Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G232300.1
Synonym Sb10g027480
Functional annotation ubiquitin family protein, expressed
UniProt C5Z862
Pfam PF00240
Panther DB PTHR10621
NCBI CDD KOG0005; Ubiquitin-like protein KOG0001Ubiquitin and ubiquitin-like proteins
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G05230 : Ubiquitin-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g17840.1 : ubiquitin family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018138
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCSU02G215700 , TraesCSU02G256600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G034200 60S ribosomal protein L36-2, putative, expressed K02920: RP-L36e, large subunit ribosomal protein L36e
2 Sobic.002G080450 - -
3 Sobic.003G127900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G065700 expressed protein -
5 Sobic.007G112832 - -
6 Sobic.008G056800 expressed protein -
7 Sobic.010G129450 - -
8 Sobic.003G218000 ENT domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G052400 - -
10 Sobic.010G064200 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
11 Sobic.010G263700 expressed protein -
12 Sobic.008G029800 expressed protein -
13 Sobic.001G136000 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
14 Sobic.009G246600 - -
15 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
16 Sobic.004G168900 elongation factor Tu family protein, putative, expressed K14536: ribosome assembly protein 1
17 Sobic.010G266600 calcium-dependent protein kinase CPK1 adapter protein 2, putative, expressed -
18 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
19 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G428500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G232300 Sobic010G232300 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic010G232300--Sobic001G034200 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic010G232300--Sobic002G080450 Sobic003G127900 Sobic003G127900 Sobic010G232300--Sobic003G127900 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic010G232300--Sobic003G065700 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic010G232300--Sobic007G112832 Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic010G232300--Sobic008G056800 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic010G232300--Sobic010G129450 Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic010G232300--Sobic003G218000 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic010G232300--Sobic005G052400 Sobic001G034200--Sobic002G080450 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic001G034200--Sobic010G266600 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic001G034200--Sobic010G038300 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic001G034200--Sobic004G168900 Sobic002G123300 Sobic002G123300 Sobic001G034200--Sobic002G123300 Sobic001G034200--Sobic010G129450 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic001G034200--Sobic007G063800 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic001G034200--Sobic005G202901 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic001G034200--Sobic001G136000 Sobic002G080450--Sobic001G136000 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G080450--Sobic009G060100 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G080450--Sobic007G128000 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic002G080450--Sobic008G029800 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G080450--Sobic007G082100 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic002G080450--Sobic002G099700 Sobic002G080450--Sobic002G123300 Sobic002G080450--Sobic010G129450 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic002G080450--Sobic001G417700 Sobic002G295300 Sobic002G295300 Sobic003G127900--Sobic002G295300 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic003G127900--Sobic001G386900 Sobic003G127900--Sobic007G112832 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic003G127900--Sobic001G538425 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic003G127900--Sobic010G196700 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic003G127900--Sobic004G003300 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic003G127900--Sobic008G168500 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic003G127900--Sobic003G428500 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic003G127900--Sobic008G088500 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic003G065700--Sobic009G049701 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic003G065700--Sobic001G024100 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic003G065700--Sobic004G020200 Sobic003G065700--Sobic003G127900 Sobic003G065700--Sobic002G295300 Sobic003G065700--Sobic010G232300 Sobic003G065700--Sobic001G136000 Sobic003G065700--Sobic008G029800 Sobic005G077600 Sobic005G077600 Sobic003G065700--Sobic005G077600 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic007G112832--Sobic007G209900 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G112832--Sobic001G196400 Sobic007G112832--Sobic001G386900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic007G112832--Sobic006G232700 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic007G112832--Sobic001G435300 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic007G112832--Sobic005G077001 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic007G112832--Sobic005G058600 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G112832--Sobic003G317000 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic007G112832--Sobic003G133201 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic008G056800--Sobic002G304801 Sobic008G056800--Sobic003G428500 Sobic008G056800--Sobic002G099700 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G056800--Sobic001G021200 Sobic008G056800--Sobic008G168500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic008G056800--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic008G056800--Sobic005G058000 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic008G056800--Sobic002G014300 Sobic008G056800--Sobic008G088500 Sobic010G129450--Sobic009G060100 Sobic010G129450--Sobic001G136000 Sobic010G129450--Sobic005G058600 Sobic010G129450--Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic003G133201 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic010G129450--Sobic003G191200 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic010G129450--Sobic010G123800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic010G129450--Sobic005G058300 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic010G129450--Sobic007G081100 Sobic003G218000--Sobic001G136000 Sobic003G218000--Sobic007G128000 Sobic003G218000--Sobic001G417700 Sobic003G218000--Sobic002G080450 Sobic003G218000--Sobic002G099700 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic003G218000--Sobic009G048700 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic003G218000--Sobic008G056600 Sobic003G218000--Sobic004G020200 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic003G218000--Sobic007G094700 Sobic005G052400--Sobic010G129450 Sobic005G052400--Sobic007G128000 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic005G052400--Sobic009G244100 Sobic005G052400--Sobic001G417700 Sobic005G052400--Sobic001G136000 Sobic004G277900 Sobic004G277900 Sobic005G052400--Sobic004G277900 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic005G052400--Sobic009G145000 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic005G052400--Sobic006G266400 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic005G052400--Sobic002G189500
Octagon: transcription factors


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