Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G238400.1
Synonym Sb04g028040
Functional annotation RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RPV3
Pfam PF02042
Panther DB PTHR10270 PTHR10270:SF227
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18790 : RWP-RK domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g51090.1 : RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.003G116400 decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
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19 Sobic.005G171600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.002G395400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G238400 Sobic004G238400 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic004G238400--Sobic010G081950 Sobic003G409150 Sobic003G409150 Sobic004G238400--Sobic003G409150 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic004G238400--Sobic004G104250 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic004G238400--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic004G238400--Sobic006G210233 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic004G238400--Sobic009G124100 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic004G238400--Sobic006G089350 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic004G238400--Sobic005G165950 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic004G238400--Sobic002G310400 Sobic010G081950--Sobic004G104250 Sobic010G081950--Sobic009G124100 Sobic010G081950--Sobic002G310400 Sobic010G081950--Sobic006G089350 Sobic010G081950--Sobic005G224601 Sobic010G081950--Sobic004G238400 Sobic010G081950--Sobic006G210233 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic010G081950--Sobic001G035700 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic010G081950--Sobic001G488800 Sobic003G409150--Sobic004G238400 Sobic003G409150--Sobic005G224601 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic003G409150--Sobic001G505033 Sobic003G409150--Sobic006G210233 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic003G409150--Sobic008G179400 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic003G409150--Sobic003G094900 Sobic003G409150--Sobic005G165950 Sobic003G116400 Sobic003G116400 Sobic003G409150--Sobic003G116400 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic003G409150--Sobic004G175800 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic006G210233 Sobic005G224601--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic004G104250 Sobic005G224601--Sobic009G124100 Sobic005G224601--Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic001G505033 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic005G224601--Sobic001G324000 Sobic005G224601--Sobic010G081950 Sobic006G210233--Sobic005G224601 Sobic006G210233--Sobic005G165950 Sobic006G210233--Sobic006G089350 Sobic006G210233--Sobic008G179400 Sobic006G210233--Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic004G104250 Sobic006G210233--Sobic009G124100 Sobic006G210233--Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic010G081950 Sobic009G124100--Sobic004G104250 Sobic009G124100--Sobic010G081950 Sobic009G124100--Sobic001G035700 Sobic009G124100--Sobic002G310400 Sobic009G124100--Sobic006G089350 Sobic009G124100--Sobic005G224601 Sobic009G124100--Sobic006G210233 Sobic009G124100--Sobic001G488800 Sobic009G124100--Sobic005G165950 Sobic006G089350--Sobic006G210233 Sobic006G089350--Sobic005G165950 Sobic006G089350--Sobic004G104250 Sobic006G089350--Sobic009G124100 Sobic006G089350--Sobic005G224601 Sobic006G089350--Sobic010G081950 Sobic006G089350--Sobic002G310400 Sobic006G089350--Sobic008G179400 Sobic006G089350--Sobic001G488800 Sobic005G165950--Sobic006G210233 Sobic005G165950--Sobic005G224601 Sobic005G165950--Sobic006G089350 Sobic005G165950--Sobic008G179400 Sobic005G165950--Sobic001G505033 Sobic005G165950--Sobic009G124100 Sobic005G165950--Sobic004G104250 Sobic005G165950--Sobic001G324000 Sobic005G165950--Sobic010G081950 Sobic002G310400--Sobic004G104250 Sobic002G310400--Sobic010G081950 Sobic001G331401 Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic009G124100 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic002G310400--Sobic004G024350 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic002G310400--Sobic009G147450 Sobic002G310400--Sobic001G488800 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic002G310400--Sobic010G018200 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic002G310400--Sobic005G065050
Octagon: transcription factors


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