Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G438000.1
Synonym MGT4, Sb03g046843, MRS2-3
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q8D2
Pfam -
Panther DB PTHR13890 PTHR13890:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19640 : magnesium transporter 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68040.1 : CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G504600 - -
2 Sobic.005G224601 - -
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11 Sobic.010G081950 - -
12 Sobic.008G179400 expressed protein -
13 Sobic.002G310400 chalcone synthase, putative, expressed -
14 Sobic.001G324000 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G078600 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G366401 - -
17 Sobic.001G505033 - -
18 Sobic.001G035700 - -
19 Sobic.003G094900 tRNAHis guanylyltransferase family protein, expressed -
20 Sobic.004G238400 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G438000 Sobic003G438000 Sobic001G504600 Sobic001G504600 Sobic003G438000--Sobic001G504600 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic003G438000--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic003G438000--Sobic006G210233 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic003G438000--Sobic004G104250 Sobic010G268001 Sobic010G268001 Sobic003G438000--Sobic010G268001 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic003G438000--Sobic010G203400 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic003G438000--Sobic009G124100 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic003G438000--Sobic005G165950 Sobic006G061201 Sobic006G061201 Sobic003G438000--Sobic006G061201 Sobic001G504600--Sobic003G438000 Sobic001G504600--Sobic010G268001 Sobic001G504600--Sobic010G203400 Sobic001G504600--Sobic005G224601 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic001G504600--Sobic003G094900 Sobic001G504600--Sobic006G210233 Sobic001G504600--Sobic005G165950 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic001G504600--Sobic001G505033 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic001G504600--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic006G210233 Sobic005G224601--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic004G104250 Sobic005G224601--Sobic009G124100 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic001G505033 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic005G224601--Sobic001G324000 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic005G224601--Sobic010G081950 Sobic006G210233--Sobic005G224601 Sobic006G210233--Sobic005G165950 Sobic006G210233--Sobic006G089350 Sobic006G210233--Sobic008G179400 Sobic006G210233--Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic004G104250 Sobic006G210233--Sobic009G124100 Sobic006G210233--Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic005G165950 Sobic010G268001--Sobic003G438000 Sobic010G268001--Sobic001G504600 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic010G268001--Sobic008G122250 Sobic010G268001--Sobic002G310400 Sobic004G270750 Sobic004G270750 Sobic010G268001--Sobic004G270750 Sobic010G268001--Sobic004G104250 Sobic002G070901 Sobic002G070901 Sobic010G268001--Sobic002G070901 Sobic001G366401 Sobic001G366401 Sobic010G268001--Sobic001G366401 Sobic001G020350 Sobic001G020350 Sobic010G268001--Sobic001G020350 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic010G203400--Sobic003G327950 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic010G203400--Sobic005G078600 Sobic010G203400--Sobic003G094900 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic010G203400--Sobic009G131032 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic010G203400--Sobic003G271100 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic010G203400--Sobic006G219400 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic010G203400--Sobic001G397550 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic010G203400--Sobic004G224733 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic010G203400--Sobic002G395400 Sobic009G124100--Sobic004G104250 Sobic009G124100--Sobic010G081950 Sobic009G124100--Sobic001G035700 Sobic009G124100--Sobic002G310400 Sobic009G124100--Sobic006G089350 Sobic009G124100--Sobic005G224601 Sobic009G124100--Sobic006G210233 Sobic009G124100--Sobic001G488800 Sobic009G124100--Sobic005G165950 Sobic005G165950--Sobic006G210233 Sobic005G165950--Sobic005G224601 Sobic005G165950--Sobic006G089350 Sobic005G165950--Sobic008G179400 Sobic005G165950--Sobic001G505033 Sobic005G165950--Sobic009G124100 Sobic005G165950--Sobic004G104250 Sobic005G165950--Sobic001G324000 Sobic005G165950--Sobic010G081950 Sobic006G061201--Sobic005G078600 Sobic006G061201--Sobic001G366401 Sobic006G061201--Sobic003G438000 Sobic001G089850 Sobic001G089850 Sobic006G061201--Sobic001G089850 Sobic006G061201--Sobic010G203400 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic006G061201--Sobic004G175800 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic006G061201--Sobic004G080901 Sobic006G061201--Sobic005G224601 Sobic006G061201--Sobic008G179400
Octagon: transcription factors


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