Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G019200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PAV4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G335700 ATCHX15, putative, expressed -
2 Sobic.003G317600 NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative, expressed K17871: NADH:ubiquinone reductase (non-electrogenic)
3 Sobic.003G175000 respiratory burst oxidase, putative, expressed -
4 Sobic.003G178000 pectinesterase, putative, expressed -
5 Sobic.009G260900 expressed protein -
6 Sobic.009G158400 - -
7 Sobic.010G229801 - -
8 Sobic.003G127200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed -
9 Sobic.003G445600 KIP1, putative, expressed -
10 Sobic.007G175800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
11 Sobic.010G093600 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
12 Sobic.007G220150 - -
13 Sobic.001G037066 - -
14 Sobic.009G158300 - -
15 Sobic.001G278100 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.009G096700 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
17 Sobic.009G016700 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
18 Sobic.008G028200 pollen allergen, putative, expressed -
19 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
20 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic003G335700 Sobic003G335700 Sobic008G019200--Sobic003G335700 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic008G019200--Sobic003G317600 Sobic003G175000 Sobic003G175000 Sobic008G019200--Sobic003G175000 Sobic003G178000 Sobic003G178000 Sobic008G019200--Sobic003G178000 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic008G019200--Sobic009G260900 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic008G019200--Sobic009G158400 Sobic010G229801 Sobic010G229801 Sobic008G019200--Sobic010G229801 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic008G019200--Sobic003G127200 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic008G019200--Sobic003G445600 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G335700--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G335700--Sobic003G061700 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic003G335700--Sobic005G010000 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic003G335700--Sobic008G186900 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic003G335700--Sobic004G251900 Sobic003G335700--Sobic003G127200 Sobic003G335700--Sobic003G178000 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic003G335700--Sobic003G173800 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic003G335700--Sobic010G161400 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic003G317600--Sobic007G175800 Sobic006G282000 Sobic006G282000 Sobic003G317600--Sobic006G282000 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic003G317600--Sobic008G119501 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic003G317600--Sobic003G164700 Sobic003G317600--Sobic010G229801 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic003G317600--Sobic003G335200 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic003G317600--Sobic001G228000 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic003G317600--Sobic001G348600 Sobic001G024800 Sobic001G024800 Sobic003G317600--Sobic001G024800 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic003G175000--Sobic002G254700 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic003G175000--Sobic001G528700 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic003G175000--Sobic009G102700 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic003G175000--Sobic007G222500 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic003G175000--Sobic004G166100 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic003G175000--Sobic001G252900 Sobic003G175000--Sobic001G348600 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic003G175000--Sobic010G252600 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic003G175000--Sobic007G057600 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic003G178000--Sobic002G351500 Sobic003G178000--Sobic003G061700 Sobic003G178000--Sobic008G186900 Sobic003G178000--Sobic007G100800 Sobic003G178000--Sobic003G127200 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic003G178000--Sobic004G294200 Sobic003G178000--Sobic003G164700 Sobic009G216400 Sobic009G216400 Sobic003G178000--Sobic009G216400 Sobic009G177300 Sobic009G177300 Sobic003G178000--Sobic009G177300 Sobic009G260900--Sobic003G127200 Sobic009G260900--Sobic007G100800 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic009G260900--Sobic008G028300 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G260900--Sobic002G002600 Sobic009G260900--Sobic010G161400 Sobic009G260900--Sobic008G186900 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic009G260900--Sobic001G002200 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic009G260900--Sobic008G028100 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G260900--Sobic001G539700 Sobic009G158400--Sobic009G102700 Sobic009G158400--Sobic004G166100 Sobic009G158400--Sobic009G260900 Sobic009G158400--Sobic001G528700 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G158400--Sobic004G025500 Sobic009G158400--Sobic003G127200 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic009G158400--Sobic004G024000 Sobic009G158400--Sobic007G175800 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic009G158400--Sobic004G071900 Sobic006G171500 Sobic006G171500 Sobic010G229801--Sobic006G171500 Sobic010G229801--Sobic008G119501 Sobic002G150400 Sobic002G150400 Sobic010G229801--Sobic002G150400 Sobic010G229801--Sobic001G348600 Sobic010G229801--Sobic001G024800 Sobic010G229801--Sobic006G282000 Sobic004G029032 Sobic004G029032 Sobic010G229801--Sobic004G029032 Sobic010G229801--Sobic001G228000 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic010G229801--Sobic008G028200 Sobic003G127200--Sobic002G002600 Sobic003G127200--Sobic007G100800 Sobic003G127200--Sobic008G028300 Sobic003G127200--Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic008G186900 Sobic003G127200--Sobic010G161400 Sobic003G127200--Sobic003G061700 Sobic003G127200--Sobic001G002200 Sobic003G127200--Sobic001G539700 Sobic002G303500 Sobic002G303500 Sobic003G445600--Sobic002G303500 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic003G445600--Sobic009G016900 Sobic003G445600--Sobic006G282000 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic003G445600--Sobic001G097000 Sobic003G445600--Sobic010G229801 Sobic003G445600--Sobic003G317600 Sobic004G242600 Sobic004G242600 Sobic003G445600--Sobic004G242600 Sobic003G445600--Sobic007G175800 Sobic004G134600 Sobic004G134600 Sobic003G445600--Sobic004G134600
Octagon: transcription factors


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