Sobic002G193200 Sobic003G211233--Sobic003G079532 Sobic003G211233--Sobic008G008000 Sobic003G211233--Sobic005G198800 Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic003G211233--Sobic008G019200 Sobic009G044100 Sobic009G044100 Sobic003G211233--Sobic009G044100 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic003G211233--Sobic009G244100 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic003G211233--Sobic003G064100 Sobic002G280950 Sobic002G280950 Sobic003G211233--Sobic002G280950 Sobic008G008000--Sobic005G198800 Sobic008G008000--Sobic009G244100 Sobic006G238500 Sobic006G238500 Sobic008G008000--Sobic006G238500 Sobic004G054900 Sobic004G054900 Sobic008G008000--Sobic004G054900 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic008G008000--Sobic005G204600 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic008G008000--Sobic009G110700 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic008G008000--Sobic001G435300 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic008G008000--Sobic009G061601 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic008G008000--Sobic001G392650 Sobic003G079532--Sobic003G211233 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic003G079532--Sobic002G359100 Sobic003G079532--Sobic002G193200 Sobic003G079532--Sobic007G220150 Sobic003G079532--Sobic008G019200 Sobic010G140100 Sobic010G140100 Sobic003G079532--Sobic010G140100 Sobic003G079532--Sobic002G316100 Sobic004G210300 Sobic004G210300 Sobic003G079532--Sobic004G210300 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic003G079532--Sobic008G191900 Sobic005G198800--Sobic009G244100 Sobic005G198800--Sobic004G054900 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic005G198800--Sobic008G024200 Sobic005G198800--Sobic009G110700 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic005G198800--Sobic009G047100 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic005G198800--Sobic010G121700 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic005G198800--Sobic005G189100 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic005G198800--Sobic002G006200 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic005G198800--Sobic008G138400 Sobic002G189500--Sobic004G190400 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic002G189500--Sobic006G266400 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic002G189500--Sobic001G029300 Sobic010G242600 Sobic010G242600 Sobic002G189500--Sobic010G242600 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic002G189500--Sobic001G163666 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic002G189500--Sobic002G101600 Sobic002G189500--Sobic009G145000 Sobic001G240600 Sobic001G240600 Sobic002G189500--Sobic001G240600 Sobic010G177200 Sobic010G177200 Sobic002G189500--Sobic010G177200 Sobic007G220150--Sobic010G140100 Sobic007G220150--Sobic008G019200 Sobic001G479700 Sobic001G479700 Sobic007G220150--Sobic001G479700 Sobic001G278100 Sobic001G278100 Sobic007G220150--Sobic001G278100 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic007G220150--Sobic003G243300 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic007G220150--Sobic001G366700 Sobic001G045400 Sobic001G045400 Sobic007G220150--Sobic001G045400 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic007G220150--Sobic001G529800 Sobic003G114900 Sobic003G114900 Sobic007G220150--Sobic003G114900 Sobic009G145000--Sobic002G189500 Sobic009G145000--Sobic001G417700 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic009G145000--Sobic004G328200 Sobic009G145000--Sobic001G029300 Sobic009G145000--Sobic006G266400 Sobic009G145000--Sobic004G190400 Sobic009G145000--Sobic009G008000 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic009G145000--Sobic004G203150 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic009G145000--Sobic007G094700 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic005G037600--Sobic002G060101 Sobic005G037600--Sobic006G266400 Sobic005G037600--Sobic002G189500 Sobic002G333001 Sobic002G333001 Sobic005G037600--Sobic002G333001 Sobic005G037600--Sobic004G190400 Sobic005G037600--Sobic002G101600 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic005G037600--Sobic007G081100 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic005G037600--Sobic009G068400 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic005G037600--Sobic003G070400
Octagon: transcription factors


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