Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G504600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QQI6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G438000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G268001 - -
3 Sobic.010G203400 - -
4 Sobic.005G224601 - -
5 Sobic.003G094900 tRNAHis guanylyltransferase family protein, expressed -
6 Sobic.006G210233 - -
7 Sobic.005G165950 - -
8 Sobic.001G505033 - -
9 Sobic.008G179400 expressed protein -
10 Sobic.006G061201 - -
11 Sobic.009G124100 - -
12 Sobic.004G104250 - -
13 Sobic.003G409150 - -
14 Sobic.001G324000 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G089350 - -
16 Sobic.010G081950 - -
17 Sobic.004G175800 chalcone synthase, putative, expressed -
18 Sobic.005G078600 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G131032 - -
20 Sobic.002G395400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G504600 Sobic001G504600 Sobic003G438000 Sobic003G438000 Sobic001G504600--Sobic003G438000 Sobic010G268001 Sobic010G268001 Sobic001G504600--Sobic010G268001 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic001G504600--Sobic010G203400 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic001G504600--Sobic005G224601 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic001G504600--Sobic003G094900 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic001G504600--Sobic006G210233 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic001G504600--Sobic005G165950 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic001G504600--Sobic001G505033 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic001G504600--Sobic008G179400 Sobic003G438000--Sobic001G504600 Sobic003G438000--Sobic005G224601 Sobic003G438000--Sobic006G210233 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic003G438000--Sobic004G104250 Sobic003G438000--Sobic010G268001 Sobic003G438000--Sobic010G203400 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic003G438000--Sobic009G124100 Sobic003G438000--Sobic005G165950 Sobic006G061201 Sobic006G061201 Sobic003G438000--Sobic006G061201 Sobic010G268001--Sobic003G438000 Sobic010G268001--Sobic001G504600 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic010G268001--Sobic008G122250 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic010G268001--Sobic002G310400 Sobic004G270750 Sobic004G270750 Sobic010G268001--Sobic004G270750 Sobic010G268001--Sobic004G104250 Sobic002G070901 Sobic002G070901 Sobic010G268001--Sobic002G070901 Sobic001G366401 Sobic001G366401 Sobic010G268001--Sobic001G366401 Sobic001G020350 Sobic001G020350 Sobic010G268001--Sobic001G020350 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic010G203400--Sobic003G327950 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic010G203400--Sobic005G078600 Sobic010G203400--Sobic003G094900 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic010G203400--Sobic009G131032 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic010G203400--Sobic003G271100 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic010G203400--Sobic006G219400 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic010G203400--Sobic001G397550 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic010G203400--Sobic004G224733 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic010G203400--Sobic002G395400 Sobic005G224601--Sobic006G210233 Sobic005G224601--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic004G104250 Sobic005G224601--Sobic009G124100 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic001G505033 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic005G224601--Sobic001G324000 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic005G224601--Sobic010G081950 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic003G094900--Sobic002G071201 Sobic003G094900--Sobic010G203400 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic003G094900--Sobic004G175800 Sobic003G094900--Sobic001G505033 Sobic003G094900--Sobic002G395400 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic003G094900--Sobic006G090450 Sobic003G094900--Sobic008G179400 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic003G094900--Sobic008G142450 Sobic003G094900--Sobic003G327950 Sobic006G210233--Sobic005G224601 Sobic006G210233--Sobic005G165950 Sobic006G210233--Sobic006G089350 Sobic006G210233--Sobic008G179400 Sobic006G210233--Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic004G104250 Sobic006G210233--Sobic009G124100 Sobic006G210233--Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic010G081950 Sobic005G165950--Sobic006G210233 Sobic005G165950--Sobic005G224601 Sobic005G165950--Sobic006G089350 Sobic005G165950--Sobic008G179400 Sobic005G165950--Sobic001G505033 Sobic005G165950--Sobic009G124100 Sobic005G165950--Sobic004G104250 Sobic005G165950--Sobic001G324000 Sobic005G165950--Sobic010G081950 Sobic001G505033--Sobic008G179400 Sobic001G505033--Sobic006G210233 Sobic001G505033--Sobic005G224601 Sobic001G505033--Sobic005G165950 Sobic001G505033--Sobic004G175800 Sobic001G505033--Sobic001G324000 Sobic001G505033--Sobic003G094900 Sobic001G505033--Sobic002G071201 Sobic001G505033--Sobic009G131032 Sobic008G179400--Sobic004G175800 Sobic008G179400--Sobic001G505033 Sobic008G179400--Sobic006G210233 Sobic008G179400--Sobic005G224601 Sobic008G179400--Sobic005G165950 Sobic008G179400--Sobic001G324000 Sobic008G179400--Sobic002G395400 Sobic008G179400--Sobic003G094900 Sobic008G179400--Sobic006G089350
Octagon: transcription factors


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