Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G268001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VV31
Pfam -
Panther DB PTHR37194
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G47820 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g50350.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G438000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G504600 - -
3 Sobic.008G122250 - -
4 Sobic.002G310400 chalcone synthase, putative, expressed -
5 Sobic.004G270750 - -
6 Sobic.004G104250 - -
7 Sobic.002G070901 - -
8 Sobic.001G366401 - -
9 Sobic.001G020350 - -
10 Sobic.010G081950 - -
11 Sobic.005G031200 - -
12 Sobic.009G124100 - -
13 Sobic.010G124400 - -
14 Sobic.001G331401 - -
15 Sobic.004G024350 - -
16 Sobic.003G081200 expressed protein -
17 Sobic.009G147450 - -
18 Sobic.010G018200 expressed protein -
19 Sobic.007G089400 - -
20 Sobic.003G284900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G268001 Sobic010G268001 Sobic003G438000 Sobic003G438000 Sobic010G268001--Sobic003G438000 Sobic001G504600 Sobic001G504600 Sobic010G268001--Sobic001G504600 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic010G268001--Sobic008G122250 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic010G268001--Sobic002G310400 Sobic004G270750 Sobic004G270750 Sobic010G268001--Sobic004G270750 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic010G268001--Sobic004G104250 Sobic002G070901 Sobic002G070901 Sobic010G268001--Sobic002G070901 Sobic001G366401 Sobic001G366401 Sobic010G268001--Sobic001G366401 Sobic001G020350 Sobic001G020350 Sobic010G268001--Sobic001G020350 Sobic003G438000--Sobic001G504600 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic003G438000--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic003G438000--Sobic006G210233 Sobic003G438000--Sobic004G104250 Sobic003G438000--Sobic010G268001 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic003G438000--Sobic010G203400 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic003G438000--Sobic009G124100 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic003G438000--Sobic005G165950 Sobic006G061201 Sobic006G061201 Sobic003G438000--Sobic006G061201 Sobic001G504600--Sobic003G438000 Sobic001G504600--Sobic010G268001 Sobic001G504600--Sobic010G203400 Sobic001G504600--Sobic005G224601 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic001G504600--Sobic003G094900 Sobic001G504600--Sobic006G210233 Sobic001G504600--Sobic005G165950 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic001G504600--Sobic001G505033 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic001G504600--Sobic008G179400 Sobic010G124400 Sobic010G124400 Sobic008G122250--Sobic010G124400 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic008G122250--Sobic005G119250 Sobic008G122250--Sobic001G020350 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic008G122250--Sobic002G190600 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic008G122250--Sobic005G065050 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic008G122250--Sobic001G505066 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic008G122250--Sobic009G147450 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic008G122250--Sobic007G202360 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic008G122250--Sobic010G018200 Sobic002G310400--Sobic004G104250 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic002G310400--Sobic010G081950 Sobic001G331401 Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic009G124100 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic002G310400--Sobic004G024350 Sobic002G310400--Sobic009G147450 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic002G310400--Sobic001G488800 Sobic002G310400--Sobic010G018200 Sobic002G310400--Sobic005G065050 Sobic004G270750--Sobic001G020350 Sobic003G375400 Sobic003G375400 Sobic004G270750--Sobic003G375400 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic004G270750--Sobic009G236900 Sobic004G270750--Sobic008G122250 Sobic009G020200 Sobic009G020200 Sobic004G270750--Sobic009G020200 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic004G270750--Sobic002G232300 Sobic009G175800 Sobic009G175800 Sobic004G270750--Sobic009G175800 Sobic006G172100 Sobic006G172100 Sobic004G270750--Sobic006G172100 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic004G270750--Sobic003G330350 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic005G165950 Sobic002G070901--Sobic003G438000 Sobic002G070901--Sobic010G268001 Sobic005G057401 Sobic005G057401 Sobic002G070901--Sobic005G057401 Sobic002G070901--Sobic004G270750 Sobic002G070901--Sobic008G122250 Sobic002G070901--Sobic009G020200 Sobic002G070901--Sobic001G020350 Sobic002G070901--Sobic010G124400 Sobic010G046601 Sobic010G046601 Sobic002G070901--Sobic010G046601 Sobic001G366401--Sobic006G061201 Sobic001G366401--Sobic001G035700 Sobic001G366401--Sobic002G310400 Sobic001G366401--Sobic004G104250 Sobic003G192900 Sobic003G192900 Sobic001G366401--Sobic003G192900 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic001G366401--Sobic003G081200 Sobic001G366401--Sobic010G081950 Sobic001G366401--Sobic003G375400 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic001G366401--Sobic010G172633 Sobic001G020350--Sobic002G232300 Sobic001G020350--Sobic005G119250 Sobic001G020350--Sobic008G122250 Sobic001G020350--Sobic002G190600 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic001G020350--Sobic008G007500 Sobic001G020350--Sobic010G018200 Sobic001G020350--Sobic009G147450 Sobic001G020350--Sobic005G065050 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic001G020350--Sobic008G029000
Octagon: transcription factors


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