Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G008000.1,Sobic.008G008000.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PB41 , A0A1Z5R577
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g52660.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G198800 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G244100 - -
3 Sobic.006G238500 coatomer subunit epsilon, putative, expressed K17268: coatomer subunit epsilon
4 Sobic.004G054900 expressed protein -
5 Sobic.005G204600 OsMADS68 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -
6 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G061601 - -
9 Sobic.001G392650 - -
10 Sobic.005G112500 - -
11 Sobic.001G212500 vacuolar protein sorting-associated protein 52, putative, expressed -
12 Sobic.009G110333 - -
13 Sobic.004G308800 expressed protein -
14 Sobic.001G294500 phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, chloroplast precursor, putative, expressed K01626: E2.5.1.54, aroF, aroG, 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase
15 Sobic.001G366700 villin protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G019200 - -
17 Sobic.008G020800 GASR10 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
18 Sobic.006G164800 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
19 Sobic.003G320000 expressed protein -
20 Sobic.001G063300 CAMK_CAMK_like.23 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase


Gene co-expression network
sample Sobic008G008000 Sobic008G008000 Sobic005G198800 Sobic005G198800 Sobic008G008000--Sobic005G198800 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic008G008000--Sobic009G244100 Sobic006G238500 Sobic006G238500 Sobic008G008000--Sobic006G238500 Sobic004G054900 Sobic004G054900 Sobic008G008000--Sobic004G054900 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic008G008000--Sobic005G204600 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic008G008000--Sobic009G110700 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic008G008000--Sobic001G435300 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic008G008000--Sobic009G061601 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic008G008000--Sobic001G392650 Sobic005G198800--Sobic009G244100 Sobic005G198800--Sobic004G054900 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic005G198800--Sobic008G024200 Sobic005G198800--Sobic009G110700 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic005G198800--Sobic009G047100 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic005G198800--Sobic010G121700 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic005G198800--Sobic005G189100 Sobic002G006200 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